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8 | As_dCpf1_codon_opt_coli_gBlock_a | #N/A | 57 | JM_048_fwd | 60 | JM_051_rev | 64.3 (61.3/62.6) | 2061 | 0.43 | GCAGGTCTCGATCTATGACACAGTTCGAAGGCTTTACAAATTTGTATCAGGTTAGTAAAACTCTTCGTTTCGAATTGATTCCGCAAGGTAAAACCCTTAAGCATATTCAGGAACAGGGGTTTATCGAGGAAGATAAGGCTCGTAACGATCACTATAAAGAGCTGAAACCCATTATTGATCGCATCTATAAAACGTACGCGGATCAGTGCCTTCAACTGGTCCAGCTTGACTGGGAGAATTTGAGCGCGGCAATCGACAGCTATCGTAAAGAGAAAACAGAAGAAACCCGCAATGCTTTAATCGAGGAGCAGGCCACTTATCGCAATGCCATTCACGATTACTTTATCGGACGTACTGACAATCTTACCGATGCCATCAACAAGCGCCACGCCGAAATTTATAAGGGATTGTTTAAAGCGGAATTGTTCAATGGAAAAGTCCTGAAGCAACTTGGGACCGTTACTACTACAGAACACGAGAACGCATTACTTCGTAGCTTTGATAAGTTCACGACTTATTTCTCAGGTTTTTACGAGAACCGCAAAAACGTTTTCAGTGCCGAAGATATTTCCACCGCCATCCCCCACCGCATCGTACAGGACAATTTTCCGAAATTTAAGGAAAATTGCCACATTTTCACCCGTTTAATTACCGCTGTTCCCTCGCTGCGTGAGCATTTTGAAAATGTAAAAAAAGCTATTGGAATTTTCGTGTCCACTTCCATCGAAGAGGTGTTCAGTTTTCCGTTCTATAATCAGTTATTGACGCAGACACAGATTGATCTGTACAACCAGTTATTAGGTGGTATTAGTCGCGAAGCCGGTACCGAAAAGATCAAAGGACTTAACGAAGTCCTGAACTTAGCAATTCAAAAGAATGACGAGACAGCTCATATTATTGCGTCGCTTCCGCACCGTTTCATCCCGTTGTTTAAGCAAATTCTTTCGGACCGTAATACCTTAAGCTTCATTCTGGAGGAGTTCAAGAGTGATGAGGAAGTAATCCAGTCCTTTTGCAAGTATAAAACCCTGCTTCGCAATGAGAATGTGCTTGAAACTGCCGAGGCGTTATTCAATGAACTGAATAGCATTGATTTAACGCATATTTTTATTAGTCATAAGAAGCTTGAGACAATTTCCTCCGCGCTTTGTGACCACTGGGATACACTTCGCAACGCCTTATACGAACGCCGTATCTCAGAGCTTACGGGTAAGATTACCAAGTCTGCTAAAGAGAAAGTGCAGCGTTCCTTAAAGCACGAAGATATTAACTTACAGGAAATTATCAGCGCAGCGGGCAAGGAGCTGAGTGAGGCTTTTAAGCAGAAAACATCTGAGATTTTAAGCCACGCACACGCGGCGTTAGACCAACCGCTTCCTACCACCCTTAAGAAACAGGAAGAGAAAGAAATTTTAAAGTCGCAGTTGGACTCATTGCTTGGACTTTACCATTTGCTTGACTGGTTTGCCGTTGATGAGTCAAACGAAGTTGACCCTGAGTTTAGCGCCCGCTTAACCGGCATCAAGCTTGAGATGGAGCCGTCCCTGTCGTTCTACAATAAAGCCCGCAATTACGCTACAAAAAAGCCATATAGCGTAGAGAAGTTCAAGCTTAATTTCCAAATGCCGACTCTTGCGTCTGGTTGGGATGTGAATAAGGAGAAGAATAATGGAGCCATCCTGTTCGTGAAAAATGGTTTATACTATCTTGGTATTATGCCTAAGCAGAAAGGACGTTACAAAGCCTTGTCGTTTGAACCGACAGAAAAGACAAGCGAAGGTTTTGACAAGATGTACTATGACTACTTTCCAGACGCAGCTAAGATGATCCCAAAATGTTCCACGCAACTGAAGGCTGTGACCGCACACTTTCAGACGCATACTACCCCGATTTTGTTGAGTAATAACTTTATCGAACCATTGGAGATCACGAAAGAGATTTATGACTTGAATAATCCAGAGAAAGAACCCAAGAAGTTTCAAACCGCATACGCCAAGAAAACCGGGGATCAGAAAGGATATCGTGAGGCATTGTGCAAATGGATCGACTTTGAGACCACTC | FALSE | #N/A | #N/A | GCAGGTCTCGATCTATGACAC | 21 | TCTATGACAC | #N/A | #N/A | #N/A | #N/A | GCAGGTCTCGATCTATGACACAGTTCGAAGGCTTTACAAATTTGTATCAGGTTAGTAAAACTCTTCGTTTCGAATTGATTCCGCAAGGTAAAACCCTTAAGCATATTCAGGAACAGGGGTTTATCGAGGAAGATAAGGCTCGTAACGATCACTATAAAGAGCTGAAACCCATTATTGATCGCATCTATAAAACGTACGCGGATCAGTGCCTTCAACTGGTCCAGCTTGACTGGGAGAATTTGAGCGCGGCAATCGACAGCTATCGTAAAGAGAAAACAGAAGAAACCCGCAATGCTTTAATCGAGGAGCAGGCCACTTATCGCAATGCCATTCACGATTACTTTATCGGACGTACTGACAATCTTACCGATGCCATCAACAAGCGCCACGCCGAAATTTATAAGGGATTGTTTAAAGCGGAATTGTTCAATGGAAAAGTCCTGAAGCAACTTGGGACCGTTACTACTACAGAACACGAGAACGCATTACTTCGTAGCTTTGATAAGTTCACGACTTATTTCTCAGGTTTTTACGAGAACCGCAAAAACGTTTTCAGTGCCGAAGATATTTCCACCGCCATCCCCCACCGCATCGTACAGGACAATTTTCCGAAATTTAAGGAAAATTGCCACATTTTCACCCGTTTAATTACCGCTGTTCCCTCGCTGCGTGAGCATTTTGAAAATGTAAAAAAAGCTATTGGAATTTTCGTGTCCACTTCCATCGAAGAGGTGTTCAGTTTTCCGTTCTATAATCAGTTATTGACGCAGACACAGATTGATCTGTACAACCAGTTATTAGGTGGTATTAGTCGCGAAGCCGGTACCGAAAAGATCAAAGGACTTAACGAAGTCCTGAACTTAGCAATTCAAAAGAATGACGAGACAGCTCATATTATTGCGTCGCTTCCGCACCGTTTCATCCCGTTGTTTAAGCAAATTCTTTCGGACCGTAATACCTTAAGCTTCATTCTGGAGGAGTTCAAGAGTGATGAGGAAGTAATCCAGTCCTTTTGCAAGTATAAAACCCTGCTTCGCAATGAGAATGTGCTTGAAACTGCCGAGGCGTTATTCAATGAACTGAATAGCATTGATTTAACGCATATTTTTATTAGTCATAAGAAGCTTGAGACAATTTCCTCCGCGCTTTGTGACCACTGGGATACACTTCGCAACGCCTTATACGAACGCCGTATCTCAGAGCTTACGGGTAAGATTACCAAGTCTGCTAAAGAGAAAGTGCAGCGTTCCTTAAAGCACGAAGATATTAACTTACAGGAAATTATCAGCGCAGCGGGCAAGGAGCTGAGTGAGGCTTTTAAGCAGAAAACATCTGAGATTTTAAGCCACGCACACGCGGCGTTAGACCAACCGCTTCCTACCACCCTTAAGAAACAGGAAGAGAAAGAAATTTTAAAGTCGCAGTTGGACTCATTGCTTGGACTTTACCATTTGCTTGACTGGTTTGCCGTTGATGAGTCAAACGAAGTTGACCCTGAGTTTAGCGCCCGCTTAACCGGCATCAAGCTTGAGATGGAGCCGTCCCTGTCGTTCTACAATAAAGCCCGCAATTACGCTACAAAAAAGCCATATAGCGTAGAGAAGTTCAAGCTTAATTTCCAAATGCCGACTCTTGCGTCTGGTTGGGATGTGAATAAGGAGAAGAATAATGGAGCCATCCTGTTCGTGAAAAATGGTTTATACTATCTTGGTATTATGCCTAAGCAGAAAGGACGTTACAAAGCCTTGTCGTTTGAACCGACAGAAAAGACAAGCGAAGGTTTTGACAAGATGTACTATGACTACTTTCCAGACGCAGCTAAGATGATCCCAAAATGTTCCACGCAACTGAAGGCTGTGACCGCACACTTTCAGACGCATACTACCCCGATTTTGTTGAGTAATAACTTTATCGAACCATTGGAGATCACGAAAGAGATTTATGACTTGAATAATCCAGAGAAAGAACCCAAGAAGTTTCAAACCGCATACGCCAAGAAAACCGGGGATCAGAAAGGATATCGTGAGGCATTGTGCAAATGGATCGACTTTGAGACCACTC | GAGTGGTCTCAAAGTCGATCC | CTCACCAGAGTTTCAGCTAGG | GGATCGACTTTGAGACCACTC | 21 | AAGTCGATCC | TTCAGCTAGG | GGATCGACTT | #N/A | #N/A | #N/A | #N/A | #N/A | #N/A | #N/A | |||||||
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13 | Amplify_pdCas9 | 44 | pdCas9_bacteria | 26 | JM_023_fwd | 25 | JM_022_rev | 72 (78.2/84.5) | 4140 | 0.35 | 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31 | 1_to_3_Ribsowitch_Enzyme_PACE | 94 | Cloning_Standard_1_to_3_Enzyme_PACE | 41 | JM_038_fwd | 48 | LA_08_rev | 64.9 (61.9/66.6) | 322 | 0.39 | TACGTTTCGTTACAGAGCTCGCCAGTGGATAAGATGAAATTCGCCACTTGTTAGTGTAATTCGCTAACTCATCCTGGCATGTTGCTGTTGATTCTTCAATCAGATCTTTATAAATCAAAAAGATAAAAAATTGGCACGCAAATTGTATTAACAGTTCATCCCTATCAGTGATAGAGACAAGTCTAGCGAACCGCACTTAATACGACTCACTATAGGTACCGGTGATACCAGCATCGTCTTGATGCCCTTGGCAGCACCCTGCTAAGGTAACAACAAGATGAAAAAATTATTATTCGCAATTCCTTTAGTTGTTCCTTTCTAT | FALSE | TACGTTTCGTTACAGAGCTCGCCAGTGGATAAGATGAAATTCGCCACTTGTTAGTGTAATTCGCTAACTCATCCTGGCATGTTGCTGTTGATTCTTCAATCAGATCTTTATAAATCAAAAAGATAAAAAATTGGCACGCAAATTGTATTAACAGTTCATCCCTATCAGTGATAGAGACAAGTCTAGCGAACCGCACTTAATACGACTCACTATAGGTACCGGTGATACCAGCATCGTCTTGATGCCCTTGGCAGCACCCTGCTAAGGTAACAACAAGATGAAAAAATTATTATTCGCAATTCCTTTAGTTGTTCCTTTCTAT | 322 | TACGTTTCGTTACAGAGCTCG | 21 | ACAGAGCTCG | ACAGAGCTCG | 22 | TACGTTTCGTTACAGAGCTCG | 21 | TACGTTTCGTTACAGAGCTCG | ATAGAAAGGAACAACTAAAGGAATTGCG | TATCTTTCCTTGTTGATTTCCTTAACGC | CGCAATTCCTTTAGTTGTTCCTTTCTAT | 28 | AGGAATTGCG | TCCTTAACGC | CGCAATTCCT | CGCAATTCCT | 295 | CGCAATTCCTTTAGTTGTTCCTTTCTAT | GCGTTAAGGAAATCAACAAGGAAAGATA | ATAGAAAGGAACAACTAAAGGAATTGCG | 28 | ATAGAAAGGAACAACTAAAGGAATTGCG | ||||||
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44 | BBa_K808003 | 35 | pSB1C3 + BBa_K808003 | 73 | JM_007_fwd | 74 | PP_008_rev | 72 (87.7/86.9) | 320 | 0.56 | TCAGTTCTCGTAATGCAGGGCCCAGAATTTCAGTCCAACTACACCATTGGCACCGGCGCCCGTATGGGTCCAGGTTACTTCCCTCTGATCCTGGGTGTGCTCATGGCCATCCTGGGTGCAGCCATCTGCGTCGGCGGCCTGACCAAGGGCCCCGAAGGTGGTGACAAGATCGGTAAGTGGGCCTGGAAGCCTGTGTTCTTCGTGCTGGCTGCCAACTTTGCCTTCGGCATTCTGTTGGTGGGCGTGCCGGCTGTGGGCATCCCCCAGTTCGGTCTGATCATTGCGATCTACGTTTCGTTACAGAGCTCGCCAGTGGATAA | FALSE | NNNNNNNNNNNNANNTATAAAAATAGGCGTATCACGAGGCAGAATTTCAGATAAAAAAAATCCTTAGCTTTCGCTAAGGATGATTTCTGGAATTCGCGGCCGCTTCTAGATGAAAATCAAGAGCCAAAAAGACTTTTTCTCCGGTCTGATGTTCTTGGCCGTCGGTCTCGCATTTGCGATCGGCGCGTCCAACTACACCATTGGCACCGGCGCCCGTATGGGTCCAGGTTACTTCCCTCTGATCCTGGGTGTGCTCATGGCCATCCTGGGTGCAGCCATCTGCGTCGGCGGCCTGACCAAGGGCCCCGAAGGTGGTGACAAGATCGGTAAGTGGGCCTGGAAGCCTGTGTTCTTCGTGCTGGCTGCCAACTTTGCCTTCGGCATTCTGTTGGTGGGCGTGCCGGCTGTGGGCATCCCCCAGTTCGGTCTGATCATTGCGATCTACGCTTTGGTCTTTATCGCCAGCATGGCCGGTCAGACCTTCAACCTCAAGGAAACAGCCATCCTGGCCACCATTTTGGCGGTCGGCAGCTATTTCGCTTTCGTGTGGGCGCTGAATCTCCAGTTCCCCGTGTGGCCTAGCTTCATCGCTGGCTAATACTAGTAGCGGCCGCTGCAGTCCGGCAAAAAAACGGCAAGGTGTCACCACCCTGCCCTTTTTCTTTAAAACCGAAAAGATTACTTCGCGTTATGCAGGCTTCCTCGCTCACTGACTCGCTGCGCTCGGTCGTTCGGCTGCGGCGAGCGGTATCAGCTCACTCAAAGGCGGTAATACGGTTATCCACAGAATCAGGGGATAACGCANGAAAGAACATGTGAGCAAAAGGCCAGCAAAAGGCCAGGAACCGTAAAAAGGCCGCGTTGCTGGCGTTTTTCCACAGGCTCCGCCCCCCTGACGAGCATCACAAAAATCGACGCTCAAGTCANANGTGGCGAAACCCGACAGGACTATAAAGATACCAGGCGTTTCCCCCTGANNCCTNNNNNNNCNGTCNNNNGCN | 1001 | TCAGTTCTCGTAATGCAGGGCCCAGAATTTCAGTCCAACTACACCATTGGCAC | 53 | CCATTGGCAC | CCATTGGCAC | 208 | TTGGCCGTCGGTCTCGCATTTGCGATCGGCGCGTCCAACTACACCATTGGCAC | 21 | GTCCAACTACACCATTGGCAC | TTATCCACTGGCGAGCTCTGTAACGAAACGTAGATCGCAATGATCAGACCGAA | AATAGGTGACCGCTCGAGACATTGCTTTGCATCTAGCGTTACTAGTCTGGCTT | TTCGGTCTGATCATTGCGATCTACGTTTCGTTACAGAGCTCGCCAGTGGATAA | 53 | TCAGACCGAA | AGTCTGGCTT | TTCGGTCTGA | TTCGGTCTGA | 422 | TTCGGTCTGATCATTGCGATCTACGCTTTGGTCTTTATCGCCAGCATGGCCGG | AAGCCAGACTAGTAACGCTAGATGCGAAACCAGAAATAGCGGTCGTACCGGCC | CCGGCCATGCTGGCGATAAAGACCAAAGCGTAGATCGCAATGATCAGACCGAA | 25 | CGTAGATCGCAATGATCAGACCGAA | ||||||
45 | gRNA_Backbone | 53 | AP_Cas9_pSB1A3_NGG_SD4 | 7 | JM_003_fwd | 42 | JM_039_rev | 60.3 (77/60.3) | 2079 | 0.45 | 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| FALSE | 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| 4970 | CCGTCTTACTGTCGATTATCAAAAAGGATCTTCACCTAGATCC | 43 | ACCTAGATCC | ACCTAGATCC | 3121 | ATTTTGGTCATGAGATTATCAAAAAGGATCTTCACCTAGATCC | 30 | GATTATCAAAAAGGATCTTCACCTAGATCC | TACTGCACCTGTAGGTCGAC | ATGACGTGGACATCCAGCTG | GTCGACCTACAGGTGCAGTA | 20 | GTAGGTCGAC | CATCCAGCTG | GTCGACCTAC | GTCGACCTAC | 167 | GTCGACCTACAGGTGCAGTA | CAGCTGGATGTCCACGTCAT | TACTGCACCTGTAGGTCGAC | 20 | TACTGCACCTGTAGGTCGAC | ||||||
46 | Cloning_Standard_1_to_3_Enzyme_PACE_Riboswitch | #N/A | 69 | PP_003_fwd_gIII | 66 | LA_009_rev | 72 (76.9/83) | 322 | 0.39 | TACGTTTCGTTACAGAGCTCGCCAGTGGATAAGATGAAATTCGCCACTTGTTAGTGTAATTCGCTAACTCATCCTGGCATGTTGCTGTTGATTCTTCAATCAGATCTTTATAAATCAAAAAGATAAAAAATTGGCACGCAAATTGTATTAACAGTTCATCCCTATCAGTGATAGAGACAAGTCTAGCGAACCGCACTTAATACGACTCACTATAGGTACCGGTGATACCAGCATCGTCTTGATGCCCTTGGCAGCACCCTGCTAAGGTAACAACAAGATGAAAAAATTATTATTCGCAATTCCTTTAGTTGTTCCTTTCTAT | FALSE | #N/A | #N/A | TTGCGGTCTCATCTAGAAGGAGATTTTCAACATGCT | 36 | TCAACATGCT | #N/A | #N/A | #N/A | #N/A | #N/A | GCGGTCTCAGCGCTTAGAAAAACTCATCGAGCATCAAATGAAAC | CGCCAGAGTCGCGAATCTTTTTGAGTAGCTCGTAGTTTACTTTG | GTTTCATTTGATGCTCGATGAGTTTTTCTAAGCGCTGAGACCGC | 44 | CAAATGAAAC | GTTTACTTTG | GTTTCATTTG | #N/A | #N/A | #N/A | #N/A | #N/A | #N/A | #N/A | |||||||
47 | AP_NNNN | 53 | AP_Cas9_pSB1A3_NGG_SD4 | 35 | JM_032_fwd | 34 | JM_031_rev | 72 (NaN/73.2) | 4992 | 0.48 | 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| FALSE | 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69 | S1 | 7 | SP_CBXTAL | 67 | PP_001_fwd_gII | 68 | PP_002_rev_KanR | 72 (74.2/78.1) | 2825 | 0.42 | 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78 | AP_Cas9_p15A_NGG_SD4+39+70 | 69 | AP_Cas9_p15A_NGG_SD4 | 39 | JM_036_fwd | 91 | JM_070_rev | 61.6 (62.2/61.6) | 3643 | 0.48 | 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| 4970 | CACCACAGGTCTCGAAAAATGAACACGATTAACATCGCT | 39 | TAACATCGCT | #N/A | #N/A | #N/A | #N/A | #N/A | TGAAATTCTGGGCCCTGC | ACTTTAAGACCCGGGACG | GCAGGGCCCAGAATTTCA | 18 | TGGGCCCTGC | ACCCGGGACG | GCAGGGCCCA | GCAGGGCCCA | 4254 | GCAGGGCCCAGAATTTCA | CGTCCCGGGTCTTAAAGT | TGAAATTCTGGGCCCTGC | 18 | TGAAATTCTGGGCCCTGC | ||||||||
84 | RBS_tet_x_PCR | 70 | SP_destructase | 71 | PP_005_fwd_tet(x) | 72 | PP_006_rev_tet(x) | 67.6 (67/64.6) | 1164 | 0.46 | 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90 | Colony PCR: AP_Cas9_p15A_NGG_SD4 | 69 | AP_Cas9_p15A_NGG_SD4 | 19 | JM_015_rev | 85 | JM_065_rev | 58.4 (88.5/58.4) | 511 | 0.42 | TGAAATTCTGGGCCCTGCATTACGAGAACTGATCTGCCTCGTGATACGCCTATTTTTATAGGTTAATGTCATGATAATAATGGTTTCTTAGACGTCAGGTGGCACTACGTTTCGTTACAGAGCTCGCCAGTGGATAAAAATGTCCTGAGCTTTCACCTATGAAACTTTCGACTCGAGCCTCTATGAAGACACACCTAGACCGCTAAACTGAAAGTTCACAACACGCACGGTGTTACATTAGGCATACCGGTCTTGACAGCTAGCTCAGTCCTAGGGATTGTGCTAGCGAATTATCAGATCATCGTCGACCTACAGGTGCAGTAAGGAGGAAAAATGAAAAAATTATTATTCGCAATTCCTTTAGTTGTTCCTTTCTATTCTCACTCCGCTGAAACTGTTGAAAGTTGTTTAGCAAAACCCCATACAGAAAATTCATTTACTAACGTCTGGAAAGACGACAAAACTTTAGATCGTTACGCTAACTATGAGGGCTGTCTGTGGAATGCTACAG | TRUE | 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| FALSE | 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| FALSE | 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| FALSE | 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| FALSE | 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| FALSE | 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| FALSE | 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164 | AP_Cas9_p15A_NGG_SD4+71+58 | 69 | AP_Cas9_p15A_NGG_SD4 | 92 | JM_071_fwd | 78 | JM_058_rev | 60.6 (62.7/60.6) | 4301 | 0.47 | 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| FALSE | 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165 | AP_Cas9_SC101_NGG_SD8+71+58 | 72 | AP_Cas9_SC101_NGG_SD8 | 92 | JM_071_fwd | 78 | JM_058_rev | 60.6 (62.7/60.6) | 5195 | 0.44 | 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| FALSE | 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| FALSE | 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175 | AP_Cas9_p15A_NGG_SD4_luxAB+38+07 | 102 | AP_Cas9_p15A_NGG_SD4_luxAB | 41 | JM_038_fwd | 11 | JM_007_rev | 64.9 (61.9/64.3) | 4718 | 0.44 | 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| FALSE | 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| FALSE | 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| FALSE | 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| FALSE | 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196 | AP_Cas9_pSB1A3_NGG_sd6_luxAB+101+103 | 98 | AP_Cas9_pSB1A3_NGG_sd6_luxAB | 152 | JM_101_fwd | 154 | JM_103_rev | 72 (NaN/74.9) | 4252 | 0.44 | 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| FALSE | 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| FALSE | 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| FALSE | 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201 | AP_Cas9_SC101_NGG_SD8_luxAB+101+99 | 103 | AP_Cas9_SC101_NGG_SD8_luxAB | 152 | JM_101_fwd | 150 | JM_099_rev | 72 (NaN/79.4) | 7452 | 0.42 | 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| FALSE | 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| FALSE | 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