Difference between revisions of "Team:HUST-China/Notebook"

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                     <p><strong>Efan Wang</strong></p>
 
                     <p><strong>Efan Wang</strong></p>
 
                    
 
                    
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                     <div class="table-responsive col-xs-8 col-xs-offset-1" style="text-align: center; font-size:14px;">
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                     <div class="table-responsive col-xs-10 col-xs-offset-1" style="text-align: center; font-size:14px;">
 
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                         <table class="table table-hover">
 
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                         <p><strong> Restriction Enzyme Digestion</strong></p>
 
                         <p><strong> Restriction Enzyme Digestion</strong></p>
 
                         <p><strong>Ziyang Xiao & Zichun Weng & Yuqi Wu</strong></p>
 
                         <p><strong>Ziyang Xiao & Zichun Weng & Yuqi Wu</strong></p>
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                         <div class="table-responsive col-xs-8 col-xs-offset-1" style="text-align: center; font-size:14px;">
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                         <div class="table-responsive col-xs-10 col-xs-offset-1" style="text-align: center; font-size:14px;">
 
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                               <thead>
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                         <p><strong>DNA ligation & transformation</strong></p>
 
                         <p><strong>DNA ligation & transformation</strong></p>
 
                         <p><strong>Ziyang Xiao</strong></p>
 
                         <p><strong>Ziyang Xiao</strong></p>
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                         <div class="table-responsive col-xs-10 col-xs-offset-1" style="text-align: center; font-size:14px;">
 
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                               <thead>
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                         <p><strong>Colony PCR</strong></p>
 
                         <p><strong>Colony PCR</strong></p>
 
                         <p><strong>Xiao Deng</strong></p>
 
                         <p><strong>Xiao Deng</strong></p>
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                         <div class="table-responsive col-xs-8 col-xs-offset-1" style="text-align: center; font-size:14px;">
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Line 604: Line 604:
 
                         <p><strong>PCR</strong></p>
 
                         <p><strong>PCR</strong></p>
 
                         <p><strong>Ziyang Xiao & Zichun Weng</strong></p>
 
                         <p><strong>Ziyang Xiao & Zichun Weng</strong></p>
−
                         <div class="table-responsive col-xs-8 col-xs-offset-1" style="text-align: center; font-size:14px;">
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                             <p><strong>PCR</strong></p>
 
                             <p><strong>PCR</strong></p>
 
                             <p><strong>Efan Wang & Ziyang Xiao</strong></p>
 
                             <p><strong>Efan Wang & Ziyang Xiao</strong></p>
−
                             <div class="table-responsive col-xs-8 col-xs-offset-1" style="text-align: center; font-size:14px;">
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                             <div class="table-responsive col-xs-10 col-xs-offset-1" style="text-align: center; font-size:14px;">
 
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Line 714: Line 714:
 
                             <p><strong>Restriction Enzyme Digestion</strong></p>
 
                             <p><strong>Restriction Enzyme Digestion</strong></p>
 
                             <p><strong>Ziyang Xiao & Ting Peng</strong></p>
 
                             <p><strong>Ziyang Xiao & Ting Peng</strong></p>
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                             <div class="table-responsive col-xs-8 col-xs-offset-1" style="text-align: center; font-size:14px;">
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Line 756: Line 756:
 
                             <p><strong>Restriction Enzyme Digestion</strong></p>
 
                             <p><strong>Restriction Enzyme Digestion</strong></p>
 
                             <p><strong>Ziyang Xiao & Ting Peng</strong></p>
 
                             <p><strong>Ziyang Xiao & Ting Peng</strong></p>
−
                             <div class="table-responsive col-xs-8 col-xs-offset-1" style="text-align: center; font-size:14px;">
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                             <p><strong>Restriction Enzyme Digestion</strong></p>
 
                             <p><strong>Restriction Enzyme Digestion</strong></p>
 
                             <p><strong>Xiao Deng</strong></p>
 
                             <p><strong>Xiao Deng</strong></p>
−
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Line 853: Line 853:
 
                             <p><strong>DNA ligation & transformation</strong></p>
 
                             <p><strong>DNA ligation & transformation</strong></p>
 
                             <p><strong>Xiao Deng & Ting Peng</strong></p>
 
                             <p><strong>Xiao Deng & Ting Peng</strong></p>
−
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Line 905: Line 905:
 
                             <p><strong>Colony PCR</strong></p>
 
                             <p><strong>Colony PCR</strong></p>
 
                             <p><strong>Xiao Deng</strong></p>
 
                             <p><strong>Xiao Deng</strong></p>
−
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Line 946: Line 946:
 
                             <p><strong>DNA ligation & transformation</strong></p>
 
                             <p><strong>DNA ligation & transformation</strong></p>
 
                             <p><strong>Xiao Deng & Nan Hu & Shaofeng Liao</strong></p>
 
                             <p><strong>Xiao Deng & Nan Hu & Shaofeng Liao</strong></p>
−
                             <div class="table-responsive col-xs-8 col-xs-offset-1" style="text-align: center; font-size:14px;">
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                             <div class="table-responsive col-xs-10 col-xs-offset-1" style="text-align: center; font-size:14px;">
 
                                 <table class="table table-hover">
 
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Line 1,017: Line 1,017:
 
                             <p><strong>Colony PCR</strong></p>
 
                             <p><strong>Colony PCR</strong></p>
 
                             <p><strong>Xiao Deng</strong></p>
 
                             <p><strong>Xiao Deng</strong></p>
−
                             <div class="table-responsive col-xs-8 col-xs-offset-1" style="text-align: center; font-size:14px;">
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                             <p><strong>PCR</strong></p>
 
                             <p><strong>PCR</strong></p>
 
                             <p><strong>Yiyan Yu</strong></p>
 
                             <p><strong>Yiyan Yu</strong></p>
−
                             <div class="table-responsive col-xs-8 col-xs-offset-1" style="text-align: center; font-size:14px;">
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                             <div class="table-responsive col-xs-10 col-xs-offset-1" style="text-align: center; font-size:14px;">
 
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Line 1,109: Line 1,109:
 
                             <p><strong>Restriction Enzyme Digestion</strong></p>
 
                             <p><strong>Restriction Enzyme Digestion</strong></p>
 
                             <p><strong>Yiyan Yu</strong></p>
 
                             <p><strong>Yiyan Yu</strong></p>
−
                             <div class="table-responsive col-xs-8 col-xs-offset-1" style="text-align: center; font-size:14px;">
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                             <div class="table-responsive col-xs-10 col-xs-offset-1" style="text-align: center; font-size:14px;">
 
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Line 1,137: Line 1,137:
 
                             <p><strong>DNA ligation & transformation</strong></p>
 
                             <p><strong>DNA ligation & transformation</strong></p>
 
                             <p><strong>Yiyan Yu & Qingyang Yu</strong></p>
 
                             <p><strong>Yiyan Yu & Qingyang Yu</strong></p>
−
                             <div class="table-responsive col-xs-8 col-xs-offset-1" style="text-align: center; font-size:14px;">
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                             <div class="table-responsive col-xs-10 col-xs-offset-1" style="text-align: center; font-size:14px;">
 
                                 <table class="table table-hover">
 
                                 <table class="table table-hover">
 
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                                   <thead>
Line 1,164: Line 1,164:
 
                             <p><strong>Colony PCR</strong></p>
 
                             <p><strong>Colony PCR</strong></p>
 
                             <p><strong>Yiyan Yu</strong></p>
 
                             <p><strong>Yiyan Yu</strong></p>
−
                             <div class="table-responsive col-xs-8 col-xs-offset-1" style="text-align: center; font-size:14px;">
+
                             <div class="table-responsive col-xs-10 col-xs-offset-1" style="text-align: center; font-size:14px;">
 
                                 <table class="table table-hover">
 
                                 <table class="table table-hover">
 
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                                   <thead>
Line 1,196: Line 1,196:
 
                             <p><strong>PCR</strong></p>
 
                             <p><strong>PCR</strong></p>
 
                             <p><strong>Long Cheng</strong></p>
 
                             <p><strong>Long Cheng</strong></p>
−
                             <div class="table-responsive col-xs-8 col-xs-offset-1" style="text-align: center; font-size:14px;">
+
                             <div class="table-responsive col-xs-10 col-xs-offset-1" style="text-align: center; font-size:14px;">
 
                                 <table class="table table-hover">
 
                                 <table class="table table-hover">
 
                                   <thead>
 
                                   <thead>
Line 1,220: Line 1,220:
 
                             <p><strong>Restriction Enzyme Digestion</strong></p>
 
                             <p><strong>Restriction Enzyme Digestion</strong></p>
 
                             <p><strong>Yiyan Yu</strong></p>
 
                             <p><strong>Yiyan Yu</strong></p>
−
                             <div class="table-responsive col-xs-8 col-xs-offset-1" style="text-align: center; font-size:14px;">
+
                             <div class="table-responsive col-xs-10 col-xs-offset-1" style="text-align: center; font-size:14px;">
 
                                 <table class="table table-hover">
 
                                 <table class="table table-hover">
 
                                   <thead>
 
                                   <thead>
Line 1,246: Line 1,246:
 
                             <p><strong>Restriction Enzyme Digestion</strong></p>
 
                             <p><strong>Restriction Enzyme Digestion</strong></p>
 
                             <p><strong>Yiyan Yu & Qingyang Yu</strong></p>
 
                             <p><strong>Yiyan Yu & Qingyang Yu</strong></p>
−
                             <div class="table-responsive col-xs-8 col-xs-offset-1" style="text-align: center; font-size:14px;">
+
                             <div class="table-responsive col-xs-10 col-xs-offset-1" style="text-align: center; font-size:14px;">
 
                                 <table class="table table-hover">
 
                                 <table class="table table-hover">
 
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                                   <thead>
Line 1,274: Line 1,274:
 
                             <p><strong>Colony PCR</strong></p>
 
                             <p><strong>Colony PCR</strong></p>
 
                             <p><strong>Yiyan Yu</strong></p>
 
                             <p><strong>Yiyan Yu</strong></p>
−
                             <div class="table-responsive col-xs-8 col-xs-offset-1" style="text-align: center; font-size:14px;">
+
                             <div class="table-responsive col-xs-10 col-xs-offset-1" style="text-align: center; font-size:14px;">
 
                               <table class="table table-hover">
 
                               <table class="table table-hover">
 
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                                   <thead>
Line 1,309: Line 1,309:
 
                             <p><strong>PCR</strong></p>
 
                             <p><strong>PCR</strong></p>
 
                             <p><strong>Yiyan Yu</strong></p>
 
                             <p><strong>Yiyan Yu</strong></p>
−
                             <div class="table-responsive col-xs-8 col-xs-offset-1" style="text-align: center; font-size:14px;">
+
                             <div class="table-responsive col-xs-10 col-xs-offset-1" style="text-align: center; font-size:14px;">
 
                               <table class="table table-hover">
 
                               <table class="table table-hover">
 
                                   <thead>
 
                                   <thead>
Line 1,333: Line 1,333:
 
                             <p><strong>Point mutation</strong></p>
 
                             <p><strong>Point mutation</strong></p>
 
                             <p><strong>Xiaoyang Li</strong></p>
 
                             <p><strong>Xiaoyang Li</strong></p>
−
                             <div class="table-responsive col-xs-8 col-xs-offset-1" style="text-align: center; font-size:14px;">
+
                             <div class="table-responsive col-xs-10 col-xs-offset-1" style="text-align: center; font-size:14px;">
 
                               <table class="table table-hover">
 
                               <table class="table table-hover">
 
                                   <thead>
 
                                   <thead>
Line 1,355: Line 1,355:
 
                             <p><strong>Restriction Enzyme Digestion</strong></p>
 
                             <p><strong>Restriction Enzyme Digestion</strong></p>
 
                             <p><strong>Xiaoyang Li</strong></p>
 
                             <p><strong>Xiaoyang Li</strong></p>
−
                             <div class="table-responsive col-xs-8 col-xs-offset-1" style="text-align: center; font-size:14px;">
+
                             <div class="table-responsive col-xs-10 col-xs-offset-1" style="text-align: center; font-size:14px;">
 
                               <table class="table table-hover">
 
                               <table class="table table-hover">
 
                                   <thead>
 
                                   <thead>
Line 1,390: Line 1,390:
 
                             <p><strong>Transformation</strong></p>
 
                             <p><strong>Transformation</strong></p>
 
                             <p><strong>Xiaoyang Li & Yating Hu</strong></p>
 
                             <p><strong>Xiaoyang Li & Yating Hu</strong></p>
−
                             <div class="table-responsive col-xs-8 col-xs-offset-1" style="text-align: center; font-size:14px;">
+
                             <div class="table-responsive col-xs-10 col-xs-offset-1" style="text-align: center; font-size:14px;">
 
                                 <table class="table table-hover">
 
                                 <table class="table table-hover">
 
                                   <thead>
 
                                   <thead>
Line 1,424: Line 1,424:
 
                             <p><strong>Colony PCR</strong></p>
 
                             <p><strong>Colony PCR</strong></p>
 
                             <p><strong>Xiaoyang Li</strong></p>
 
                             <p><strong>Xiaoyang Li</strong></p>
−
                             <div class="table-responsive col-xs-8 col-xs-offset-1" style="text-align: center; font-size:14px;">
+
                             <div class="table-responsive col-xs-10 col-xs-offset-1" style="text-align: center; font-size:14px;">
 
                               <table class="table table-hover">
 
                               <table class="table table-hover">
 
                                   <thead>
 
                                   <thead>
Line 1,454: Line 1,454:
 
                             <p><strong>Bypass PCR</strong></p>
 
                             <p><strong>Bypass PCR</strong></p>
 
                             <p><strong>Yating Hu</strong></p>
 
                             <p><strong>Yating Hu</strong></p>
−
                             <div class="table-responsive col-xs-8 col-xs-offset-1" style="text-align: center; font-size:14px;">
+
                             <div class="table-responsive col-xs-10 col-xs-offset-1" style="text-align: center; font-size:14px;">
 
                               <table class="table table-hover">
 
                               <table class="table table-hover">
 
                                   <thead>
 
                                   <thead>
Line 1,514: Line 1,514:
 
                             <p><strong>Restriction Enzyme Digestion</strong></p>
 
                             <p><strong>Restriction Enzyme Digestion</strong></p>
 
                             <p><strong>Xiaoyang Li</strong></p>
 
                             <p><strong>Xiaoyang Li</strong></p>
−
                             <div class="table-responsive col-xs-8 col-xs-offset-1" style="text-align: center; font-size:14px;">
+
                             <div class="table-responsive col-xs-10 col-xs-offset-1" style="text-align: center; font-size:14px;">
 
                               <table class="table table-hover">
 
                               <table class="table table-hover">
 
                                   <thead>
 
                                   <thead>
Line 1,576: Line 1,576:
 
                             <p><strong>Transformation</strong></p>
 
                             <p><strong>Transformation</strong></p>
 
                             <p><strong>Xiaoyang Li & Yating Hu</strong></p>
 
                             <p><strong>Xiaoyang Li & Yating Hu</strong></p>
−
                             <div class="table-responsive col-xs-8 col-xs-offset-1" style="text-align: center; font-size:14px;">
+
                             <div class="table-responsive col-xs-10 col-xs-offset-1" style="text-align: center; font-size:14px;">
 
                                 <table class="table table-hover">
 
                                 <table class="table table-hover">
 
                                   <thead>
 
                                   <thead>
Line 1,603: Line 1,603:
 
                             <p><strong>Colony PCR</strong></p>
 
                             <p><strong>Colony PCR</strong></p>
 
                             <p><strong>Xiaoyang Li</strong></p>
 
                             <p><strong>Xiaoyang Li</strong></p>
−
                             <div class="table-responsive col-xs-8 col-xs-offset-1" style="text-align: center; font-size:14px;">
+
                             <div class="table-responsive col-xs-10 col-xs-offset-1" style="text-align: center; font-size:14px;">
 
                               <table class="table table-hover">
 
                               <table class="table table-hover">
 
                                   <thead>
 
                                   <thead>
Line 1,660: Line 1,660:
 
                     </div>
 
                     </div>
  
−
<--*****pmrA-pmrB-LBT X-pBAD30→pmrA-pmrB-LBT X-pmrC-GFP-pBAD30*****PAGE15******-->
+
<--*****pmrA-pmrB-LBT X-pBAD30→pmrA-pmrB-LBT X-pmrC-GFP-pBAD30*****PAGE******-->
 
                     <div class="col-xs-12">
 
                     <div class="col-xs-12">
 
                         <h4><strong>pmrA-pmrB-LBT X-pBAD30→pmrA-pmrB-LBT X-pmrC-GFP-pBAD30</strong> </h4>
 
                         <h4><strong>pmrA-pmrB-LBT X-pBAD30→pmrA-pmrB-LBT X-pmrC-GFP-pBAD30</strong> </h4>
−
                             <p><strong>10.18</strong></p>
+
                             <p><strong>7.25</strong></p>
 
                             <p><strong>PCR</strong></p>
 
                             <p><strong>PCR</strong></p>
−
                             <p><strong>Long Cheng</strong></p>
+
                             <p><strong>Yiyan Yu</strong></p>
−
                             <div class="table-responsive col-xs-8 col-xs-offset-1" style="text-align: center; font-size:14px;">
+
                             <div class="table-responsive col-xs-10 col-xs-offset-1" style="text-align: center; font-size:14px;">
 
                               <table class="table table-hover">
 
                               <table class="table table-hover">
 
                                   <thead>
 
                                   <thead>
Line 1,690: Line 1,690:
 
                             <p><strong>Point mutation</strong></p>
 
                             <p><strong>Point mutation</strong></p>
 
                             <p><strong>Xiaoyang Li</strong></p>
 
                             <p><strong>Xiaoyang Li</strong></p>
−
                             <div class="table-responsive col-xs-8 col-xs-offset-1" style="text-align: center; font-size:14px;">
+
                             <div class="table-responsive col-xs-10 col-xs-offset-1" style="text-align: center; font-size:14px;">
 
                               <table class="table table-hover">
 
                               <table class="table table-hover">
 
                                   <thead>
 
                                   <thead>
Line 1,712: Line 1,712:
 
                             <p><strong>Restriction Enzyme Digestion</strong></p>
 
                             <p><strong>Restriction Enzyme Digestion</strong></p>
 
                             <p><strong>Xiaoyang Li</strong></p>
 
                             <p><strong>Xiaoyang Li</strong></p>
−
                             <div class="table-responsive col-xs-8 col-xs-offset-1" style="text-align: center; font-size:14px;">
+
                             <div class="table-responsive col-xs-10 col-xs-offset-1" style="text-align: center; font-size:14px;">
 
                               <table class="table table-hover">
 
                               <table class="table table-hover">
 
                                   <thead>
 
                                   <thead>
Line 1,747: Line 1,747:
 
                             <p><strong>Transformation</strong></p>
 
                             <p><strong>Transformation</strong></p>
 
                             <p><strong>Xiaoyang Li & Yating Hu</strong></p>
 
                             <p><strong>Xiaoyang Li & Yating Hu</strong></p>
−
                             <div class="table-responsive col-xs-8 col-xs-offset-1" style="text-align: center; font-size:14px;">
+
                             <div class="table-responsive col-xs-10 col-xs-offset-1" style="text-align: center; font-size:14px;">
 
                                 <table class="table table-hover">
 
                                 <table class="table table-hover">
 
                                   <thead>
 
                                   <thead>
Line 1,781: Line 1,781:
 
                             <p><strong>Colony PCR</strong></p>
 
                             <p><strong>Colony PCR</strong></p>
 
                             <p><strong>Xiaoyang Li</strong></p>
 
                             <p><strong>Xiaoyang Li</strong></p>
−
                             <div class="table-responsive col-xs-8 col-xs-offset-1" style="text-align: center; font-size:14px;">
+
                             <div class="table-responsive col-xs-10 col-xs-offset-1" style="text-align: center; font-size:14px;">
 
                               <table class="table table-hover">
 
                               <table class="table table-hover">
 
                                   <thead>
 
                                   <thead>

Revision as of 12:41, 29 October 2017

Notebook

「Notebook」

Sensing part

OprF→OprF-pET28a

7.2

PCR

Efan Wang

Name Total
OprF 1 50 μl
OprF 2 50 μl
OprF 3 50 μl
OprF 4 50 μl
demo1

7.17

Restriction Enzyme Digestion

Ziyang Xiao & Zichun Weng & Yuqi Wu

Name Enzyme
pET28a NheI and BamHI
OprF 1 NheI and BamHI
OprF 2 NheI and BamHI

7.27

DNA ligation & transformation

Ziyang Xiao

Name Backbone Strain Medium
OprF pET28a(BamH I and Nhe I cut) Top10 LB(kan added)

7.28

Colony PCR

Xiao Deng

Number Name
1 OprF-pET28a
2 OprF-pET28a
3 OprF-pET28a
4 OprF-pET28a
5 OprF-pET28a
demo1

3×LBT1-12 & Si-tag→OprF-3×LBT X(or Si-tag)-pET28a

7.22

PCR

Ziyang Xiao & Zichun Weng

Number Total
3*LBT1 50μl
3*LBT2 50μl
3*LBT3 50μl
3*LBT4 50μl
3*LBT9 50μl
3*LBT10 50μl
3*LBT11 50μl
3*LBT12 50μl

7.27

PCR

Efan Wang & Ziyang Xiao

Number Total
3*LBT5_1 50μl
3*LBT5_2 50μl
3*LBT6_1 50μl
3*LBT6_2 50μl
3*LBT7_1 50μl
3*LBT7_2 50μl
3*LBT8_1 50μl
3*LBT8_2 50μl
Sitag 1 50μl
Sitag2 50μl
demo1

7.27

Restriction Enzyme Digestion

Ziyang Xiao & Ting Peng

Number Enzyme
OprF-pET28a HindIII and BamHI
3*LBT2 HindIII and BamHI
3*LBT3 HindIII and BamHI
3*LBT4 HindIII and BamHI
3*LBT8 HindIII and BamHI
Sitag HindIII and BamHI

7.27

Restriction Enzyme Digestion

Ziyang Xiao & Ting Peng

Number Enzyme
OprF-pET28a HindIII and BamHI
3*LBT2 HindIII and BamHI
3*LBT3 HindIII and BamHI
3*LBT4 HindIII and BamHI
3*LBT8 HindIII and BamHI
Sitag HindIII and BamHI

8.4

Restriction Enzyme Digestion

Xiao Deng

Number Enzyme
3*LBT1 HindIII and BamHI
3*LBT5 HindIII and BamHI
3*LBT6 HindIII and BamHI
3*LBT7 HindIII and BamHI
3*LBT9 HindIII and BamHI
3*LBT10 HindIII and BamHI
3*LBT11 HindIII and BamHI
3*LBT12 HindIII and BamHI

7.28

DNA ligation & transformation

Xiao Deng & Ting Peng

Number Backbone Stain Medium
3*LBT2 OprF-pET28a(BamHI and HindIII cut) Top10 LB(kan added)
3*LBT3 OprF-pET28a(BamHI and HindIII cut) Top10 LB(kan added)
3*LBT4 OprF-pET28a(BamHI and HindIII cut) Top10 LB(kan added)
3*LBT8 OprF-pET28a(BamHI and HindIII cut) Top10 LB(kan added)
Sitag OprF-pET28a(BamHI and HindIII cut) Top10 LB(kan added)

7.29

Colony PCR

Xiao Deng

Number Name
1 OprF-3×LBT2-pET28a
2 OprF-3×LBT3-pET28a
3 OprF-3×LBT4-pET28a
4 OprF-3×LBT8-pET28a
5 OprF-Sitag-pET28a
demo1

8.12

DNA ligation & transformation

Xiao Deng & Nan Hu & Shaofeng Liao

Number Backbone Stain Medium
3*LBT1 OprF-pET28a(BamHI and HindIII cut) Top10 LB(kan added)
3*LBT5 OprF-pET28a(BamHI and HindIII cut) Top10 LB(kan added)
3*LBT6 OprF-pET28a(BamHI and HindIII cut) Top10 LB(kan added)
3*LBT7 OprF-pET28a(BamHI and HindIII cut) Top10 LB(kan added)
3*LBT9 OprF-pET28a(BamHI and HindIII cut) Top10 LB(kan added)
3*LBT10 OprF-pET28a(BamHI and HindIII cut) Top10 LB(kan added)
3*LBT11 OprF-pET28a(BamHI and HindIII cut) Top10 LB(kan added)
3*LBT12 OprF-pET28a(BamHI and HindIII cut) Top10 LB(kan added)

8.13

Colony PCR

Xiao Deng

Number Name
1 OprF-3×LBT2-pET28a
2 OprF-3×LBT3-pET28a
3 OprF-3×LBT4-pET28a
4 OprF-3×LBT8-pET28a
5 OprF-Sitag-pET28a
6 OprF-3×LBT4-pET28a
7 OprF-3×LBT8-pET28a
8 OprF-Sitag-pET28a
demo1

Recycling part

pmrC-GFP→pmrC-GFP-pBAD30

7.10

PCR

Yiyan Yu

Name Total
pmrC-GFP 50μl
demo1

7.19

Restriction Enzyme Digestion

Yiyan Yu

Name Enzyme
pmrC-GFP EcoRI and Hind III
pBAD30 EcoRI and Hind III

7.20

DNA ligation & transformation

Yiyan Yu & Qingyang Yu

Name Backbone Strain Medium
pmrC-GFP pBAD30(EcoR I and Hind III cut) Top10 LB(amp added)

7.21

Colony PCR

Yiyan Yu

Number Name
1 pmrC-GFP-pBAD30
5 pmrC-GFP-pBAD30
6 pmrC-GFP-pBAD30

pmrA-pmrB-Fe→pmrA-pmrB-Fe-pBAD30

7.8

PCR

Long Cheng

Name Total
pmrA-pmrB-Fe 50 μl
demo1

7.19

Restriction Enzyme Digestion

Yiyan Yu

Name Enzyme
pmrA-pmrB-Fe EcoRI and KpnI
pBAD30 EcoRI and KpnI

7.20

Restriction Enzyme Digestion

Yiyan Yu & Qingyang Yu

Name Backbone Strain Medium
pmrA-pmrB-Fe pBAD30(EcoR I and Hind III cut) Top10 LB(amp added)

7.21

Colony PCR

Yiyan Yu

Number Name
1 pmrA-pmrB-Fe-pBAD30
5 pmrA-pmrB-Fe-pBAD30
6 pmrA-pmrB-Fe-pBAD30
demo1

pmrA-pmrB-Fe-pBAD30→pmrA-pmrB-LBT X-pBAD30

7.25

PCR

Yiyan Yu

Name Total
LBT 1 to 12 50 μl each
demo1

8.10

Point mutation

Xiaoyang Li

Name Total
pmrA-pmrB-Fe-pBAD30 50 μl

8.20

Restriction Enzyme Digestion

Xiaoyang Li

Name Enzyme
pmrA-pmrB-Fe-pBAD30 AhdI and SacI
LBT 1 AhdI and SacI
LBT 11 AhdI and SacI
demo1

8.20

Transformation

Xiaoyang Li & Yating Hu

Name Backbone Strain Medium
LBT 1 pmrA-pmrB-Fe-pBAD30(AhdI and SacI cut) Top10 LB(amp added)
LBT 11 pmrA-pmrB-Fe-pBAD30(AhdI and SacI cut) Top10 LB(amp added)

8.21

Colony PCR

Xiaoyang Li

Number Name
1 pmrA-pmrB-LBT 1-pBAD30
1 pmrA-pmrB-LBT 11-pBAD30
demo1

8.10

Bypass PCR

Yating Hu

Name Total
pmrA-pmrB-Fe&LBT 2 50 μl
pmrA-pmrB-Fe&LBT 3 50 μl
pmrA-pmrB-Fe&LBT 4 50 μl
pmrA-pmrB-Fe&LBT 5 50 μl
pmrA-pmrB-Fe&LBT 6 50 μl
pmrA-pmrB-Fe&LBT 7 50 μl
pmrA-pmrB-Fe&LBT 8 50 μl
pmrA-pmrB-Fe&LBT 9 50 μl
pmrA-pmrB-Fe&LBT 10 50 μl
pmrA-pmrB-Fe&LBT 12 50 μl

9.2

Restriction Enzyme Digestion

Xiaoyang Li

Name Enzyme
pmrA-pmrB-LBT2 EcoRI and KpnI
pmrA-pmrB-LBT3 EcoRI and KpnI
pmrA-pmrB-LBT4 EcoRI and KpnI
pmrA-pmrB-LBT5 EcoRI and KpnI
pmrA-pmrB-LBT6 EcoRI and KpnI
pmrA-pmrB-LBT7 EcoRI and KpnI
pmrA-pmrB-LBT8 EcoRI and KpnI
pmrA-pmrB-LBT9 EcoRI and KpnI
pmrA-pmrB-LBT10 EcoRI and KpnI
pmrA-pmrB-LBT12 EcoRI and KpnI
demo1

8.20

Transformation

Xiaoyang Li & Yating Hu

Name Backbone Strain Medium
pmrA-pmrB-LBT 2,3,4,5,6,7,8,9,10,12 pBAD30(EcoR I and Kpn I cut) Top10 LB(amp added)

9.3

Colony PCR

Xiaoyang Li

Number Name
1 pmrA-pmrB-LBT 2
2 pmrA-pmrB-LBT 3
3 pmrA-pmrB-LBT 4
4 pmrA-pmrB-LBT 5
5 pmrA-pmrB-LBT 6
6 pmrA-pmrB-LBT 7
7 pmrA-pmrB-LBT 8
8 pmrA-pmrB-LBT 9
9 pmrA-pmrB-LBT 10
10 pmrA-pmrB-LBT 12
demo1
<--*****pmrA-pmrB-LBT X-pBAD30→pmrA-pmrB-LBT X-pmrC-GFP-pBAD30*****PAGE******-->

pmrA-pmrB-LBT X-pBAD30→pmrA-pmrB-LBT X-pmrC-GFP-pBAD30

7.25

PCR

Yiyan Yu

Name Total
LBT 1 to 12 50 μl each
demo1

8.10

Point mutation

Xiaoyang Li

Name Total
pmrA-pmrB-Fe-pBAD30 50 μl

8.20

Restriction Enzyme Digestion

Xiaoyang Li

Name Enzyme
pmrA-pmrB-Fe-pBAD30 AhdI and SacI
LBT 1 AhdI and SacI
LBT 11 AhdI and SacI
demo1

8.20

Transformation

Xiaoyang Li & Yating Hu

Name Backbone Strain Medium
LBT 1 pmrA-pmrB-Fe-pBAD30(AhdI and SacI cut) Top10 LB(amp added)
LBT 11 pmrA-pmrB-Fe-pBAD30(AhdI and SacI cut) Top10 LB(amp added)

8.21

Colony PCR

Xiaoyang Li

Number Name
1 pmrA-pmrB-LBT 1-pBAD30
1 pmrA-pmrB-LBT 11-pBAD30
demo1

Standardization Part

All of our part should be built in one plasmid. Therefore, we use endonuclease and ligase to replace the GFP by Oprf-LBT and Oprf-Si tag.

experiment_circuit

Acknowledgments: