Difference between revisions of "Team:HUST-China/Attributions"

 
(13 intermediate revisions by 3 users not shown)
Line 5: Line 5:
 
     <meta http-equiv="X-UA-Compatible" content="IE=edge">
 
     <meta http-equiv="X-UA-Compatible" content="IE=edge">
 
     <meta name="renderer" content="webkit">
 
     <meta name="renderer" content="webkit">
−
     <title>Interlab</title>
+
     <title>Attributions</title>
 
     <link rel="stylesheet" href="https://2017.igem.org/Team:HUST-China/css/bootstrap?action=raw&amp;ctype=text/css">
 
     <link rel="stylesheet" href="https://2017.igem.org/Team:HUST-China/css/bootstrap?action=raw&amp;ctype=text/css">
 
     <script type="text/javascript" src="https://2017.igem.org/Team:HUST-China/js/bootstrap?action=raw&amp;ctype=text/javascript"></script>
 
     <script type="text/javascript" src="https://2017.igem.org/Team:HUST-China/js/bootstrap?action=raw&amp;ctype=text/javascript"></script>
 
     <script type="text/javascript" src="https://2017.igem.org/Team:HUST-China/js/jquery?action=raw&amp;ctype=text/javascript"></script>
 
     <script type="text/javascript" src="https://2017.igem.org/Team:HUST-China/js/jquery?action=raw&amp;ctype=text/javascript"></script>
 
     <link href="https://2017.igem.org/Team:HUST-China/css/return_top?action=raw&amp;ctype=text/css" rel="stylesheet" type="text/css" />
 
     <link href="https://2017.igem.org/Team:HUST-China/css/return_top?action=raw&amp;ctype=text/css" rel="stylesheet" type="text/css" />
−
    <link rel="stylesheet" href="https://2017.igem.org/Team:HUST-China/font-awesome.min.css?action=raw&amp;ctype=text/css">
 
 
     <script type="text/javascript" src="https://2017.igem.org/Team:HUST-China/js/return_top_jquery?action=raw&amp;ctype=text/javascript"></script>
 
     <script type="text/javascript" src="https://2017.igem.org/Team:HUST-China/js/return_top_jquery?action=raw&amp;ctype=text/javascript"></script>
 
     <script src="https://2017.igem.org/Team:HUST-China/js/return_top_script?action=raw&amp;ctype=text/javascript" type="text/javascript"></script>
 
     <script src="https://2017.igem.org/Team:HUST-China/js/return_top_script?action=raw&amp;ctype=text/javascript" type="text/javascript"></script>
Line 307: Line 306:
 
         }
 
         }
 
         div.col-sm-10 div {
 
         div.col-sm-10 div {
−
             min-height: 100px;
+
             min-height: 10px;
 
             font-size: 14px;
 
             font-size: 14px;
 
             text-indent: 28px;
 
             text-indent: 28px;
Line 315: Line 314:
 
         @media screen and (max-width: 810px) {
 
         @media screen and (max-width: 810px) {
 
             #section1, #section2, #section3, #section4, #section5 {
 
             #section1, #section2, #section3, #section4, #section5 {
−
                margin-left: 50px; background-color: #eee; color:#171717;  
+
            background-color: #eee; color:#171717;  
 
             }
 
             }
 
         }
 
         }
  
−
    </style>
+
        body {
−
    <style type="text/css">
+
                position: relative;
−
    a:hover, a:focus{
+
            }
−
         outline: none;
+
        @media (min-width: 768px) {
−
         text-decoration: none;
+
         .menu_logo_1 {
 +
            top: 18px;
 +
            left:10px;
 +
            z-index: 1000;
 +
            opacity: 0.8;
 +
            position: fixed;
 +
         }
 +
        .menu_logo_2 {
 +
            top: 18px;
 +
            left:100px;
 +
            z-index: 1000;
 +
            opacity: 0.8;
 +
            position: fixed;
 
     }
 
     }
−
    #accordion .panel{
 
−
        box-shadow: none;
 
−
        border: none;
 
−
        border-radius:0;
 
−
        margin-bottom: 6px;
 
−
        border-left:5px solid #944f95;
 
 
     }
 
     }
−
     #accordion .panel-heading{
+
 
−
         padding:0;
+
     /* 中等屏幕（桌面显示器，大于等于992px） */
−
         background-color:#fff;
+
    @media (min-width: 992px) {
 +
         .menu_logo_1 {
 +
            top: 18px;
 +
            left:20px;
 +
            z-index: 1000;
 +
            opacity: 0.8;
 +
            position: fixed;
 +
         }
 +
        .menu_logo_2 {
 +
            top: 18px;
 +
            left:110px;
 +
            z-index: 1000;
 +
            opacity: 0.8;
 +
            position: fixed;
 +
        }
 
     }
 
     }
−
     #accordion .panel-title a{
+
 
−
        display: block;
+
     /* 大屏幕（大桌面显示器，大于等于1200px） */
−
        color: #333;
+
    @media (min-width: 1200px) {
−
        font-size: 15px;
+
         .menu_logo_1 {
−
         font-weight: bold;
+
            top: 18px;
−
        padding: 14px 40px;
+
            left:80px;
−
        background: #f5f5f5;
+
            z-index: 1000;
−
        text-transform: uppercase;
+
            opacity: 0.8;
−
        border-bottom: 1px solid #d3d3d3;
+
            position: fixed;
−
        position: relative;
+
         }
−
    }
+
         .menu_logo_2 {
−
    #accordion .panel-title a.collapsed{
+
            top: 18px;
−
        border-top: 0;
+
            left:170px;
−
        color: #333;
+
            z-index: 1000;
−
        background: #eee;
+
            opacity: 0.8;
−
        border-bottom:1px solid transparent;
+
            position: fixed;
−
    }
+
         }
−
    #accordion .panel-title a:before,
+
−
    #accordion .panel-title a.collapsed:before{
+
−
        content: "\f068";
+
−
        font-family: FontAwesome;
+
−
        position: absolute;
+
−
         top: 10px;
+
−
        left: 15px;
+
−
        font-size: 14px;
+
−
        line-height: 24px;
+
−
        color: #944f95;
+
−
    }
+
−
    #accordion .panel-title a.collapsed:before{
+
−
         content: "\f067";
+
−
    }
+
−
    #accordion .panel-body{
+
−
        color: #666464;
+
−
        font-size: 14px;
+
−
        line-height: 20px;
+
−
        border-top: 0 none;
+
−
        background: #eee;
+
−
         padding: 15px 27px;
+
 
     }
 
     }
 +
 
     </style>
 
     </style>
 
</head>
 
</head>
  
−
<body data-spy="scroll" data-target="#myScrollspy" data-offset="20">
+
<body data-spy="scroll" data-target="#myScrollspy" data-offset="20"  style="height:auto;">
−
      <nav class="navbar navbar-default navbar-fixed-top" style="margin-top:15px">
+
    <nav class="navbar navbar-default navbar-fixed-top" style="margin-top:15px">
 
         <div class="container">
 
         <div class="container">
  
 
             <div class="navbar-header">
 
             <div class="navbar-header">
−
                 <a href="https://2017.igem.org/Team:HUST-China" class="navbar-brand logo"><img src="https://static.igem.org/mediawiki/2017/6/64/Team_HUST_China_2017_logo.png" alt="HUST_iGEM_2017_logo"></a>
+
                 <a href="https://2017.igem.org/Team:HUST-China" class="navbar-brand logo menu_logo_1"><img src="https://static.igem.org/mediawiki/2017/6/64/Team_HUST_China_2017_logo.png" alt="HUST_iGEM_2017_logo"></a>
−
                 <a href="https://2017.igem.org" class="navbar-brand logo"><img src="https://static.igem.org/mediawiki/2017/f/f6/IGEM_2017_logo.png" alt="HUST_iGEM_2017_logo"></a>
+
                 <a href="https://2017.igem.org" class="navbar-brand logo menu_logo_2"><img src="https://static.igem.org/mediawiki/2017/f/f6/IGEM_2017_logo.png" alt="HUST_iGEM_2017_logo"></a>
−
                 <button type="button" class="navbar-toggle" data-toggle="collapse" data-target="#navbar-collapse">
+
                 <button type="button" class="navbar-toggle" data-toggle="collapse" data-target="#navbar-collapse" style="background-color: #333; color:#111">
−
                     <span class="glyphicon glyphicon-list"></span>
+
                    <span class="icon-bar"></span>
 +
                    <span class="icon-bar"></span>
 +
                    <span class="icon-bar"></span>
 +
                     <span class="icon-bar"></span>
 
                 </button>
 
                 </button>
 
             </div>
 
             </div>
Line 393: Line 395:
 
             <div class="collapse navbar-collapse" id="navbar-collapse">
 
             <div class="collapse navbar-collapse" id="navbar-collapse">
 
                 <ul class="nav navbar-nav navbar-right">
 
                 <ul class="nav navbar-nav navbar-right">
−
 
+
                    <li><a href="https://2017.igem.org/Team:HUST-China">HOME</a></li>
−
 
+
−
 
+
−
                    <li><a href="https://2017.igem.org/Team:HUST-China">HOME</a></li>
+
 
                     <li class="dropdown">
 
                     <li class="dropdown">
 
                         <a href="#" class="dropdown-toggle" data-toggle="dropdown">
 
                         <a href="#" class="dropdown-toggle" data-toggle="dropdown">
Line 403: Line 402:
 
                         <ul class="dropdown-menu">
 
                         <ul class="dropdown-menu">
 
                             <li><a href="https://2017.igem.org/Team:HUST-China/project/background">Background</a></li>
 
                             <li><a href="https://2017.igem.org/Team:HUST-China/project/background">Background</a></li>
−
                             <li><a href="https://2017.igem.org/Team:HUST-China/Description">Description</a></li>                                        
+
                             <li><a href="https://2017.igem.org/Team:HUST-China/Description">Description</a></li>                                  
 
                             <li><a href="https://2017.igem.org/Team:HUST-China/Safety">Safety</a></li>
 
                             <li><a href="https://2017.igem.org/Team:HUST-China/Safety">Safety</a></li>
 +
                            <li><a href="https://2017.igem.org/Team:HUST-China/Demonstrate">Demonstrate</a></li>
 
                         </ul>
 
                         </ul>
 
                     </li>
 
                     </li>
−
                     <li class="dropdown active">
+
                     <li class="dropdown">
 
                         <a href="#" class="dropdown-toggle" data-toggle="dropdown">
 
                         <a href="#" class="dropdown-toggle" data-toggle="dropdown">
 
                             WETLAB <b class="caret"></b>
 
                             WETLAB <b class="caret"></b>
Line 420: Line 420:
 
                     </li>
 
                     </li>
 
                     <li class="dropdown">
 
                     <li class="dropdown">
−
                         <a href="https://2017.igem.org/Team:HUST-China/Modeling" >
+
                         <a href="https://2017.igem.org/Team:HUST-China/Model" >
−
                             MODELING
+
                             MODEL
 
                         </a>
 
                         </a>
 
                     </li>
 
                     </li>
 
                     <li class="dropdown">
 
                     <li class="dropdown">
−
                        <a href="https://2017.igem.org/Team:HUST-China/Parts">
+
                        <a href="#" class="dropdown-toggle" data-toggle="dropdown">
−
                             PARTS
+
                             PARTS<b class="caret"></b>
 
                         </a>
 
                         </a>
 +
                        <ul class="dropdown-menu">
 +
                            <li><a href="https://2017.igem.org/Team:HUST-China/Basic part">Basic part</a></li>
 +
                            <li><a href="https://2017.igem.org/Team:HUST-China/Composite part">Composite part</a></li>
 +
                            <li><a href="https://2017.igem.org/Team:HUST-China/Part collection">Part collection</a></li>
 +
                        </ul>
 
                     </li>
 
                     </li>
 
                     <li class="dropdown">
 
                     <li class="dropdown">
−
                         <a href="https://2017.igem.org/Team:HUST-China/Human_Practices">
+
                         <a href="#" class="dropdown-toggle" data-toggle="dropdown">
−
                             HUMAN PRACTICES
+
                             HP<b class="caret"></b>
 
                         </a>
 
                         </a>
 +
                        <ul class="dropdown-menu">
 +
                            <li><a href="https://2017.igem.org/Team:HUST-China/Collaborations"> Collaborations</a></li>
 +
                            <li><a href="https://2017.igem.org/Team:HUST-China/HP/Silver">HP/Silver</a></li>
 +
                            <li><a href="https://2017.igem.org/Team:HUST-China/Engagement">Engagement</a></li>
 +
                        </ul>
 
                     </li>
 
                     </li>
−
                     <li class="dropdown">
+
                     <li class="dropdown active">
 
                         <a href="#" class="dropdown-toggle" data-toggle="dropdown">
 
                         <a href="#" class="dropdown-toggle" data-toggle="dropdown">
 
                             TEAM <b class="caret"></b>
 
                             TEAM <b class="caret"></b>
Line 443: Line 453:
 
                         </ul>
 
                         </ul>
 
                     </li>
 
                     </li>
 +
 +
 
                 </ul>   
 
                 </ul>   
 
             </div>
 
             </div>
 
         </div>
 
         </div>
 
     </nav>
 
     </nav>
−
 
  
 
     <div class="tab1" id="section0" style="width:100%;margin-top: 65px;">
 
     <div class="tab1" id="section0" style="width:100%;margin-top: 65px;">
−
             <h1 class="tab-h1" ><strong>「Interlab」</strong></h1>
+
             <h1 class="tab-h1" ><strong>「Attributions」</strong></h1>
 
     </div>
 
     </div>
  
Line 459: Line 470:
 
                 <div class="collapse navbar-collapse" id="navbar-collapse">
 
                 <div class="collapse navbar-collapse" id="navbar-collapse">
 
                 <ul class="nav nav-pills nav-stacked" style="font-size:12px; text-align:center; background:#ccc;">
 
                 <ul class="nav nav-pills nav-stacked" style="font-size:12px; text-align:center; background:#ccc;">
−
                     <li class="active"><a href="#section1">Introduction</a></li>
+
                     <li class="active"><a href="#section1">Project Design</a></li>
−
                     <li><a href="#section2">Provenance and Release</a></li>
+
                     <li><a href="#section2">Wet Lab Work</a></li>
−
                     <li><a href="#section3">Chassis and Safety </a></li>
+
                     <li><a href="#section3">Modeling </a></li>
−
                     <li><a href="#section4">Instrument</a></li>
+
                     <li><a href="#section4">Wiki&Poster</a></li>
−
                     <li><a href="#section5">Calibration Protocol</a></li>  
+
                     <li><a href="#section5">Human Practices</a></li>
 +
                    <li><a href="#section6">Advisors</a></li>
 +
                    <li><a href="#section7">Special Thanks</a></li>
 +
                    <li><a href="#section8">Acknowledgments</a></li>
 +
 
 
                 </ul>
 
                 </ul>
 
                 </div>   
 
                 </div>   
 
                 </div>       
 
                 </div>       
 
             </nav>
 
             </nav>
−
             <div class="col-sm-8">
+
             <div class="col-sm-8 text">
 
                 <div id="section1" style="border: solid 1px #666; margin:5px;border-radius:10px;overflow: hidden;">     
 
                 <div id="section1" style="border: solid 1px #666; margin:5px;border-radius:10px;overflow: hidden;">     
−
                     <h3 style="background-color:#ce6b9a;color:#ffffff; padding:10px;letter-spacing:1px;margin-top:0;">Introduction</h3>
+
                     <h3 style="background-color:#ce6b9a;color:#ffffff; padding:10px;letter-spacing:1px;margin-top:0;">Project Design</h3>
−
                     <p style="padding:10px">It is significant for synthetic biology to develop a reliable and repeatable measurement, the same to all the other engineering disciplines. We HUST-China have volunteered to test some RBS devices (BCDs) that are intended to make gene expression more precise and reliable by measure the expression level of GFP, in order to help the iGEM community collect data about how reliable will these devices turn out to be in labs around the world.
+
                     <p>All the team members are involved in the design by participating in brainstorming, querying literature and doing early experiments.
 
                     </p>
 
                     </p>
 
                 </div>
 
                 </div>
 +
 
                 <div id="section2" style="border: solid 1px #666; margin:5px;border-radius:10px;overflow: hidden;">  
 
                 <div id="section2" style="border: solid 1px #666; margin:5px;border-radius:10px;overflow: hidden;">  
−
                     <h3 style="background-color:#ce6b9a;color:#ffffff; padding:10px;letter-spacing:1px; margin-top:0;">Provenance and Release</h3>
+
                     <h3 style="background-color:#ce6b9a;color:#ffffff; padding:10px;letter-spacing:1px; margin-top:0;">Wet Lab Work</h3>
−
                    <h4><strong>①Individuals responsible for conducting InterLab study</strong> </h4>
+
                     <p>Xiao Deng, Yiyan Yu, Long Cheng, Yubei Sun, Xiaoyang Li, Ziyang Xiao, Jie Mei, Haibo Huang,</p>
−
                     <div class="table-responsive" style="padding: 10px 100px; text-align: center;">
+
                    <p>Zichun Weng, Yating Hu, Qingyang Yu, Huiping Shi, Kangyuan Yu, Nan Hu, Shaofeng Liao,</p>
−
                        <table class="table .table-hover">
+
                    <p> Efan Wang, Ting Peng, Ziyi Li, Tongtong Zhu, Yuqi Wu.</p>  
−
                          <thead>
+
                </div>
−
                              <tr>
+
 
−
                                <th style="text-align: center;">Individuals</th>
+
−
                                <th style="text-align: center;">Interlab Part</th>
+
−
                              </tr>
+
−
                          </thead>
+
−
                          <tbody>
+
−
                              <tr>
+
−
                                <td>Kangyuan Yu, Haibo Huang, Ziyang Xiao, Shaofeng Liao</td>
+
−
                                <td>created the devices</td>
+
−
                              </tr>
+
−
                              <tr>
+
−
                                <td>Efan Wang, Long Cheng, HuiPing Shi </td>
+
−
                                <td>conducted the measurements</td>
+
−
                              </tr>
+
−
                              <tr>
+
−
                                <td>Efan Wang</td>
+
−
                                <td>processed the data</td>
+
−
                              </tr>
+
−
                          </tbody>
+
−
                        </table>
+
−
                    </div>
+
−
                    <h4><strong> ②Corresponding email</strong> </h4>
+
−
                    <div class="table-responsive" style="padding: 10px 100px; text-align: center;">
+
−
                        <table class="table .table-hover">
+
−
                          <thead>
+
−
                              <tr>
+
−
                                <th style="text-align: center;">Individuals </th>
+
−
                                <th style="text-align: center;">Emails</th>
+
−
                              </tr>
+
−
                          </thead>
+
−
                          <tbody>
+
−
                              <tr>
+
−
                                <td>Efan Wang</td>
+
−
                                <td>erfan@hust.edu.cn</td>
+
−
                              </tr> 
+
−
                              <tr>
+
−
                                <td>Kangyuan Yu</td>
+
−
                                <td>985930862@qq.com</td>
+
−
                              </tr>
+
−
                              <tr>
+
−
                                <td>Haibo Huang </td>
+
−
                                <td>u201512127@hust.edu.cn</td>
+
−
                              </tr>
+
−
                              <tr>
+
−
                                <td>Ziyang Xiao</td>
+
−
                                <td>372657289@qq.com</td>
+
−
                              </tr>
+
−
                              <tr>
+
−
                                <td>Shaofeng Liao</td>
+
−
                                <td> 15827233830@qq.com</td>
+
−
                              </tr>
+
−
                              <tr>
+
−
                                <td>HuiPing Shi</td>
+
−
                                <td>172295915@qq.com</td>
+
−
                              </tr>
+
−
                              <tr>
+
−
                                <td>Long Cheng</td>
+
−
                                <td>u201512127@hust.edu.cn</td>
+
−
                              </tr>
+
−
                          </tbody>
+
−
                        </table>
+
−
                    </div>
+
−
                </div>       
+
 
                 <div id="section3" style="border: solid 1px #666; margin:5px;border-radius:10px;overflow: hidden;">         
 
                 <div id="section3" style="border: solid 1px #666; margin:5px;border-radius:10px;overflow: hidden;">         
−
                     <h3 style="background-color:#ce6b9a;color:#ffffff; padding:10px;letter-spacing:1px; margin-top:0;">Chassis and Safety</h3>
+
                     <h3 style="background-color:#ce6b9a;color:#ffffff; padding:10px;letter-spacing:1px; margin-top:0;">Modeling</h3>
−
                    <h4><strong> What chassis did you use?</strong> </h4>
+
                     <p>Our modeling jobs are mainly taken by Kai Kang and Yuanzhe Shao.</p>
−
                     <p>Escherichia coli DH5alpha</p>
+
−
                    <h4><strong> What Biosafety Level is your chassis? </strong> </h4>
+
−
                    <p>BSL1</p>
+
−
                    <h4><strong>What PPE did you utilize during your experiments? </strong></h4>
+
−
                    <p>Tianming gloves</p>
+
−
                    <p>Songxinjiujiu labcoats</p>
+
 
                 </div>
 
                 </div>
 
                 <div id="section4" style="border: solid 1px #666; margin:5px;border-radius:10px;overflow: hidden;">         
 
                 <div id="section4" style="border: solid 1px #666; margin:5px;border-radius:10px;overflow: hidden;">         
−
                     <h3 style="background-color:#ce6b9a;color:#ffffff; padding:10px;letter-spacing:1px; margin-top:0;">Instrument</h3>
+
                     <h3 style="background-color:#ce6b9a;color:#ffffff; padding:10px;letter-spacing:1px; margin-top:0;">Wiki&Poster</h3>  
−
                     <h4><strong> What instrument did you use during your measurements? </strong> </h4>
+
                     <p>The content of our wiki was provided by all the members.</p>
−
                     <p>plate reader</p>
+
                     <p>Wiki framework was done by Longhao Jia.</p>
−
                     <h4><strong> Please provide the brand and model of your instrument.</strong> </h4>
+
                     <p>Art and design were done by Wenjing Li.</p>
−
                    <p>Flexstation 3</p>
+
 
                 </div>       
 
                 </div>       
−
                 <div id="section5" style="border: solid 1px #666; margin:5px;border-radius:10px;overflow: hidden;">        
+
                 <div id="section5" style="border: solid 1px #666; margin:5px;border-radius:10px;overflow: hidden;">  
−
                     <h3 style="background-color:#ce6b9a;color:#ffffff; padding:10px;letter-spacing:1px; margin-top:0;">Calibration Protocol</h3>
+
                     <h3 style="background-color:#ce6b9a;color:#ffffff; padding:10px;letter-spacing:1px; margin-top:0;">Human Practices</h3>
 +
                    <p>Yuanzhe Shao, Yating Hu, Ziyi Li, Yiyan Yu</p>     
 +
                </div>
 +
                <div id="section6" style="border: solid 1px #666; margin:5px;border-radius:10px;overflow: hidden;">
 +
                    <h3 style="background-color:#ce6b9a;color:#ffffff; padding:10px;letter-spacing:1px; margin-top:0;">Advisors</h3>
 +
                    <p>Professor Yunjun Yan</p>
 +
                    <p>Professor Kang Ning</p>
 +
                    <p>Dr Yi Zhan</p>
 +
                </div>
  
 +
                <div id="section7" style="border: solid 1px #666; margin:5px;border-radius:10px;overflow: hidden;">
 +
                    <h3 style="background-color:#ce6b9a;color:#ffffff; padding:10px;letter-spacing:1px; margin-top:0;">Special Thanks</h3>
 +
                    <p>Especially thanks Dr Zhiming Hu, Dr Wu Liu and Dr Guanlin Li for their direct guide in experiments. </p>
 +
                    <p>Thanks Dr Xuxia Wang, Dr Kai Li, Dr Jianhua Wang, Dr Qinghua Zhou, Xingrong Fang, Xingfeng Han, Fei Wang, Yangge Qiao for their assistance and support to our experiments. </p>
 +
                    <p>Thanks. </p>
 +
                </div>
  
−
                    <h4><strong>  A1. Protocol for Optical Density (OD600) Standard Measurement</strong> </h4>
+
                <div id="section8" style="border: solid 1px #666; margin:5px;border-radius:10px;overflow: hidden;">
−
                     <h5><strong>Did you use pathlength correction during measurement? </strong> </h5>
+
                     <h3 style="background-color:#ce6b9a;color:#ffffff; padding:10px;letter-spacing:1px; margin-top:0;">Acknowledgments</h3>  
−
                     <p>Yes</p>
+
                     <p>This project was supported by Huazhong University of science and technology, College of Life Science and Technology HUST, Qiming college of HUST.</p>
−
                    <h5><strong>Number of flashes per well  </strong> </h5>
+
                     <p>Mathworks provided software supply.</p>
−
                    <p>6</p>
+
                     <p>TsingKe and TianYiHuiYuan provided primer synthesis and sequencing service.</p>
−
                    <h5><strong>Orbital averaging (mm)  </strong> </h5>
+
                     <p>IDT provided DNA product.</p>
−
                     <p>600</p>
+
                </div>
−
                    <h5><strong> What temperature setting did you use during the measurement? </strong> </h5>
+
−
                     <p>22℃</p>
+
−
                    <h5><strong>What type of 96-well plate did you use? </strong> </h5>
+
−
                     <p>Black plate (preferred)</p>
+
−
                    <h5><strong> Did your plate have flat-bottomed or round-bottomed wells? </strong> </h5>
+
−
                    <p>Flat</p>
+
  
−
 
−
                    <h4><strong> A2. Measurement Steps</strong></h4>
 
−
 
−
                      <div class="demo">
 
−
                            <div class="container">
 
−
                                <div class="row">
 
−
                                    <div class="col-md-6">
 
−
                                        <div class="panel-group" id="accordion" role="tablist" aria-multiselectable="true">
 
−
                                            <div class="panel panel-default">
 
−
                                                <div class="panel-heading" role="tab" id="headingTwo">
 
−
                                                    <h4 class="panel-title">
 
−
                                                        <a class="collapsed" role="button" data-toggle="collapse" data-parent="#accordion" href="#collapseTwo" aria-expanded="false" aria-controls="collapseTwo">
 
−
                                                            Section 2
 
−
                                                        </a>
 
−
                                                    </h4>
 
−
                                                </div>
 
−
                                                <div id="collapseTwo" class="panel-collapse collapse" role="tabpanel" aria-labelledby="headingTwo">
 
−
                                                    <div class="panel-body">
 
−
                                                        Lorem ipsum dolor sit amet, consectetur adipiscing elit. Aenean congue erat in luctus pretium. Praesent suscipit tempor consequat. Nam ac enim sit amet justo ultricies condimentum. Ut condimentum, risus at hendrerit ultricies, arcu diam lobortis metus, eu aliquam quam metus ut enim. Aliquam at mi quis tortor semper laoreet ut.
 
−
                                                    </div>
 
−
                                                </div>
 
−
                                            </div>
 
−
                                        </div>
 
−
                                    </div>
 
−
                                </div>
 
−
                            </div>
 
−
                        </div>
 
−
 
−
 
−
 
−
                                <li class="dropdown" style="list-style-type:none;">
 
−
                                    <button href="#" class="dropdown-toggle" data-toggle="dropdown">
 
−
                                        More details <b class="caret"></b>
 
−
                                    </button>
 
−
                                    <ul class="dropdown-menu container" style="padding: 10px;background:#ccc;">
 
−
                                        <li>① Prepare your 96 well plate</li>
 
−
                                        <li>②Add 100 μl LUDOX 100 % into wells A1, B1, C1, D1</li>
 
−
                                        <li>③Add 100 μl of dH2O into A2, B2, C2, D2</li>
 
−
                                        <li>④Measure absorbance 600 nm of all samples in all standard measurement modes in instrument</li>
 
−
                                        <li>⑤Import data into "Abs600" blue cells in provided Excel calibration sheet</li>
 
−
                                    </ul>
 
−
                                </li>
 
−
 
−
                   
 
−
                    <h4><strong>  B1. Protocol for FIuorescein Fluoresence standard curve</strong> </h4>
 
−
                    <h5><strong>Did you use pathlength correction during measurement? </strong> </h5>
 
−
                    <p>Yes</p>
 
−
                    <h5><strong>Number of flashes per well  </strong> </h5>
 
−
                    <p>6</p>
 
−
                    <h5><strong>What gain setting did you use?  </strong> </h5>
 
−
                    <p>Automatic</p>
 
−
                    <h5><strong> If you used a filter, what light wavelengths did it pass?  </strong> </h5>
 
−
                    <p>530nm</p>
 
−
                    <h5><strong>Emission wavelength </strong> </h5>
 
−
                    <p>530nm</p>
 
−
                    <h5><strong> Excitation wavelength </strong> </h5>
 
−
                    <p>485nm</p>
 
−
                    <h5><strong> Fluorescence reading  </strong> </h5>
 
−
                    <p>Bottom optic</p>
 
−
                    <h5><strong>What type of 96-well plate did you use? </strong> </h5>
 
−
                    <p>Black plate (preferred)</p>
 
−
                    <h5><strong> Did your plate have flat-bottomed or round-bottomed wells? </strong> </h5>
 
−
                    <p>Flat</p>
 
−
                    <h5><strong> What temperature setting did you use during the measurement?  </strong> </h5>
 
−
                    <p>22℃</p>
 
−
 
−
                    <h4><strong> B2. Measurement Steps</strong></h4>
 
−
                    <h5><strong>  Part 1: Prepare the Fluorescein stock solution </strong> </h5>
 
−
                            <li class="dropdown" style="list-style-type:none;">
 
−
                                <button href="#" class="dropdown-toggle" data-toggle="dropdown">
 
−
                                    More details <b class="caret"></b>
 
−
                                </button>
 
−
                                <ul class="dropdown-menu" style="padding: 10px; background:#ccc;">
 
−
                                    <li>①  Spin down fluorescein stock tube to make sure pellet is at the bottom of tube.</li>
 
−
                                    <li>②  Prepare 2x fluorescein stock solution (100 μM) by resuspending fluorescein in 1ml of 1xPBS</li>
 
−
                                    <li>③  Dilute the 2x fluorescein stock solution using 1xPBS to make a 1x fluorescein solution (final concentration is 50 μM).</li>
 
−
                                    <li>④  *Illustration of serial dilution samples in 96 well plate or cuvettes: value decreases by 2-fold with each column (50% in column 2, 25% in column 3, 12.5% in column 4, etc.)</li>
 
−
                                    <li>⑤Import data into "Abs600" blue cells in provided Excel calibration sheet</li>
 
−
                                </ul>
 
−
                            </li>
 
−
   
 
−
                </div>
 
 
             </div>
 
             </div>
  
Line 680: Line 553:
 
         </div>
 
         </div>
 
     </div>
 
     </div>
−
   
 
  
−
      
+
     <footer id="footer">
 +
      <div class="container" style="text-align: left">
 +
            <h3><strong>Acknowledgments:</strong></h3>
 +
            <img style="max-width: 100%; height:auto; display: block " src="https://static.igem.org/mediawiki/2017/8/88/2017_HUST_China_seven_logo.png" /> 
 +
        </div>
 +
    </footer>   
 
     <script type="text/javascript">
 
     <script type="text/javascript">
  

Latest revision as of 14:28, 1 November 2017

Attributions

「Attributions」

Project Design

All the team members are involved in the design by participating in brainstorming, querying literature and doing early experiments.

Wet Lab Work

Xiao Deng, Yiyan Yu, Long Cheng, Yubei Sun, Xiaoyang Li, Ziyang Xiao, Jie Mei, Haibo Huang,

Zichun Weng, Yating Hu, Qingyang Yu, Huiping Shi, Kangyuan Yu, Nan Hu, Shaofeng Liao,

Efan Wang, Ting Peng, Ziyi Li, Tongtong Zhu, Yuqi Wu.

Modeling

Our modeling jobs are mainly taken by Kai Kang and Yuanzhe Shao.

Wiki&Poster

The content of our wiki was provided by all the members.

Wiki framework was done by Longhao Jia.

Art and design were done by Wenjing Li.

Human Practices

Yuanzhe Shao, Yating Hu, Ziyi Li, Yiyan Yu

Advisors

Professor Yunjun Yan

Professor Kang Ning

Dr Yi Zhan

Special Thanks

Especially thanks Dr Zhiming Hu, Dr Wu Liu and Dr Guanlin Li for their direct guide in experiments.

Thanks Dr Xuxia Wang, Dr Kai Li, Dr Jianhua Wang, Dr Qinghua Zhou, Xingrong Fang, Xingfeng Han, Fei Wang, Yangge Qiao for their assistance and support to our experiments.

Thanks.

Acknowledgments

This project was supported by Huazhong University of science and technology, College of Life Science and Technology HUST, Qiming college of HUST.

Mathworks provided software supply.

TsingKe and TianYiHuiYuan provided primer synthesis and sequencing service.

IDT provided DNA product.

Acknowledgments: