Difference between revisions of "Team:TAS Taipei/Software"

Line 109: Line 109:
 
                 <ul class="nav">
 
                 <ul class="nav">
 
                     <li>
 
                     <li>
−
                         <a href="#PM" class="pageNavBig">PR MODEL</a>
+
                         <a href="#PM" class="pageNavBig">PR CALCULAOTR</a>
 
                     </li>
 
                     </li>
 
                     <li>
 
                     <li>
−
                         <a href="#BM" class="pageNavBig">BIOFILM MODEL</a>
+
                         <a href="#BM" class="pageNavBig">BIOFILM CALCULATOR</a>
 
                     </li>
 
                     </li>
 
                 </ul>
 
                 </ul>
Line 124: Line 124:
 
                     <div class="row">
 
                     <div class="row">
 
                         <h1 class="name col-lg-12">SOFTWARE</h1>
 
                         <h1 class="name col-lg-12">SOFTWARE</h1>
 +
                    </div>
 +
                    <div class="row">
 +
                        <h4 class="para col-lg-12">
 +
                            We’ve created four calculators based on our modeling data to <b>inform WWTP managers on the amount of Proteorhodopsin (PR) bacteria or biofilm-coated biocarriers they need to remove nanoparticles (NPs)</b>. Imagine yourself as a WWTP manager and try our PR and biofilm calculators below!
 +
                        </h4>
 +
                    </div>
 +
                    <div class="row">
 +
                        <h4 class="para col-lg-12">
 +
                            We’ve created four calculators based on our modeling data to <b>inform WWTP managers on the amount of Proteorhodopsin (PR) bacteria or biofilm-coated biocarriers they need to remove nanoparticles (NPs)</b>. Imagine yourself as a WWTP manager and try our PR and biofilm calculators below!
 +
                        </h4>
 +
                    </div>
 +
                    <div class="row">
 +
                        <h4 class="para col-lg-12">
 +
                            Learn more about <a href="https://goo.gl/Ko1uWz">PR bacteria</a> and <a href="https://goo.gl/AATnBD">biofilm</a> modeling!<br><br>
 +
                            Download our calculators <a href="https://github.com/xXMaelstromXx/TAS_Taipei/releases">here</a>.
 +
                        </h4>
 
                     </div>
 
                     </div>
 
                     <div class="this_border row"></div>
 
                     <div class="this_border row"></div>
Line 129: Line 145:
 
                 <section class="main">
 
                 <section class="main">
 
                     <div class="row" id="PM">
 
                     <div class="row" id="PM">
−
                         <h1 class="col-lg-12 title2">PR MODEL</h1>
+
                         <h1 class="col-lg-12 title2">PR BACTERIA CALCULATORS</h1>
 +
                    </div>
 +
                    <div class="row">
 +
                        <h4 class="para col-lg-12">
 +
                            <b>PR_Runner is a calculator that outputs the final NP concentration</b> given the following inputs: initial NP concentration, initial PR bacteria concentration and intended time. Try the PR_Runner calculator below! 
 +
                        </h4>
 +
                    </div>
 +
                    <div class="row">
 +
                        <h4 class="section-title-2 col-lg-12">
 +
                            PR_Runner
 +
                        </h4>
 +
                    </div>
 +
                    <div class="row">
 +
                        <h4 class="para col-lg-12">
 +
                                <table>
 +
                                    <tbody>
 +
                                        <tr>
 +
                                            <td>Initial NP Concentration (micromolar)</td>
 +
                                            <td><input type="number" id="Ltwo" value="0"></td>
 +
                                        </tr>
 +
                                        <tr>
 +
                                            <td>Target NP Concentration (micromolar)</td>
 +
                                            <td><input type="number" id="targetL" value="0"></td>
 +
                                        </tr>
 +
                                        <tr>
 +
                                            <td>Retention Time (the amount of time water stays in the tank, hours)</td>
 +
                                            <td><input type="number" id="ttwo" value="0"></td>
 +
                                        </tr>
 +
                                        <tr>
 +
                                            <td><button onclick = "calculate3()">Calculate!</button></td>
 +
                                        </tr>
 +
                                        <tr><td colspan=2>Initial Bacteria Concentration Needed (# of bacteria/microliter):
 +
<span id="BacteriaResultConc">&nbsp;&nbsp;&nbsp;</span>
 +
                                        </tr>
 +
                                    </tbody>
 +
                                </table>
 +
                            </form>
 +
                        </h4>
 +
                    </div>
 +
                    <div class="row">
 +
                        <h4 class="para col-lg-12">
 +
                            <b>ReversePR_Runner is a calculator that outputs the final bacteria concentration</b> given the following inputs: initial and target NP concentration and intended retention time. Try the ReversePR_Runner calculator below!
 +
                        </h4>
 +
                    </div>
 +
                    <div class="row">
 +
                        <h4 class="section-title-2 col-lg-12">
 +
                            ReversePR_Runner
 +
                        </h4>
 +
                    </div>
 +
                    <div class="row">
 +
                        <h4 class="para col-lg-12">
 +
                                <table>
 +
                                    <tbody>
 +
                                        <tr>
 +
                                            <td>Initial NP Concentration (micromolar)</td>
 +
                                            <td><input type="number" id="L" value="0"></td>
 +
                                        </tr>
 +
                                        <tr>
 +
                                            <td>Initial Bacteria Concentration (# of cells/microliter)</td>
 +
                                            <td><input type="number" id="R" value="0"></td>
 +
                                        </tr>
 +
                                        <tr>
 +
                                            <td>Amount of time that can be used for the process (hours)</td>
 +
                                            <td><input type="number" id="t" value="0"></td>
 +
                                        </tr>
 +
                                        <tr>
 +
                                            <td><button onclick = "calculate2()">Calculate!</button></td>
 +
                                        </tr>
 +
                                        <tr><td colspan=2>Resulting NP Concentration (micromolar): <span id="NPResultConc">&nbsp;&nbsp;&nbsp;</span>
 +
                                        </tr>
 +
                                    </tbody>
 +
                                </table>
 +
                            </form>
 +
                        </h4>
 
                     </div>
 
                     </div>
 
                     <div class="row" id="BM">
 
                     <div class="row" id="BM">
−
                         <h1 class="col-lg-12 title2">BIOFILM MODEL</h1>
+
                         <h1 class="col-lg-12 title2">BIOFILM CALCULATORS</h1>
 +
                    </div>
 +
                    <div class="row">
 +
                        <h4 class="para col-lg-12">
 +
                            <b>Biofilm_Runner is a calculator that outputs the NP concentration of the effluent</b> given the following inputs: initial NP concentration, velocity of water in contact with biofilm, total volume of container, time for biofilm to be in contact with NP solution, and the number of biocarriers used. Try the Biofilm_Runner calculator below!
 +
                        </h4>
 +
                    </div>
 +
                    <div class="row">
 +
                        <h4 class="section-title-2 col-lg-12">
 +
                            Biofilm_Runner
 +
                        </h4>
 +
                    </div>
 +
                    <div class="row" id="BiofilmCalculator">
 +
                        <h4 class="para col-lg-12">
 +
                                <table>
 +
                                    <tbody>
 +
                                        <tr>
 +
                                            <td>Initial nanoparticle concentration (micromolar)</td>
 +
                                            <td><input type="number" id="conc" value="0"></td>
 +
                                        </tr>
 +
                                        <tr>
 +
                                            <td>Velocity of water in contact with biofilm (cm/sec)</td>
 +
                                            <td><input type="number" id="velocity" value="0"></td>
 +
                                        </tr>
 +
                                        <tr>
 +
                                            <td>Total Volume of Container (L)</td>
 +
                                            <td><input type="number" id="volume" value="0"></td>
 +
                                        </tr>
 +
                                        <tr>
 +
                                            <td>Time for biofilm to be in contact with NP solution (seconds)</td>
 +
                                            <td><input type="number" id="biot" value="0"></td>
 +
                                        </tr>
 +
                                        <tr>
 +
                                            <td>Surface Area of biofilm used</td>
 +
                                            <td><input type="number" id="SA" value="0"></td>
 +
                                        </tr>
 +
                                        <tr>
 +
                                            <td><button onclick = "calculate()">Calculate!</button></td>
 +
                                        </tr>
 +
                                        <tr><td colspan=2>Resulting Nanoparticle Concentration (micromolar): <span id="bioNPResultConc">&nbsp;&nbsp;&nbsp;</span>
 +
                                        </tr>
 +
                                    </tbody>
 +
                                </table>
 +
                            </form>
 +
                        </h4>
 +
                    </div>
 +
                    <div class="row">
 +
                        <h4 class="para col-lg-12">
 +
                            <b>ReverseBiofilm_Runner is a calculator that outputs the number of biocarriers</b> needed given the following inputs: initial and target NP concentration, velocity of water in contact with biofilm, total volume of container, and time for biofilm to be in contact with NP solution. Try the ReverseBiofilm_Runner calculator below!
 +
                        </h4>
 +
                    </div>
 +
                    <div class="row">
 +
                        <h4 class="section-title-2 col-lg-12">
 +
                            ReverseBiofilm_Runner
 +
                        </h4>
 +
                    </div>
 +
                    <div class="row" id="BiofilmCalculator2">
 +
                        <h4 class="para col-lg-12">
 +
                                <table>
 +
                                    <tbody>
 +
                                        <tr>
 +
                                            <td>Initial NP concentration (micromolar)</td>
 +
                                            <td><input type="number" id="Inconc" value="0"></td>
 +
                                        </tr>
 +
                                        <tr>
 +
                                            <td>Target NP Concentration (micromolar)</td>
 +
                                            <td><input type="number" id="targetConc" value="0"></td>
 +
                                        </tr>
 +
                                        <tr>
 +
                                            <td>Velocity of Water in contact with Biofilm (cm/s)</td>
 +
                                            <td><input type="number" id="velocity2" value="0"></td>
 +
                                        </tr>
 +
                                        <tr>
 +
                                            <td>Total Volume of tank (L)</td>
 +
                                            <td><input type="number" id="Vtwo" value="0"></td>
 +
                                        </tr>
 +
                                        <tr>
 +
                                            <td>Total time biofilm is in contact with NP solution (s)</td>
 +
                                            <td><input type="number" id="biottwo" value="0"></td>
 +
                                        </tr>
 +
                                        <tr>
 +
                                            <td><button onclick = "calculate4()">Calculate!</button></td>
 +
                                        </tr>
 +
                                        <tr><td colspan=2>Surface Area of Biofilm Needed(cm<sup>2</sup>): <span id="bioNPResultSA">&nbsp;&nbsp;&nbsp;</span>
 +
                                        </tr>
 +
                                    </tbody>
 +
                                </table>
 +
                            </form>
 +
                        </h4>
 
                     </div>
 
                     </div>
 
                     <div class="row">
 
                     <div class="row">
 
                         <h4 class="para col-lg-12">
 
                         <h4 class="para col-lg-12">
−
                             filler
+
                             All units of the output and the inputs are included in the program. Enter as many significant digits as possible for more accurate results. To inspect the code of each .jar files, unzip with tools like 7zip or Winzip and then use BlueJ (free Java IDE) to open the package.
 
                         </h4>
 
                         </h4>
 
                     </div>
 
                     </div>

Revision as of 08:39, 1 November 2017

X

Project
Experiments
Modeling
Prototype
Human Practices
Safety
About Us
Attributions

Project

Experiment

Modeling

Prototype

Human Practice

Biosafety

About Us

Attributions

Home
hi

SOFTWARE

We’ve created four calculators based on our modeling data to inform WWTP managers on the amount of Proteorhodopsin (PR) bacteria or biofilm-coated biocarriers they need to remove nanoparticles (NPs). Imagine yourself as a WWTP manager and try our PR and biofilm calculators below!

We’ve created four calculators based on our modeling data to inform WWTP managers on the amount of Proteorhodopsin (PR) bacteria or biofilm-coated biocarriers they need to remove nanoparticles (NPs). Imagine yourself as a WWTP manager and try our PR and biofilm calculators below!

Learn more about PR bacteria and biofilm modeling!

Download our calculators here.

PR BACTERIA CALCULATORS

PR_Runner is a calculator that outputs the final NP concentration given the following inputs: initial NP concentration, initial PR bacteria concentration and intended time. Try the PR_Runner calculator below!

PR_Runner

Initial NP Concentration (micromolar)
Target NP Concentration (micromolar)
Retention Time (the amount of time water stays in the tank, hours)
Initial Bacteria Concentration Needed (# of bacteria/microliter):    

ReversePR_Runner is a calculator that outputs the final bacteria concentration given the following inputs: initial and target NP concentration and intended retention time. Try the ReversePR_Runner calculator below!

ReversePR_Runner

Initial NP Concentration (micromolar)
Initial Bacteria Concentration (# of cells/microliter)
Amount of time that can be used for the process (hours)
Resulting NP Concentration (micromolar):    

BIOFILM CALCULATORS

Biofilm_Runner is a calculator that outputs the NP concentration of the effluent given the following inputs: initial NP concentration, velocity of water in contact with biofilm, total volume of container, time for biofilm to be in contact with NP solution, and the number of biocarriers used. Try the Biofilm_Runner calculator below!

Biofilm_Runner

Initial nanoparticle concentration (micromolar)
Velocity of water in contact with biofilm (cm/sec)
Total Volume of Container (L)
Time for biofilm to be in contact with NP solution (seconds)
Surface Area of biofilm used
Resulting Nanoparticle Concentration (micromolar):    

ReverseBiofilm_Runner is a calculator that outputs the number of biocarriers needed given the following inputs: initial and target NP concentration, velocity of water in contact with biofilm, total volume of container, and time for biofilm to be in contact with NP solution. Try the ReverseBiofilm_Runner calculator below!

ReverseBiofilm_Runner

Initial NP concentration (micromolar)
Target NP Concentration (micromolar)
Velocity of Water in contact with Biofilm (cm/s)
Total Volume of tank (L)
Total time biofilm is in contact with NP solution (s)
Surface Area of Biofilm Needed(cm2):    

All units of the output and the inputs are included in the program. Enter as many significant digits as possible for more accurate results. To inspect the code of each .jar files, unzip with tools like 7zip or Winzip and then use BlueJ (free Java IDE) to open the package.