Difference between revisions of "Team:SDSZ-China"

 
(66 intermediate revisions by 3 users not shown)
Line 3: Line 3:
  
 
<head>
 
<head>
     <title>Background - TAS Taipei iGEM Wiki</title>
+
     <title>Project</title>
 +
 
 
     <style type='text/css'>
 
     <style type='text/css'>
 
         #top_title, #sideMenu {
 
         #top_title, #sideMenu {
Line 16: Line 17:
 
         }
 
         }
  
 +
        p {
 +
            font-family: Lato !important;
 +
            font-size: 17px !important
 +
        }
  
    </style>
+
         h1 {
</head>
+
            font-size: 40 -px !important;
 
+
<body data-spy="scroll" data-target="#category_navbar">
+
<link rel="shortcut icon" href="https://static.igem.org/mediawiki/2016/c/c6/T--TAS_Taipei--TAS_iGEM_Logo.png">
+
<link href='http://fonts.googleapis.com/css?family=Lato' rel='stylesheet' type='text/css'>
+
<!-- 最新版本的 Bootstrap 核心 CSS 文件 -->
+
<link rel="stylesheet" href="https://cdn.bootcss.com/bootstrap/3.3.7/css/bootstrap.min.css" integrity="sha384-BVYiiSIFeK1dGmJRAkycuHAHRg32OmUcww7on3RYdg4Va+PmSTsz/K68vbdEjh4u" crossorigin="anonymous">
+
 
+
<script>localStorage.clear();</script>
+
<!-- 最新的 Bootstrap 核心 JavaScript 文件 -->
+
<script src="https://cdn.bootcss.com/bootstrap/3.3.7/js/bootstrap.min.js" integrity="sha384-Tc5IQib027qvyjSMfHjOMaLkfuWVxZxUPnCJA7l2mCWNIpG9mGCD8wGNIcPD7Txa" crossorigin="anonymous"></script>
+
 
+
<script type="text/javascript" async
+
         src="https://cdn.mathjax.org/mathjax/latest/MathJax.js?config=TeX-MML-AM_CHTML">
+
</script>
+
 
+
<script type="text/x-mathjax-config">
+
MathJax.Hub.Config({tex2jax: {inlineMath: [['$','$'], ['\\(','\\)']]}});
+
</script>
+
 
+
<style type='text/css'>
+
    p {
+
        font-family: Lato !important;
+
        font-size: 17px !important
+
    }
+
 
+
    h1 {
+
        font-size: 40 -px !important;
+
    }
+
 
+
    body {
+
        font-family: Lato !important;
+
    }
+
 
+
    h3 {
+
        font-size: 25 -px
+
</style>
+
 
+
<div class="container" style='z-index:10;position:relative;'>
+
<!--   
+
    <div class="row center-block" style="text-align: left;">
+
        <nav style='font-family:Lato;font-size:22px;background-color:#1C77C3;-webkit-transform: translateZ(0);z-index: 100;position: fixed;box-shadow: 0px 0px 10px black;'>
+
            <ul style='margin-left:0px'>
+
                <li class="dropdown">
+
                    <a href="https://2016.igem.org/Team:TAS_Taipei/Background"><h4 class="dropdown-toggle disabled"
+
                                                                                  data-toggle="dropdown"><b>PROJECT</b>
+
                    </h4></a>
+
                    <div class="dropdown-menu">
+
                        <div class='subcategories_container'>
+
                            <div>
+
                                <h5><a href="https://2016.igem.org/Team:TAS_Taipei/Background">Background</a></h5>
+
                            </div>
+
                            <div>
+
                                <h5><a href="https://2016.igem.org/Team:TAS_Taipei/Achievements">Achievements</a></h5>
+
                            </div>
+
                            <div>
+
                                <h5><a href="https://2016.igem.org/Team:TAS_Taipei/Collaborations">Collaborations</a>
+
                                </h5>
+
                            </div>
+
                            <div>
+
                                <h5><a href="https://2016.igem.org/Team:TAS_Taipei/Parts">Parts</a></h5>
+
                            </div>
+
                        </div>
+
                        <div style='height:140px;'>
+
                            <img src="https://static.igem.org/mediawiki/2016/1/11/T--TAS_Taipei--TAS_Icon_Project.png">
+
                            <h4><b>Cataracts</b> - the leading cause of blindness. Find out how we can non-invasively
+
                                <b>treat</b> and <b>prevent</b> cataract formation.</b></h4>
+
                        </div>
+
 
+
                    </div>
+
                </li>
+
                <li class="dropdown">
+
                    <a href="https://2016.igem.org/Team:TAS_Taipei/Experimental_Summary"><h4
+
                            class='dropdown-toggle disabled' data-toggle="dropdown"><b>EXPERIMENTAL</b></h4></a>
+
                    <div class="dropdown-menu">
+
                        <div class='subcategories_container'>
+
                            <div>
+
                                <h5><a href="https://2016.igem.org/Team:TAS_Taipei/Experimental_Summary#lensmodel">Lens
+
                                    Cataract Model</a></h5>
+
                            </div>
+
                            <div>
+
                                <h5><a href="https://2016.igem.org/Team:TAS_Taipei/Experimental_Summary#construct">Prevention
+
                                    and Treatment Constructs </a></h5>
+
                            </div>
+
                            <div>
+
                                <h5><a href="https://2016.igem.org/Team:TAS_Taipei/Experimental_Summary#prototype">Delivery
+
                                    Prototype</a></h5>
+
                            </div>
+
                            <div>
+
                                <h5><a href="https://2016.igem.org/Team:TAS_Taipei/Notebook">Notebook</a></h5>
+
                            </div>
+
                        </div>
+
                        <div style='height:140px;'>
+
                            <img src="https://static.igem.org/mediawiki/2016/b/b0/T--TAS_Taipei--TAS_Icon_Experiments.png">
+
                            <h4>We build <b>constructs</b> to make our great ideas become reality. Follow along our
+
                                discovery of exciting science!</h4>
+
                        </div>
+
                    </div>
+
                </li>
+
                <li class="dropdown">
+
                    <a href="https://2016.igem.org/Team:TAS_Taipei/Model"><h4 class='dropdown-toggle disabled'
+
                                                                            data-toggle="dropdown"><b>MODEL</b></h4>
+
                    </a>
+
                    <div class="dropdown-menu">
+
                        <div class='subcategories_container'>
+
                            <div>
+
                                <h5><a href="https://2016.igem.org/Team:TAS_Taipei/Model#GSRFunc">GSR Function</a></h5>
+
                            </div>
+
                            <div>
+
                                <h5><a href="https://2016.igem.org/Team:TAS_Taipei/Model#prototype">Prototype
+
                                    Delivery</a></h5>
+
                            </div>
+
                            <div>
+
                                <h5><a href="https://2016.igem.org/Team:TAS_Taipei/Model#treatment">CH25H Treatment</a>
+
                                </h5>
+
                            </div>
+
                            <div>
+
                                <h5><a href="https://2016.igem.org/Team:TAS_Taipei/Model#software">Calculator</a></h5>
+
                            </div>
+
 
+
                        </div>
+
                        <div style='height:140px;'>
+
                            <img src="https://static.igem.org/mediawiki/2016/c/ca/T--TAS_Taipei--TAS_Icon_Model.png">
+
                            <h4><b>Computational Biology</b> provides us models that we cannot easily test
+
                                experimentally. Click to find out the results of our modeling, and the math behind it!
+
                            </h4>
+
                        </div>
+
                    </div>
+
                </li>
+
                <li class="dropdown">
+
                    <a href="https://2016.igem.org/Team:TAS_Taipei/Human_Practices"><h4 class='dropdown-toggle disabled'
+
                                                                                      data-toggle="dropdown"><b>HUMAN
+
                        PRACTICE</b></h4></a>
+
                    <div class="dropdown-menu">
+
                        <div class='subcategories_container'>
+
                            <div>
+
                                <h5><a href="https://2016.igem.org/Team:TAS_Taipei/Human_Practices#research">Research</a>
+
                                </h5>
+
                            </div>
+
                            <div>
+
                                <h5><a href="https://2016.igem.org/Team:TAS_Taipei/Human_Practices#outreach">Outreach</a>
+
                                </h5>
+
                            </div>
+
                            <div>
+
                                <h5><a href="https://2016.igem.org/Team:TAS_Taipei/Human_Practices#impact">Impact</a>
+
                                </h5>
+
                            </div>
+
                        </div>
+
                        <div style='height:140px;'>
+
                            <img src="https://static.igem.org/mediawiki/2016/b/b9/T--TAS_Taipei--TAS_Icon_HP.png">
+
                            <h4>We don't just grow cool bacteria. We make a <b>difference</b>. Find out how we tackled
+
                                <b>social aspects</b> of this project.</h4>
+
                        </div>
+
                    </div>
+
                </li>
+
                <li class="dropdown">
+
                    <a href="https://2016.igem.org/Team:TAS_Taipei/Safety"><h4 class='dropdown-toggle disabled'
+
                                                                              data-toggle="dropdown"><b>SAFETY</b></h4>
+
                    </a>
+
                    <div class="dropdown-menu">
+
                        <div style='height:100px;'>
+
                            <div class='subcategories_container'>
+
                                <div>
+
                                    <h5><a href="https://2016.igem.org/Team:TAS_Taipei/Safety#overview">Overview</a></h5>
+
                                </div>
+
                                <div>
+
                                    <h5><a href="https://2016.igem.org/Team:TAS_Taipei/Safety#biosafety">Biosafety</a>
+
                                    </h5>
+
                                </div>
+
                                <div>
+
                                    <h5><a href="https://2016.igem.org/Team:TAS_Taipei/Safety#riskreduction">Risk
+
                                        Reduction Methods</a></h5>
+
                                </div>
+
                                <div>
+
                                    <h5><a href="https://2016.igem.org/Team:TAS_Taipei/Safety#furtherquestion">Further
+
                                        Questions</a></h5>
+
                                </div>
+
                            </div>
+
                            <img src="https://static.igem.org/mediawiki/2016/7/7e/T--TAS_Taipei--TAS_Icon_Safety.png">
+
                            <h4><b>Safety first.</b> Especially in a lab. Here's how we maintained and investigated the
+
                                integrity and security of our work environment.</h4>
+
                        </div>
+
                    </div>
+
                </li>
+
                <li class="dropdown">
+
                    <a href="https://2016.igem.org/Team:TAS_Taipei/Team"><h4 class='dropdown-toggle disabled'
+
                                                                            data-toggle="dropdown"><b>TEAM</b></h4></a>
+
                    <div class="dropdown-menu">
+
                        <div class='subcategories_container'>
+
                            <div>
+
                                <h5><a href="https://2016.igem.org/Team:TAS_Taipei/Team#members">Members</a></h5>
+
                            </div>
+
                            <div>
+
                                <h5><a href="https://2016.igem.org/Team:TAS_Taipei/Team#about">About</a></h5>
+
                            </div>
+
                            <div>
+
                                <h5><a href="https://2016.igem.org/Team:TAS_Taipei/Attributions">Attributions</a></h5>
+
                            </div>
+
                            <div>
+
                                <h5><a href="https://2016.igem.org/Team:TAS_Taipei/Wiki_Standard_Pages">Wiki Standard
+
                                    Pages</a></h5>
+
                            </div>
+
                        </div>
+
                        <div style='height:140px;'>
+
                            <img src="https://static.igem.org/mediawiki/2016/c/c6/T--TAS_Taipei--TAS_Icon_Team.png">
+
                            <h4>Every iGEM project is the accumulation of an entire year's hard work by a group of
+
                                cheerful students. <b>Meet the team!</b></h4>
+
                        </div>
+
                    </div>
+
                </li>
+
            </ul>
+
        </nav>
+
    </div>
+
    <br>
+
    <br>
+
    <br>
+
-->
+
<!--
+
    <div class="row center-block" style="padding:10px;width:90%;background-color:#07BEB8;box-shadow:0px 0px 5px black">
+
        <div class="row" style="text-align:center;">
+
            <div class="col-sm-2">
+
                <a href="https://2016.igem.org/Team:TAS_Taipei" style='text-decoration: none'><img src="https://static.igem.org/mediawiki/2016/c/c6/T--TAS_Taipei--TAS_iGEM_Logo.png
+
" alt="" style="width: 100px;"></a>
+
            </div>
+
            <div class="col-sm-8" style='text-align:center;'>
+
                <a href="https://2016.igem.org/Team:TAS_Taipei" style='text-decoration: none;'>
+
                    <h2 style="font-family:'Lato';letter-spacing:10px;color: white; font-size: 60px;  margin-top: 0;  margin-bottom: 0;">
+
                        <b>
+
                            C&#9678;UNTERACTS</b></h2>
+
                </a>
+
            </div>
+
            <div class="col-sm-2">
+
                <a href="https://igem.org/HS"><img
+
                        src="https://static.igem.org/mediawiki/2016/6/6e/T--TAS_Taipei--TAS_Icon_Logo2.png" alt=""
+
                        style="width: 100px;"></a>
+
            </div>
+
        </div>
+
    </div>
+
    <br>
+
-->
+
    <div class="row card" id='bodycontainer' class='row'>
+
        <div class="col-sm-2" style='padding-left:5% padding-right:10%'>
+
            <div id="category_navbar">
+
                <ul class="nav nav-list" data-spy="affix" data-offset-top="160"
+
                    style='-webkit-transform: translateZ(0);width:160px;margin-left:0'>
+
 
+
                    <li><a href="#cataract">What are Cataracts?</a></li>
+
                    <li><a href="#solution">What is our Solution?</a></li>
+
 
+
                </ul>
+
            </div>
+
 
+
        </div>
+
 
+
 
+
        <div class="col-sm-10" style="padding-right:5%">
+
            <div class="row">
+
                <div class="col-sm-12">
+
                    <body>
+
                    <h1 id='overview'>Background</h1>
+
 
+
                    <p>Cataracts are the leading cause of blindness today, affecting 20 million people worldwide (World
+
                        Health Organization). Half of Americans above 80 years old are affected by cataracts (National
+
                        Eye Institute), and so are many animals! The National Eye Institute projects that in 30 years,
+
                        the number of cataract patients will increase to 50 million (National Eye Institute). </p>
+
                </div>
+
            </div>
+
 
+
 
+
            <div class="row">
+
                <div class="col-sm-12">
+
                    <h2 id='cataract'>What are Cataracts?</h2>
+
                    <div class="row">
+
                        <div class="col-sm-6">
+
                            <p>
+
                                The lens is mostly made of proteins called crystallins. Crystallin proteins are normally
+
                                soluble, which keeps the lens clear and allows light entering the eye to focus. When
+
                                these proteins are damaged, they form insoluble clumps (Truscott, 2005). This causes the
+
                                clouding seen in cataractous lenses, which scatters light and in turn makes vision
+
                                blurry (Figure 1.1).
+
 
+
                            </p>
+
                        </div>
+
                        <figure class="col-sm-6">
+
                            <img src="https://static.igem.org/mediawiki/2016/f/ff/T--TAS_Taipei--Normal_vs_Cataract_Model_cropped.png">
+
                            <figcaption class='darkblue'><b>Figure 1.1. </b>Cataracts scatter light coming through the
+
                                lens, which blurs vision.
+
                            </figcaption>
+
                        </figure>
+
                    </div>
+
                    <br><br>
+
                    <div class="row">
+
                        <div class="col-sm-6">
+
                            <p>
+
                                Cataracts can be caused by many factors, including radiation and diabetes, but the
+
                                underlying cause is oxidative damage. Oxidative damage happens when unstable chemicals
+
                                containing oxygen react with DNA, lipids, or proteins, disrupting cellular functions
+
                                (Truscott, 2005). In the lens, crystallin proteins can be oxidized by hydrogen peroxide
+
                                (H₂O₂), which is a reactive molecule produced during aerobic respiration (Giorgio et
+
                                al., 2007). H₂O₂ reacts with protein residues and changes the shape of the protein. When
+
                                two cysteine residues on separate proteins are oxidized by H₂O₂, for example, they can
+
                                form a disulfide bond, which links these proteins together. The damaged proteins thus
+
                                aggregate and form clumps in the lens (Truscott, 2005) (Figure 1.2).
+
 
+
 
+
                            </p>
+
                        </div>
+
                        <figure class="col-sm-6">
+
                            <img src="https://static.igem.org/mediawiki/2016/9/92/T--TAS_Taipei--Oxidative_Damage.jpeg">
+
                            <figcaption class='darkblue'><b>Figure 1.2. </b>Oxidative damage by H₂O₂ can lead to
+
                                proteins misfolding, breaking apart, and clumping.
+
                            </figcaption>
+
                        </figure>
+
 
+
 
+
                    </div>
+
 
+
 
+
                    <br><br>
+
                    <div class="row">
+
                        <div class="col-sm-12">
+
                            <p>
+
                                <b>In the eye, a natural antioxidant called glutathione (GSH) exists,</b> which can
+
                                convert H₂O₂ into water (Giblin, 2000). With age, however, GSH levels decrease, and
+
                                oxidative damage caused by H₂O₂ increases. When there is more H₂O₂ in the lens than GSH
+
                                can remove, crystallins become damaged (Figure 1.3). When GSH levels are low, H₂O₂
+
                                starts to oxidize crystallins and cause cataracts. As lens cells age, they move towards
+
                                the nucleus and their GSH levels fall (Cvekl & Ashery-Padan, 2014), which may explain
+
                                why the older cells in the lens nucleus are more prone to developing cataracts
+
 
+
 
+
                            </p>
+
                        </div>
+
                    </div>
+
                    <br><br>
+
                    <div class="row">
+
                        <figure class="col-sm-7">
+
                            <img src="https://static.igem.org/mediawiki/2016/5/5d/T--TAS_Taipei--Antioxidant_Balance.jpeg">
+
                            <figcaption class='darkblue'><b>Figure 1.3.</b> Antioxidants protects proteins from
+
                                oxidative damage by H₂O₂ (left). When antioxidant levels are low, H₂O₂ damages
+
                                crystallins and cataract develops (right).
+
                            </figcaption>
+
                        </figure>
+
                        <div class="col-sm-1"></div>
+
                        <figure class="col-sm-4">
+
                            <img src="https://static.igem.org/mediawiki/2016/6/6c/T--TAS_Taipei--New_vs_Old_Cells.jpeg">
+
                            <figcaption class='darkblue'><b>Figure 1.4.</b> Lens cells move towards the nucleus as they
+
                                mature. Older cells have less GSH and are more susceptible to oxidative damage by H₂O₂.
+
                            </figcaption>
+
                        </figure>
+
                    </div>
+
                    <br><br>
+
                    <div class="row">
+
                        <div class="col-sm-7">
+
                            <p>
+
                                The current standard treatment for cataracts is surgery, which replaces the cloudy lens
+
                                with a clear artificial lens. Surgery is effective, but like all surgeries, it is <b>invasive
+
                                and requires professional equipment and trained surgeons.</b> These requirements add to
+
                                the cost, which averages about $3,500 per eye in the US without insurance (Sigre, 2016),
+
                                and is the biggest obstacle to solving cataracts worldwide. Through literature research,
+
                                we found a molecule called 25-hydroxycholesterol (25HC) that can reverse protein
+
                                aggregation. We hope to use this as an alternative to surgery to treat cataracts.
+
 
+
                            </p>
+
                        </div>
+
                        <figure class="col-sm-5">
+
                            <img src="https://static.igem.org/mediawiki/2016/e/e2/T--TAS_Taipei--Surgery_Cataract.jpeg">
+
                            <figcaption class='darkblue' style="font-color:red"><b>Figure 1.5.</b> Our goal is to
+
                                replace surgery with noninvasive eye drops that prevent and treat cataracts.
+
                            </figcaption>
+
                        </figure>
+
                    </div>
+
 
+
                </div> <!-- Container -->
+
            </div> <!-- Container -->
+
 
+
 
+
            <div class="row">
+
                <div class="col-sm-12">
+
                    <h2 id='solution'>What is our Solution?</h2>
+
                    <div class="row">
+
                        <div class="col-sm-12">
+
                            <p>
+
                                Our goal is to develop noninvasive, easy-to-use, and affordable eyedrops to prevent and
+
                                treat cataracts (Figure 1.5).
+
                            </p>
+
                        </div>
+
                    </div>
+
                    <div class="row">
+
 
+
                        <div class="col-sm-12">
+
                            <h3 id="prevention">Prevention</h3>
+
                            <p>
+
                                When GSH is present, H₂O₂ can oxidize GSH instead of crystallin proteins. When GSH
+
                                becomes oxidized, a disulfide bond forms between two GSH molecules, which become
+
                                oxidized glutathione (GSSG). Through literature research, we found an enzyme that
+
                                recycles GSSG back into GSH. This enzyme is called glutathione reductase (GSR) (Ganea &
+
                                Harding, 2006). As seen in Figure 1.6, GSR (green) recycles GSSG back into GSH, so that
+
                                crystallin proteins remain protected. Even though GSR exists in the lens, its levels
+
                                decrease with age, which leads to the development of cataracts (Michael & Bron, 2011).
+
                                <b>Our goal is to independently produce and deliver GSR to the lens, so that cataract
+
                                    formation is prevented. </b>
+
 
+
                            </p>
+
                        </div>
+
 
+
                    </div>
+
                    <div class="row">
+
 
+
 
+
                        <div class="col-sm-4"><img
+
                                src="https://static.igem.org/mediawiki/2016/b/b0/T--TAS_Taipei--ClearAnimation1.gif"></div>
+
 
+
                        <div class="col-sm-4"><img
+
                                src="https://static.igem.org/mediawiki/2016/3/30/T--TAS_Taipei--BlurredAnimation1.gif"></div>
+
 
+
                        <div class="col-sm-4"><img
+
                                src="https://static.igem.org/mediawiki/2016/7/7f/T--TAS_Taipei--AnimatinoLegend.gif"></div>
+
 
+
                        <figure class="col-sm-12">
+
                            <figcaption class='darkblue'><b>Figure 1.6 </b>In a normal lens (left), GSR (enzyme, in
+
                                green) converts GSSG into GSH. H₂O₂ oxidizes GSH instead of crystallin proteins, so that
+
                                crystallin proteins remain protected, and the lens remains clear. In a cataractous lens
+
                                (right), GSR levels are low so GSH cannot be remade. Since GSH is not present to protect
+
                                proteins against H₂O₂, cataracts begin to develop.
+
                            </figcaption>
+
                        </figure>
+
 
+
 
+
                    </div>
+
                    <br><br>
+
 
+
                    <div class="row">
+
 
+
                        <div class="col-sm-8">
+
                            <h3 id="treatment">Treatment</h3>
+
                            <p>
+
                                We also found a molecule that can restore solubility of protein clumps and lens
+
                                transparency. It is called 25-hydroxycholesterol (25HC) (Makley et al., 2015). 25HC can
+
                                be produced from cholesterol by the enzyme cholesterol 25-hydroxylase (CH25H) (Figure
+
                                1.7). Our goal is to independently produce and deliver CH25H to the lens, so that
+
                                cataracts can be treated.
+
 
+
                            </p>
+
                        </div>
+
                        <figure class="col-sm-4">
+
                            <img src="https://static.igem.org/mediawiki/2016/7/7c/T--TAS_Taipei--CH25HRxnDescription.png">
+
                            <figcaption class='darkblue'><b>Figure 1.7. </b>CH25H (enzyme) converts cholesterol to 25HC,
+
                                which can reverse protein clumps.
+
                            </figcaption>
+
                        </figure>
+
                    </div>
+
 
+
                </div>
+
 
+
 
+
            </div> <!-- Container -->
+
            <br><br>
+
            <div class="row">
+
                <div class="col-sm-12">
+
                    <h3>Citations</h3>
+
                    <p>Cvekl, A., & Ashery-Padan, R. (2014). The cellular and molecular mechanisms of vertebrate lens
+
                        development. Development, 141(23), 4432-4447.
+
                    </p>
+
                    <br>
+
                    <p>Ganea, E. & Harding, J. J. (2006). Glutathione-related enzymes and the eye. Curr Eye Res., 31(1),
+
                        1–11
+
                    </p> <br>
+
                    <p>Giblin, F. J. (2000). Glutathione: a vital lens antioxidant. Journal of Ocular Pharmacology and
+
                        Therapeutics, 16(2), 121-135.
+
                    </p> <br>
+
                    <p>Giorgio, M., Trinei, M., Migliaccio, E., & Pelicci, P. (2007). Nature Reviews Molecular Cell
+
                        Biology, 8(9), 722-8.
+
                    </p> <br>
+
                    <p>Makley, L. N., McMenimen, K. A., DeVree, B. T., Goldman, J. W., McGlasson, B. N., Rajagopal, P.,
+
                        Dunyak, B.M., McQuade, T.J., Thompson, A.D., Sunahara, R., Klevit, R.E., Andley, U.P., and
+
                        Gestwicki, J.E. (2015). Pharmacological chaperone for α-crystallin partially restores
+
                        transparency in cataract models. Science, 350(6261), 674-677.
+
                    </p> <br>
+
                    <p>Michael, R., & Bron, A. J. (2011). The ageing lens and cataract: a model of normal and
+
                        pathological ageing. Philosophical Transactions of the Royal Society of London B: Biological
+
                        Sciences, 366(1568), 1278-1292.
+
                    </p> <br>
+
                    <p>National Eye Institute | Cataracts. (n.d.). Retrieved October 04, 2016, from
+
                        https://nei.nih.gov/eyedata/cataract
+
                    </p> <br>
+
                    <p>Segre L (2016, Sept. 21). Cataract surgery cost. Retrieved from
+
                        http://www.allaboutvision.com/conditions/cataract-surgery-cost.htm
+
                    </p> <br>
+
                    <p>Truscott, RJ (2005). Age-related nuclear cataract-oxidation is the key. Exp Eye Res., 80(5):
+
                        709-25.
+
                    </p> <br>
+
                    <p>World Health Organization | Priority eye diseases. (n.d.). Retrieved October 03, 2016, from
+
                        http://www.who.int/blindness/causes/priority/en/index1.html
+
                    </p> <br>
+
                    <p></p> <br> <br>
+
                </div>
+
            </div>
+
 
+
 
+
        </div>
+
 
+
    </div>
+
</div>
+
 
+
<br>
+
<br><br>
+
 
+
<canvas id="canvas-container" style="z-index:-1"></canvas>
+
<script type="text/javascript"
+
        src='https://2016.igem.org/Template:TAS_Taipei/js/field?action=raw&ctype=text/javascript'></script>
+
 
+
</body>
+
 
+
 
+
<style type='text/css'>
+
    #bg {
+
        position: fixed;
+
        top: 0;
+
        left: 0;
+
    }
+
 
+
    .bgwidth {
+
        width: 100%;
+
    }
+
 
+
    .bgheight {
+
        height: 100%;
+
    }
+
</style>
+
 
+
<div class="backgroundpic">
+
    <img src="https://static.igem.org/mediawiki/2016/e/e5/T--TAS_Taipei--Taipei_Background_1.0.jpg" style="z-index:0"
+
        width="100%" height="100%" id="bg" alt="">
+
</div>
+
 
+
<script>
+
    var nowRadius = 0
+
    $(function () {
+
        if (screen.width > 1800)
+
            $("#slideoutco").fadeOut(0);
+
 
+
        $({blurRadius: 0}).animate({blurRadius: 10}, {
+
            duration: 20000,
+
            easing: 'swing', // or "linear"
+
            // use jQuery UI or Easing plugin for more options
+
            step: function () {
+
                console.log(this.blurRadius);
+
                if ($("#bluebutton").hasClass("isOn")) {
+
                    return;
+
                }
+
                ;
+
                if ($('#redbutton').hasClass("isOn")) {
+
                    return;
+
                }
+
                $('.backgroundpic').css({
+
                    "-webkit-filter": "blur(" + this.blurRadius + "px)",
+
                    "filter": "blur(" + this.blurRadius + "px)"
+
 
+
                });
+
                nowRadius = this.blurRadius;
+
                var LOCSnum = Math.round(nowRadius * 6 / 9);
+
                var NineLOCSnum = Math.round(nowRadius * 6 / 9 * 10);
+
                /**if (NineLOCSnum > 20) switchMessage("YELLOW","<b> Oh no! </b> Cataracts are forming! Click on the Eyedrop Tab and get <b>TREATMENT</b> eyedrops!", currentColor()=="GREEN");
+
                if (NineLOCSnum == 55) $("#slideoutco").fadeOut(1000);
+
                if (NineLOCSnum > 60) switchMessage("RED","Your cataracts are very severe. You need to get TREATMENT fast by clicking the Eyedrop Tab", currentColor()=="YELLOW");*/
+
                if (LOCSnum > 6) {
+
                    LOCSnum = "6+";
+
                    $('#LOCS').text(LOCSnum + "");
+
                }
+
                else $('#LOCS').text(LOCSnum + "");
+
 
+
                if (LOCSnum == 0) document.getElementById('bluebutton').click();
+
            }
+
        });
+
 
+
    });
+
 
+
    startBlur = function (speed) {
+
        $({blurRadius: nowRadius}).animate({blurRadius: 10}, {
+
            duration: speed,
+
            easing: 'swing', // or "linear"
+
                            // use jQuery UI or Easing plugin for more options
+
            step: function () {
+
                console.log(this.blurRadius);
+
                if ($("#bluebutton").hasClass("isOn")) {
+
                    return;
+
                }
+
                ;
+
                if ($('#redbutton').hasClass("isOn")) {
+
                    return;
+
                }
+
 
+
                $('.backgroundpic').css({
+
                    "-webkit-filter": "blur(" + this.blurRadius + "px)",
+
                    "filter": "blur(" + this.blurRadius + "px)"
+
 
+
                });
+
 
+
                nowRadius = this.blurRadius;
+
                var LOCSnum = Math.round(nowRadius * 6 / 9);
+
                var NineLOCSnum = Math.round(nowRadius * 6 / 9 * 10);
+
                /**if (NineLOCSnum == 15) $("#slideoutco").fadeOut(400);
+
                if (NineLOCSnum > 20) switchMessage("RED","<b>Cataracts</b> are creeping back again! Click the PREVENTION eyedrop to add GSR into your eyes!", currentColor()=="BLUE");*/
+
                if (LOCSnum > 6) {
+
                    LOCSnum = "6+";
+
                    $('#LOCS').text(LOCSnum + "");
+
                }
+
                else $('#LOCS').text(LOCSnum + " ");
+
 
+
 
+
            }
+
        });
+
    };
+
 
+
    stopBlur = function (speed) {
+
 
+
        $({blurRadius: nowRadius}).animate({blurRadius: 0}, {
+
            duration: speed,
+
            easing: 'swing', // or "linear"
+
                            // use jQuery UI or Easing plugin for more options
+
            step: function () {
+
                console.log(this.blurRadius);
+
                if ($("#redbutton").hasClass("isOn")) {
+
                } else {
+
                    return;
+
                }
+
                ;
+
                $('.backgroundpic').css({
+
                    "-webkit-filter": "blur(" + this.blurRadius + "px)",
+
                    "filter": "blur(" + this.blurRadius + "px)"
+
 
+
                });
+
                nowRadius = this.blurRadius;
+
                var LOCSnum = Math.round(nowRadius * 6 / 9);
+
                var NineLOCSnum = Math.round(nowRadius * 6 / 9 * 10);
+
 
+
                /**if (NineLOCSnum < 68){ if (NineLOCSnum > 10) if(currentColor()=="RED" ||  currentColor() == "BLUE") $("#slideoutco").fadeOut(0); switchMessage("YELLOW","<b> Treating</b> your cataract with <b>25HC Eyedrops </b>", currentColor()=="RED");
+
                              }
+
                if (NineLOCSnum == 9) $("#slideoutco").fadeOut(0);
+
 
+
 
+
                if (NineLOCSnum < 5) {
+
            if ($("#bluebutton").hasClass("isOn")){
+
 
+
                switchMessage("GREEN","<b>Your eyes are <i>pernamently</i> crystal clear!</b> Treatment is not needed, so don't forget to turn it off!. Click the question mark to learn more.", currentColor()=="BLUE")
+
            }
+
            else switchMessage("BLUE","Your eyes are crystal clear! To avoid waste, please turn off the <b>TREATMENT</b> eyedrop.", currentColor()=="YELLOW");
+
        }*/
+
                if (LOCSnum > 6) LOCSnum = "6+";
+
                else LOCSnum = LOCSnum + " ";
+
                $('#LOCS').text(LOCSnum + "");
+
 
+
            }
+
        });
+
 
+
 
+
    };
+
 
+
    function chooseBlur() {
+
        if ($("#redbutton").hasClass("isOn")) {
+
            stopBlur(4500);
+
 
+
 
         }
 
         }
  
         else {
+
         body {
             if ($("#bluebutton").hasClass("isOn")) {
+
             font-family: Lato !important;
            }
+
            else {
+
                startBlur(12000);
+
            }
+
 
         }
 
         }
        /**if (!$("#redbutton").hasClass("isOn"))
 
        if ($("#bluebutton").hasClass("isOn"))
 
        {
 
            $("#slideoutco").fadeOut(0);
 
            switchMessage("BLUE","Great! Furthur cataract formation is prevented with GSR Eyedrops. Now use <b>TREATMENT</b> eyedrops one last time.", currentColor()=="RED")
 
        }*/
 
    };
 
  
 
+
         h3 {
</script>
+
             font-size: 25 -px;
 
+
<script>
+
 
+
    function switchToggleB() {
+
         if ($("#bluebutton").hasClass("isOn")) {
+
             $("#bluebutton").removeClass("isOn");
+
 
         }
 
         }
        else {
 
            $("#bluebutton").addClass("isOn");
 
        }
 
    };
 
  
    function switchToggleR() {
+
         #bg {
         if ($("#redbutton").hasClass("isOn")) {
+
             position: fixed;
             $("#redbutton").removeClass("isOn");
+
            z-index: -1;
 +
            top: 0;
 +
            left: 0;
 
         }
 
         }
        else {
 
            $("#redbutton").addClass("isOn");
 
        }
 
    };
 
  
    function currentColor() {
+
         #bodycontainer {
         if ($("#slidecontenttext").hasClass("alert-danger"))
+
             background: rgba(255, 255, 255, 0.5);
             return "RED";
+
        if ($("#slidecontenttext").hasClass("alert-warning"))
+
            return "YELLOW";
+
        if ($("#slidecontenttext").hasClass("alert-info"))
+
            return "BLUE";
+
        if ($("#slidecontenttext").hasClass("alert-success"))
+
            return "GREEN";
+
        else return "NONE"
+
    };
+
 
+
    function switchMessage(color, textInside, refresh) {
+
        var entirebox = document.getElementById("slideoutco");
+
 
+
        if (refresh) {
+
            $(entirebox).fadeOut(100);
+
            if ($("#slidecontenttext").hasClass("alert-danger"))
+
                $("#slidecontenttext").removeClass("alert-danger");
+
            if ($("#slidecontenttext").hasClass("alert-warning"))
+
                $("#slidecontenttext").removeClass("alert-warning");
+
            if ($("#slidecontenttext").hasClass("alert-info"))
+
                $("#slidecontenttext").removeClass("alert-info");
+
            if ($("#slidecontenttext").hasClass("alert-success"))
+
                $("#slidecontenttext").removeClass("alert-success");
+
            if (color == "RED")
+
                $("#slidecontenttext").addClass("alert-danger");
+
            if (color == "YELLOW")
+
                $("#slidecontenttext").addClass("alert-warning");
+
            if (color == "BLUE")
+
                $("#slidecontenttext").addClass("alert-info");
+
            if (color == "GREEN")
+
                $("#slidecontenttext").addClass("alert-success");
+
 
+
 
+
            $("#slidecontenttext").html(textInside);
+
            $(entirebox).fadeIn(500);
+
 
         }
 
         }
 +
    </style>
 +
    <link href='http://fonts.googleapis.com/css?family=Lato' rel='stylesheet' type='text/css'>
 +
    <!-- 最新版本的 Bootstrap 核心 CSS 文件 -->
 +
    <link rel="stylesheet" href="https://cdn.bootcss.com/bootstrap/3.3.7/css/bootstrap.min.css"
 +
          integrity="sha384-BVYiiSIFeK1dGmJRAkycuHAHRg32OmUcww7on3RYdg4Va+PmSTsz/K68vbdEjh4u" crossorigin="anonymous">
  
    };
 
  
 +
    <script>localStorage.clear();</script>
 +
    <!-- 最新的 Bootstrap 核心 JavaScript 文件 -->
 +
    <script src="https://cdn.bootcss.com/bootstrap/3.3.7/js/bootstrap.min.js"
 +
            integrity="sha384-Tc5IQib027qvyjSMfHjOMaLkfuWVxZxUPnCJA7l2mCWNIpG9mGCD8wGNIcPD7Txa"
 +
            crossorigin="anonymous"></script>
  
</script>
+
    <script type="text/javascript" async
 +
            src="https://cdn.mathjax.org/mathjax/latest/MathJax.js?config=TeX-MML-AM_CHTML"></script>
 +
    <script type="text/x-mathjax-config">
 +
MathJax.Hub.Config({tex2jax: {inlineMath: [['$','$'], ['\\(','\\)']]}});
  
  
<canvas id="canvas-container" style="z-index:-1" hidden></canvas>
 
<script type="text/javascript" src='https://2015.igem.org/Template:TAS_Taipei/js/field?action=raw&ctype=text/javascript'
 
        hidden></script/>
 
  
 +
 +
    </script>
  
<script type="text/javascript">
+
    <script type="text/javascript">
    /* Toggle between adding and removing the "active" and "show" classes when the user clicks on one of the "Section" buttons. The "active" class is used to add a background color to the current button when its belonging panel is open. The "show" class is used to open the specific accordion panel */
+
    var acc = document.getElementsByClassName("accordion");
+
    var i;
+
  
    for (i = 0; i < acc.length; i++) {
+
        $(document).ready(function () {
        acc[i].onclick = function () {
+
             $("#category_navbar a").on('click', function (event) {
             this.classList.toggle("active");
+
                // Make sure this.hash has a value before overriding default behavior
            this.nextElementSibling.classList.toggle("show");
+
                if (this.hash !== "") {
        }
+
                    // Prevent default anchor click behavior
    }
+
                    event.preventDefault();
</script>
+
  
<script type="text/javascript">
+
                    // Store hash0
    $("#category_navbar a").on('click', function (event) {
+
                    var hash = this.hash;
        // Make sure this.hash has a value before overriding default behavior
+
        if (this.hash !== "") {
+
            // Prevent default anchor click behavior
+
            event.preventDefault();
+
  
            // Store hash0
+
                    // Using jQuery's animate() method to add smooth page scroll
            var hash = this.hash;
+
                    // The optional number (800) specifies the number of milliseconds it takes to scroll to the specified area
 +
                    $('html, body').animate({
 +
                        scrollTop: $(hash).offset().top
 +
                    }, 800, function () {
  
            // Using jQuery's animate() method to add smooth page scroll
+
                        // Add hash (#) to URL when done scrolling (default click behavior)
            // The optional number (800) specifies the number of milliseconds it takes to scroll to the specified area
+
                        window.location.hash = hash;
            $('html, body').animate({
+
                    });
                scrollTop: $(hash).offset().top
+
                }  // End if
            }, 800, function () {
+
 
+
                // Add hash (#) to URL when done scrolling (default click behavior)
+
                window.location.hash = hash;
+
 
             });
 
             });
         }  // End if
+
         });
    });
+
  
  
</script>
+
    </script>
<!--
+
<div id="slideout">
+
    <div id="slidecontent">
+
        <h3>Prevention</h3>
+
        <h5>GSR Eyedrop</h5>
+
        <label class="switch">
+
            <input id="bluebutton" onClick="switchToggleB(); chooseBlur()" type="checkbox">
+
            <div class="slider round bluecolorbutton"></div>
+
        </label>
+
        <br>
+
  
        <h3>Treatment</h3>
+
</head>
        <h5>25HC Eyedrop</h5>
+
</head>
        <label class="switch">
+
            <input id="redbutton" onClick="switchToggleR(); chooseBlur()" type="checkbox">
+
            <div class="slider round redcolorbutton"></div>
+
        </label>
+
        <h4><b> LOCS: <span id="LOCS">0 &#160;</span></b> &#160; &#160; <a
+
                href="https://2016.igem.org/Team:TAS_Taipei/Wiki_Standard_Pages#Animation">
+
            <button type="button" class="btn btn-danger btn-md">?</button>
+
        </a>
+
  
    </div>
+
<body data-spy="scroll" data-target="#category_navbar">
    <div id="clickme">
+
        <h2 class="vertical-text" style="Lato" !important>
+
            <br> Eyedrops
+
        </h2>
+
        <br><br><br>
+
  
    </div>
+
<div class="container" style='z-index:10;position:relative;'>
</div>
+
  
<div id="slideoutco">
 
    <div id="slidecontentco">
 
        <div id="slidecontenttext" class="alert alert-danger">
 
            <p style="font-size:14px !important"><a href="#" class="close" data-dismiss="alert">&times;</a>
 
                <strong>Zoom out to see animation.</strong> &#160; &#160; &#160; &#160; &#160;<a
 
                        href="https://2016.igem.org/Team:TAS_Taipei/Wiki_Standard_Pages#Animation">
 
                    <button type="button" class="btn btn-danger btn-sm">?</button>
 
                </a><span style="font-size:14px"><br>Your screen resolution is too low unless you zoom out </span></p>
 
  
        </div>
+
     <div class="row card" id='bodycontainer' class='row'>
     </div>
+
</div>
+
-->
+
<javascript>
+
  
</javascript>
+
        <nav class="navbar navbar-default navbar-static-top">
 +
            <!-- Brand and toggle get grouped for better mobile display -->
 +
            <div class="navbar-header">
 +
                <button type="button" class="navbar-toggle collapsed" data-toggle="collapse"
 +
                        data-target="#bs-example-navbar-collapse-1" aria-expanded="false">
 +
                    <span class="sr-only">Toggle navigation</span>
 +
                    <span class="icon-bar"></span>
 +
                    <span class="icon-bar"></span>
 +
                    <span class="icon-bar"></span>
 +
                </button>
 +
                <a class="navbar-brand" href="#"><img
 +
                        src="https://static.igem.org/mediawiki/2017/8/8c/%E5%91%80%E5%95%8A%E5%93%88.jpeg" width="100"></a>
 +
            </div>
  
<style type='text/css'>
+
            <!-- Collect the nav links, forms, and other content for toggling -->
 +
            <div class="collapse navbar-collapse" id="bs-example-navbar-collapse-1">
 +
                <ul class="nav navbar-nav">
 +
                    <li><a href="/Team:SDSZ-China">Home</a></li>
 +
                    <li><a href="/Team:SDSZ-China/Project">Project</a></li>
 +
                    <li><a href="/Team:SDSZ-China/Experiment">Experiment</a></li>
 +
                    <li><a href="/Team:SDSZ-China/Parts">Parts</a></li>
 +
                    <li><a href="/Team:SDSZ-China/Human_Practices">Human Practices</a></li>
 +
                    <li><a href="/Team:SDSZ-China/Safety">Safety</a></li>
 +
                    <li><a href="/Team:SDSZ-China/Hardware"> Hardware </a></li>
  
    #slideout {
+
                </ul>
        background: #FFD700;
+
                <ul class="nav navbar-nav navbar-right">
        position: fixed;
+
                    <li><a href="/Team:SDSZ-China/Team">Team and attributions</a></li>
        height: 300px;
+
                    <li><a href="#">By SDSZ</a></li>
        width: 200px;
+
                </ul>
        top: 30%;
+
            </div><!-- /.navbar-collapse -->
        right: -150px;
+
         </nav>
        padding-left: 60px;
+
        z-index: 30;
+
         border-radius: 25px;
+
  
    }
 
  
    #slideoutco {
+
         <div class="col-sm-12" style="padding-right:5%">
         position: fixed;
+
        height: 200px;
+
        width: 300px;
+
        top: 78%;
+
        right: 1%;
+
        padding-left: 10px;
+
        padding-right: 10px;
+
        border-radius: 10px;
+
        z-index: 30;
+
    }
+
  
    #clickme {
+
            <br>
        position: absolute;
+
            <br>
        top: 0;
+
        left: 0;
+
        height: 300px;
+
        width: 50px;
+
        background: #FFBA49;
+
        z-index: 30;
+
        border-radius: 25px 5px 5px 25px;
+
    }
+
  
    #slidecontent {
+
            <div class="text-center">
        float: left;
+
                    <h1 class="text-danger">SDSZ - China</h1>
    }
+
                    <h4 class="text-default">Automatic Synthesize of UDCA(effective ingredient of bear bile) using immobilized enzymes.</h4>
 +
            </div>
  
    #slidecontentco {
+
            <br>
        float: left;
+
            <br>
    }
+
            <br>
 
+
            <br>
    .vertical-text {
+
             <br>
        transform: rotate(90deg);
+
             <br>
        transform-origin: left bottom 0;
+
         </div>
        float: left;
+
     </div>
    }
+
 
+
    /* The switch - the box around the slider */
+
    .switch {
+
        position: relative;
+
        display: inline-block;
+
        width: 60px;
+
        height: 34px;
+
    }
+
 
+
    /* Hide default HTML checkbox */
+
    .switch input {
+
        display: none;
+
    }
+
 
+
    /* The slider */
+
    .slider {
+
        position: absolute;
+
        cursor: pointer;
+
        top: 0;
+
        left: 0;
+
        right: 0;
+
        bottom: 0;
+
        background-color: #ccc;
+
        -webkit-transition: .4s;
+
        transition: .4s;
+
    }
+
 
+
    .slider:before {
+
        position: absolute;
+
        content: "";
+
        height: 26px;
+
        width: 26px;
+
        left: 4px;
+
        bottom: 4px;
+
        background-color: white;
+
        -webkit-transition: .4s;
+
        transition: .4s;
+
    }
+
 
+
    input:checked + .slider.bluecolorbutton {
+
        background-color: #2196F3;
+
    }
+
 
+
    input:focus + .slider.bluecolorbutton {
+
        box-shadow: 0 0 1px #2196F3;
+
    }
+
 
+
    input:checked + .slider.redcolorbutton {
+
        background-color: #FF0000;
+
    }
+
 
+
    input:focus + .slider.redcolorbutton {
+
        box-shadow: 0 0 1px #FF0000;
+
    }
+
 
+
    input:checked + .slider:before {
+
        -webkit-transform: translateX(26px);
+
        -ms-transform: translateX(26px);
+
        transform: translateX(26px);
+
    }
+
 
+
    /* Rounded sliders */
+
    .slider.round {
+
        border-radius: 34px;
+
    }
+
 
+
    .slider.round:before {
+
        border-radius: 50%;
+
    }
+
 
+
    input[type=text] {
+
        width: 100%;
+
        padding: 12px 20px;
+
        margin: 8px 0;
+
        box-sizing: border-box;
+
        border: 3px solid #ccc;
+
        -webkit-transition: 0.5s;
+
        transition: 0.5s;
+
        outline: none;
+
    }
+
 
+
    input[type=text]:focus {
+
        border: 3px solid #555;
+
    }
+
</style>
+
<script>
+
    $(function () {
+
        var rightVal = -150;
+
 
+
        $("#clickme").click(function () {
+
 
+
             rightVal = (rightVal * -1) - 150;
+
             $(this).parent().animate({right: rightVal + 'px'}, {queue: false, duration: 500});
+
         });
+
 
+
     });
+
 
+
 
+
</script>
+
  
 +
    <div class="backgroundpic">
 +
        <img src="https://static.igem.org/mediawiki/2017/6/62/%E8%83%8C%E6%99%AF1.jpeg" width="100%"
 +
            height="100%" id="bg" alt="">
 +
    </div>
 +
</div>
  
 
</body>
 
</body>
  
 
</html>
 
</html>

Latest revision as of 03:24, 2 November 2017


Project



SDSZ - China

Automatic Synthesize of UDCA(effective ingredient of bear bile) using immobilized enzymes.