Difference between revisions of "Team:Hamburg/Parts"

(Prototype team page)
 
 
(31 intermediate revisions by 3 users not shown)
Line 1: Line 1:
−
{{Hamburg}}
+
{{Requirements}}
 +
{{Team:Hamburg/CSS}}
 +
<!--- {{Team:Hamburg/javascript/main}} --->
 +
{{Team:Hamburg/Templates/navbar}}
 +
 
 +
<!--- ---------Main Content---------- --->
 
<html>
 
<html>
  
−
 
+
<div class="section_std">
−
 
+
  <div class="main_block">
−
 
+
    <h1 class="h1" style="margin-top:100px;">
−
 
+
    Parts
−
 
+
    </h1>
−
<div class="column full_size">
+
  </div>
−
 
+
−
<h1>Parts</h1>
+
−
 
+
−
<p>Each team will make new parts during iGEM and will submit them to the Registry of Standard Biological Parts. The iGEM software provides an easy way to present the parts your team has created. The <code>&lt;groupparts&gt;</code> tag (see below) will generate a table with all of the parts that your team adds to your team sandbox.</p>
+
−
<p>Remember that the goal of proper part documentation is to describe and define a part, so that it can be used without needing to refer to the primary literature. Registry users in future years should be able to read your documentation and be able to use the part successfully. Also, you should provide proper references to acknowledge previous authors and to provide for users who wish to know more.</p>
+
−
 
+
−
 
+
 
</div>
 
</div>
  
 +
<!--- ---------Section 1--------- --->
  
 +
<div class="section_std">
 +
<div class="main_block"> 
 +
  <h2 class="h2" style="margin-bottom:70px;">
 +
  </h2>
  
 +
<h2 class="h2">Full Part table<h2>
 +
  <table class="table">
 +
 
 +
   
 +
        <thead>
 +
            <tr>
 +
                <th>
 +
                  <div class="text_block text"Part Name </div>
 +
                </th>
 +
                <th>
 +
                    Part Number
 +
                </th>
 +
                <th>
 +
                    Type
 +
                </th>
 +
                <th>
 +
                    Designer
 +
                </th>
 +
                <th>
 +
                    Length
 +
                </th>
 +
            </tr>
 +
        </thead>
 +
        <tbody>
 +
            <tr>
 +
                <td>
 +
                    Nor Pyochelin Synthesis Cluster
 +
                </td>
 +
                <td>
 +
                    <a href="http://parts.igem.org/Part:BBa_K2401000"style="color: grey">BBa_K2401000</a>
 +
                </td>
 +
                <td>
 +
                    Composite
 +
                </td>
 +
                <td>
 +
                    A. Nicolai, S. Ricke
 +
                </td>
 +
                <td>
 +
                    10760 bp
 +
                </td>
 +
            </tr>
 +
            <tr>
 +
                <td>
 +
                    Yersiniabactin inner Membrane Transporter
 +
                </td>
 +
                <td>
 +
                    <a href="http://parts.igem.org/Part:BBa_K2401005"style="color: grey">BBa_K2401005</a>
 +
                </td>
 +
                <td>
 +
                    Composite
 +
                </td>
 +
                <td>
 +
                    A. Nicolai, S. Ricke
 +
                </td>
 +
                <td>
 +
                    3956 bp
 +
                </td>
 +
            </tr>
 +
            <tr>
 +
                <td>
 +
                    Siderophore outer Membrane Transporter
 +
                </td>
 +
                <td>
 +
                    <a href="http://parts.igem.org/Part:BBa_K2401011"style="color: grey">BBa_K2401011</a>
 +
                </td>
 +
                <td>
 +
                    Composite
 +
                </td>
 +
                <td>
 +
                    A. Nicolai, S. Ricke
 +
                </td>
 +
                <td>
 +
                    5724 bp
 +
                </td>
 +
            </tr>
 +
            <tr>
 +
                <td>
 +
                    HMWP1 Yersiniabactin Synthetase part 2
 +
                </td>
 +
                <td>
 +
                    <a href="http://parts.igem.org/Part:BBa_K2401012"style="color: grey">BBa_K2401012</a>
 +
                </td>
 +
                <td>
 +
                    Composite
 +
                </td>
 +
                <td>
 +
                    A. Nicolai, S. Ricke
 +
                </td>
 +
                <td>
 +
                  10731  bp
 +
                </td>
 +
            </tr>
 +
            <tr>
 +
                <td>
 +
                    HMWP2 Yersiniabactin Synthetase Part 1
 +
                </td>
 +
                <td>
 +
                    <a href="http://parts.igem.org/Part:BBa_K2401001"style="color: grey">BBa_K2401001</a>
 +
                </td>
 +
                <td>
 +
                    Basic
 +
                </td>
 +
                <td>
 +
                    A. Nicolai, S. Ricke
 +
                </td>
 +
                <td>
 +
                  6107  bp
 +
                </td>
 +
            </tr>
 +
            <tr>
 +
                <td>
 +
                    2,3-Dihydroxybenzoate-AMP ligase
 +
                </td>
 +
                <td>
 +
                    <a href="http://parts.igem.org/Part:BBa_K2401002"style="color: grey">BBa_K2401002</a>
 +
                </td>
 +
                <td>
 +
                    Basic
 +
                </td>
 +
                <td>
 +
                    A. Nicolai, S. Ricke
 +
                </td>
 +
                <td>
 +
                    1578 bp
 +
                </td>
 +
            </tr>
 +
            <tr>
 +
                <td>
 +
                    Thiazolinyl imide reductase
 +
                </td>
 +
                <td>
 +
                    <a href="http://parts.igem.org/Part:BBa_K2401013"style="color: grey">BBa_K2401013</a>
 +
                </td>
 +
                <td>
 +
                    Basic
 +
                </td>
 +
                <td>
 +
                    A. Nicolai, S. Ricke
 +
                </td>
 +
                <td>
 +
                    1101 bp
 +
                </td>
 +
            </tr>
 +
            <tr>
 +
                <td>
 +
                    Surfactin imide reductase
 +
                </td>
 +
                <td>
 +
                    <a href="http://parts.igem.org/Part:BBa_K2401004"style="color: grey">BBa_K2401004</a>
 +
                </td>
 +
                <td>
 +
                    Basic
 +
                </td>
 +
                <td>
 +
                    A. Nicolai, S. Ricke
 +
                </td>
 +
                <td>
 +
                    498 bp
 +
                </td>
 +
            </tr>
 +
            <tr>
 +
                <td>
 +
                    ABC-Siderophore-Transporter
 +
                </td>
 +
                <td>
 +
                    <a href="http://parts.igem.org/Part:BBa_K2401006"style="color: grey">BBa_K2401006</a>
 +
                </td>
 +
                <td>
 +
                    Basic
 +
                </td>
 +
                <td>
 +
                    A. Nicolai, S. Ricke
 +
                </td>
 +
                <td>
 +
                    1789 bp
 +
                </td>
 +
            </tr>
 +
            <tr>
 +
                <td>
 +
                    ATP-Siderophore-Bindingpermease
 +
                </td>
 +
                <td>
 +
                    <a href="http://parts.igem.org/Part:BBa_K2401007"style="color: grey">BBa_K2401007</a>
 +
                </td>
 +
                <td>
 +
                    Basic
 +
                </td>
 +
                <td>
 +
                    A. Nicolai, S. Ricke
 +
                </td>
 +
                <td>
 +
                    1801 bp
 +
                </td>
 +
            </tr>
 +
            <tr>
 +
                <td>
 +
                    HMWP1 Yersiniabactin Synthetase Part 2
 +
                </td>
 +
                <td>
 +
                    <a href="http://parts.igem.org/Part:BBa_K2401008"style="color: grey">BBa_K2401008</a>
 +
                </td>
 +
                <td>
 +
                    Basic
 +
                </td>
 +
                <td>
 +
                    A. Nicolai, S. Ricke
 +
                </td>
 +
                <td>
 +
                    9492 bp
 +
                </td>
 +
            </tr>
 +
            <tr>
 +
                <td>
 +
                    FyuA TonB Yersiniabactin outermembrane Receptor
 +
                </td>
 +
                <td>
 +
                    <a href="http://parts.igem.org/Part:BBa_K2401010"style="color: grey">BBa_K2401010</a>
 +
                </td>
 +
                <td>
 +
                    Basic
 +
                </td>
 +
                <td>
 +
                    A. Nicolai, S. Ricke
 +
                </td>
 +
                <td>
 +
                    2022 bp
 +
                </td>
 +
            </tr>
 +
            <tr>
 +
                <td>
 +
                    FptA Pyochelin outermembrane Receptor
 +
                </td>
 +
                <td>
 +
                    <a href="http://parts.igem.org/Part:BBa_K2401009"style="color: grey">BBa_K2401009</a>
 +
                </td>
 +
                <td>
 +
                    Basic
 +
                </td>
 +
                <td>
 +
                    A. Nicolai, S. Ricke
 +
                </td>
 +
                <td>
 +
                    2160 bp
 +
                </td>
 +
            </tr>
 +
            <tr>
 +
                <td>
 +
                    PchR Pyochelin regulator
 +
                </td>
 +
                <td>
 +
                    <a href="http://parts.igem.org/Part:BBa_K2401003"style="color: grey">BBa_K2401003</a>
 +
                </td>
 +
                <td>
 +
                    Regulatory
 +
                </td>
 +
                <td>
 +
                    A. Nicolai, S. Ricke
 +
                </td>
 +
                <td>
 +
                    960 bp
 +
                </td>
 +
            </tr>
 +
            <tr>
 +
                <td>
 +
                    AraC like Yersiniabactin regulator
 +
                </td>
 +
                <td>
 +
                    <a href="http://parts.igem.org/Part:BBa_K2401014"style="color: grey">BBa_K2401014</a>
 +
                </td>
 +
                <td>
 +
                    Regulatory
 +
                </td>
 +
                <td>
 +
                    A. Nicolai, S. Ricke
 +
                </td>
 +
                <td>
 +
                    891 bp
 +
                </td>
 +
            </tr>
  
 +
        </tbody>
 +
      </div>
 +
</table>
  
−
<div class="column half_size">
+
    </div>
−
<div class="highlight">
+
  </div>
−
<h5>Note</h5>
+
−
<p>Note that parts must be documented on the <a href="http://parts.igem.org/Main_Page"> Registry</a>. This page serves to <i>showcase</i> the parts you have made. Future teams and other users and are much more likely to find parts by looking in the Registry than by looking at your team wiki.</p>
+
−
</div>
+
 
</div>
 
</div>
  
 +
</html>
  
  
 +
<!--- ----------Footer---------- --->
  
−
<div class="column half_size">
+
<html>
  
−
<h5>Adding parts to the registry</h5>
+
<div class="footer">
−
<p>You can add parts to the Registry at our <a href="http://parts.igem.org/Add_a_Part_to_the_Registry">Add a Part to the Registry</a> link.</p>
+
  <Sponsored_by class="h6">Sponsored by
−
<p>We encourage teams to start completing documentation for their parts on the Registry as soon as you have it available. The sooner you put up your parts, the better you will remember all the details about your parts. Remember, you don't need to send us the DNA sample before you create an entry for a part on the Registry. (However, you <b>do</b> need to send us the DNA sample before the Jamboree. If you don't send us a DNA sample of a part, that part will not be eligible for awards and medal criteria.)</p>
+
  </Sponsored_by>
−
</div>
+
  
 +
    <div class="footer-sponsors">
 +
                    <ul>
 +
                        <li>
 +
                            <img src="https://static.igem.org/mediawiki/2017/7/7a/UhhBbraun.jpg" />
 +
                        </li>
 +
                        <li>
 +
                            <img src="https://static.igem.org/mediawiki/2017/b/b2/UhhRoth.jpg"/>
 +
                        </li>
 +
                        <li>
 +
                            <img src="https://static.igem.org/mediawiki/2017/1/18/UhhFlui.jpg" />
 +
                        </li>
 +
                        <li>
 +
                            <img src="https://static.igem.org/mediawiki/2017/thumb/c/c6/UhhCss.jpg/800px-UhhCss.jpg.png" />
 +
                        </li>
 +
                        <li>
 +
                            <img src="https://static.igem.org/mediawiki/2017/thumb/1/1d/UhhJung.jpg/800px-UhhJung.jpg" />
 +
                        </li>
 +
                        <li>
 +
                            <img src="https://static.igem.org/mediawiki/2017/6/60/UhhEpp.jpg" />
 +
                        </li>
  
 +
                    </ul>
 +
<ul>
 +
                        <li>
 +
                            <img src="https://static.igem.org/mediawiki/2016/b/b7/T--Hamburg--UHHLogo.png" />
 +
                        </li>
 +
                        <li>
 +
                            <img src="https://static.igem.org/mediawiki/2016/7/79/T--Hamburg--Logo_Alumni_Logo.png" />
 +
                        </li>
 +
                        <li>
 +
                            <img src="https://static.igem.org/mediawiki/2016/5/5c/T--Hamburg--logo_NEB.svg" />
 +
                        </li>
 +
                        <li>
 +
                            <img src="https://static.igem.org/mediawiki/2016/7/77/T--Hamburg--logo_GATC.png" />
 +
                        </li>
 +
                        <li>
 +
                            <img src="https://static.igem.org/mediawiki/2016/8/85/T--Hamburg--IDT_Logo_2016-01.png" />
 +
                        </li>
 +
                        <li>
 +
                            <img src="https://static.igem.org/mediawiki/2016/d/dd/T--Virginia--SnapGene.png" />
 +
                        </li>
 +
                    </ul>
  
−
 
+
    </div>
−
 
+
−
<div class="column half_size">
+
−
 
+
−
<h5>What information do I need to start putting my parts on the Registry?</h5>
+
−
<p>The information needed to initially create a part on the Registry is:</p>
+
−
<ul>
+
−
<li>Part Name</li>
+
−
<li>Part type</li>
+
−
<li>Creator</li>
+
−
<li>Sequence</li>
+
−
<li>Short Description (60 characters on what the DNA does)</li>
+
−
<li>Long Description (Longer description of what the DNA does)</li>
+
−
<li>Design considerations</li>
+
−
</ul>
+
−
 
+
−
<p>
+
−
We encourage you to put up <em>much more</em> information as you gather it over the summer. If you have images, plots, characterization data and other information, please also put it up on the part page. </p>
+
  
 
</div>
 
</div>
−
 
−
 
−
<div class="column half_size">
 
−
 
−
<h5>Inspiration</h5>
 
−
<p>We have a created  a <a href="http://parts.igem.org/Well_Documented_Parts">collection of well documented parts</a> that can help you get started.</p>
 
−
 
−
<p> You can also take a look at how other teams have documented their parts in their wiki:</p>
 
−
<ul>
 
−
<li><a href="https://2014.igem.org/Team:MIT/Parts"> 2014 MIT </a></li>
 
−
<li><a href="https://2014.igem.org/Team:Heidelberg/Parts"> 2014 Heidelberg</a></li>
 
−
<li><a href="https://2014.igem.org/Team:Tokyo_Tech/Parts">2014 Tokyo Tech</a></li>
 
−
</ul>
 
−
</div>
 
−
 
−
<div class="column full_size">
 
−
<h5>Part Table </h5>
 
−
 
−
<p>Please include a table of all the parts your team has made during your project on this page. Remember part characterization and measurement data must go on your team part pages on the Registry. </p>
 
−
 
−
<div class="highlight">
 
−
 
−
 
−
</html>
 
−
<groupparts>iGEM17 Hamburg</groupparts>
 
−
 
−
<html>
 
−
</div>
 
−
</div>
 
−
 
−
 
−
 
  
 
</html>
 
</html>
 +
<!--- ..........Footer End......... --->

Latest revision as of 03:13, 2 November 2017

Home
Members Collaborations Attributions
Description Biochemistry Chemistry Nanoscience Applied Design Parts
Lab Book Protocols
Lab Results Demonstrate Improve a previous part or project InterLab Study
Human Practices Integrated HP Entrepreneurship
Safe Design
The Pinky and the Brain The funniest Things Records Other languages

Parts

Full Part table

 Part Number Type Designer Length
Nor Pyochelin Synthesis Cluster BBa_K2401000 Composite A. Nicolai, S. Ricke 10760 bp
Yersiniabactin inner Membrane Transporter BBa_K2401005 Composite A. Nicolai, S. Ricke 3956 bp
Siderophore outer Membrane Transporter BBa_K2401011 Composite A. Nicolai, S. Ricke 5724 bp
HMWP1 Yersiniabactin Synthetase part 2 BBa_K2401012 Composite A. Nicolai, S. Ricke 10731 bp
HMWP2 Yersiniabactin Synthetase Part 1 BBa_K2401001 Basic A. Nicolai, S. Ricke 6107 bp
2,3-Dihydroxybenzoate-AMP ligase BBa_K2401002 Basic A. Nicolai, S. Ricke 1578 bp
Thiazolinyl imide reductase BBa_K2401013 Basic A. Nicolai, S. Ricke 1101 bp
Surfactin imide reductase BBa_K2401004 Basic A. Nicolai, S. Ricke 498 bp
ABC-Siderophore-Transporter BBa_K2401006 Basic A. Nicolai, S. Ricke 1789 bp
ATP-Siderophore-Bindingpermease BBa_K2401007 Basic A. Nicolai, S. Ricke 1801 bp
HMWP1 Yersiniabactin Synthetase Part 2 BBa_K2401008 Basic A. Nicolai, S. Ricke 9492 bp
FyuA TonB Yersiniabactin outermembrane Receptor BBa_K2401010 Basic A. Nicolai, S. Ricke 2022 bp
FptA Pyochelin outermembrane Receptor BBa_K2401009 Basic A. Nicolai, S. Ricke 2160 bp
PchR Pyochelin regulator BBa_K2401003 Regulatory A. Nicolai, S. Ricke 960 bp
AraC like Yersiniabactin regulator BBa_K2401014 Regulatory A. Nicolai, S. Ricke 891 bp


Sponsored by