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Latest revision as of 16:42, 15 December 2017
概述
STAR
STAR一种能在细菌中实现基于RNA的逻辑运算的新技术。 STAR系统由两个短的RNA片段组成，分别是Target和Antisense。 Target中的发夹结构就如同基因回路中的终止子或衰减子，通常插入开放阅读框的上游来阻断表达。 Antisense是一条短RNA，它是Target一部分的严格互补链。 一旦Target和Antisense发生配对结合，Target中的发夹结构就会发生改变，从而激活下游蛋白的表达。
多因子
STAR是一种高效的利用RNA调控基因表达的技术。它像一座桥梁，将诸如对环境敏感的启动子等感受器与荧光蛋白等报告基因连接起来。考虑到其强大的逻辑特性，我们决定利用STAR构建一个多因子生物检测器。我们已经有一系列经过设计和验证的STAR系统。首先，基于以前的工作和相关文献，我们选择了现有的具有最高激活倍数的STAR（记为STAR1）作为我们的控制器之一。紧接着，通过修改一个旧的STAR系统（表示为STAR2），我们设计了一个新的STAR（表示为STAR3），它解决了STAR2抑制效果差的问题。最后，我们整合了STAR1，STAR3，感受器和报告基因来创建多因子生物探测器。
色素蛋白
为了搭建一个肉眼可见的检测系统，我们决定使用色素蛋白作为我们的报告蛋白。 色素蛋白是一种含有色素结构的蛋白质，可以在光照下显示相应的颜色。我们选择它作为报蛋白有以下两个主要原因：产生的颜色易于观测和色素蛋白的种类多。与需要特定波长激发光的荧光蛋白相比，用肉眼就能观察的色素蛋白自然成为更方便的报告蛋白。另外，色素蛋白还有与色素相同的特性，我们能够混合两种不同的色素蛋白来形成形成第三种颜色，而且它也遵循与颜料相同的混色理论。
Small CAT
其实，这些年来色素蛋白已经得到了广泛的应用，但我们没有找到任何一个能同时满足有效和便捷的检测色素蛋白的方法。因此，我们开发了一种通过手机来拍照和分析颜色参数来实现浓度检测的新方法。这个检测系统被称为small Chromoprotein Analyze Toolbox，简称smallCAT。这个系统还可以通过生成颜色矩阵或比色卡来识别多种色素蛋白表达得到的混合色。 使用者会用一个专用的盒子来控制环境光照等对拍照过程的影响。分析程序能在手机端以APP的形式运行或者在MATLAB平台运行。
