Team:SJTU-BioX-Shanghai/Basic Part-cn

基本元件
总体介绍

今年我们队伍将选择另一个修改过的STAR——STAR3作为今年的基本模块(BBa_K2285020)。 我们今年的项目是建立在2016年帝国理工学校STAR系统的基础的(为了区分我们和他们的工作,我们把他们的STAR系统称为STAR1),然后我们决定建立另一套STAR系统(我们称之为STAR3)来达到多因子检测的目的。简单来说就是两套STAR系统可以控制两个基因回路。更多关于STAR优势和工作原理的信息可以在 这里查阅。

Figure 1. The STAR construct. In the absence of antisense, sense target RNA will form a stem-loop structure, functioning as a terminator and stop the following transcription. When antisense RNA, a mRNA fragment which is the antisense of part of the target RNA, is transcribed, the terminator structure will be disrupted and switch on the inhibited transcription.

为了之后描述的方便,我们在这里引入一些名词用于指代各个原件:

在帝国理工的项目里,基因上游的茎环结构被称为STAR-Target,我们简略称为Target,其互补序列我们称之为Antisense。当我们提到Target1和Antisense1的时候,我们指的是帝国理工构建的那套系统。当我们提到Target3和Antisense3的时候,我们说的是我们今年项目构建的系统。

请浏览我们的 设计页面来获得更多关于STAR3系统设计的信息

另外可以浏览 Target 3 BBa_K2285020 原件页面来获取更多关于STAR系统表征的信息 (Both STAR 1 and STAR 3) system.

我们提交的基本模块
Part Number Type Description Length (bp)
BBa_K2285010 RNA Antisense3+t500 104
BBa_K2285020 Regulatory J23119+Target3 128
Reference
  1. Chappell J, Takahashi MK, Lucks JB. 2015. Creating small transcription activating RNAs. Nat Chem Biol 11:214–220.
  2. Meyer, S., Chappell, J., Sankar, S., Chew, R., and Lucks, J. B. (2016) Improving fold activation of small transcription activating RNAs (STARs) with rational RNA engineering strategies Biotechnol. Bioeng. 113, 216.