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Revision as of 08:29, 13 December 2017

概述

STAR

STAR一种能在细菌中实现基于RNA的逻辑运算的新技术。 STAR系统由两个短的RNA片段组成，分别是Target和Antisense。 Target中的发夹结构就如同基因回路中的终止子或衰减子，通常插入开放阅读框的上游来阻断表达。 Antisense是一条短RNA，它是Target一部分的严格互补链。一旦Target和Antisense发生配对结合，Target中的发夹结构就会发生改变，从而激活下游蛋白的表达。

Multi-factor

STAR是一种高效的利用RNA调控基因表达的技术。它像一座桥梁，将诸如对环境敏感的启动子等感受器与荧光蛋白等报告基因连接起来。考虑到其强大的逻辑特性，我们决定利用STAR构建一个多因子生物检测器。我们已经有一系列经过设计和验证的STAR系统。首先，基于以前的工作和相关文献，我们选择了现有的具有最高激活倍数的STAR（记为STAR1）作为我们的控制器之一。紧接着，通过修改一个旧的STAR系统（表示为STAR2），我们设计了一个新的STAR（表示为STAR3），它解决了STAR2抑制效果差的问题。最后，我们整合了STAR1，STAR3，感受器和报告基因来创建多因子生物探测器。

Chromoprotein

为了搭建一个肉眼可见的检测系统，我们决定使用色素蛋白作为我们的报告蛋白。色素蛋白是一种含有色素结构的蛋白质，可以在光照下显示相应的颜色。我们选择它作为报蛋白有以下两个主要原因：产生的颜色易于观测和色素蛋白的种类多。与需要特定波长激发光的荧光蛋白相比，用肉眼就能观察的色素蛋白自然成为更方便的报告蛋白。另外，色素蛋白还有与色素相同的特性，我们能够混合两种不同的色素蛋白来形成形成第三种颜色，而且它也遵循与颜料相同的混色理论。

Small CAT

其实，这些年来色素蛋白已经得到了广泛的应用，但我们没有找到任何一个能同时满足有效和便捷的检测色素蛋白的方法。因此，我们开发了一种通过手机来拍照和分析颜色参数来实现浓度检测的新方法。这个检测系统被称为small Chromoprotein Analyze Toolbox，简称smallCAT。这个系统还可以通过生成颜色矩阵或比色卡来识别多种色素蛋白表达得到的混合色。使用者会用一个专用的盒子来控制环境光照等对拍照过程的影响。分析程序能在手机端以APP的形式运行或者在MATLAB平台运行。

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                      <div class="col-12 col-lg-9">
                          <div class="my-title h5-my-responsive" id="section1">STAR</div>
-                         <p><span class="toolt" data-toggle="tooltip" data-placement="bottom" title="Small Transcriptional-Activating RNA">STAR</span> is a new technology that can be used for implementing RNA logic in bacterial cells. STAR system consists of two short RNA segments, namely Target and Antisense respectively. The hairpin structure in Target acts like terminator or attenuator in the gene circuit, which is often inserted in the upstream of the open reading frame to block the expression. Antisense is a short RNA which is strictly complementary strand of part of Target. As soon as the strong combination between Target and Antisense occurs, the hairpin structure in Target will be altered, which further activates the expression of downstream proteins.</p>
+                         <p><span class="toolt" data-toggle="tooltip" data-placement="bottom" title="Small Transcriptional-Activating RNA">STAR</span>一种能在细菌中实现基于RNA的逻辑运算的新技术。 STAR系统由两个短的RNA片段组成，分别是Target和Antisense。 Target中的发夹结构就如同基因回路中的终止子或衰减子，通常插入开放阅读框的上游来阻断表达。 Antisense是一条短RNA，它是Target一部分的严格互补链。 一旦Target和Antisense发生配对结合，Target中的发夹结构就会发生改变，从而激活下游蛋白的表达。</p>
                          <div class="figure-intro">
                              <img src="https://static.igem.org/mediawiki/2017/1/13/T--SJTU-BioX-Shanghai--17z05.png" class="img-fluid">
                          </div>
                          <div class="my-title h5-my-responsive" id="section2">Multi-factor</div>
-                         <p>STAR is an effective RNA logic technology. It acts like a bridge to connect sensors such environment-sensitive promoters, with reporters such as fluorescent proteins. Considering its strong logical feature, we determine to use STAR to construct a multi-factor bio-detector. There is a series of STARs which have been rationally designed and well characterized. Based on previous work, we choose one existing STAR (denoted as STAR1) which possesses the highest activation efficiency as one of our regulators, and design a new one (denoted as STAR3) by modifying an old one (denoted as STAR2). Finally, we integrate STAR1, STAR3, sensors and reporters to create the multi-factor bio-detector.</p>
+                         <p>STAR是一种高效的利用RNA调控基因表达的技术。它像一座桥梁，将诸如对环境敏感的启动子等感受器与荧光蛋白等报告基因连接起来。考虑到其强大的逻辑特性，我们决定利用STAR构建一个多因子生物检测器。我们已经有一系列经过设计和验证的STAR系统。首先，基于以前的工作和相关文献，我们选择了现有的具有最高激活倍数的STAR（记为STAR1）作为我们的控制器之一。紧接着，通过修改一个旧的STAR系统（表示为STAR2），我们设计了一个新的STAR（表示为STAR3），它解决了STAR2抑制效果差的问题。最后，我们整合了STAR1，STAR3，感受器和报告基因来创建多因子生物探测器。</p>
                          <div class="figure-intro">
                              <img src="https://static.igem.org/mediawiki/2017/f/f6/T--SJTU-BioX-Shanghai--17z06.png" class="img-fluid">
                          </div>
                          <div class="my-title h5-my-responsive" id="section3">Chromoprotein</div>
-                         <p>In order to construct a visible detection system, we determine to use chromoprotein as our reporter. Chromoprotein is a kind of protein which contains the structure of pigment so it can display relevant color under light. We choose it as the reporter for two main reasons: easy-to-detect and variability. The property of easy identification by naked eyes makes it a  more convenient tool comparing to fluorescent proteins which require specific excitation light. Also, with the same feature as pigment, mixing two different chromoproteins can form a third color under the color mixing theory.</p>
+                         <p>为了搭建一个肉眼可见的检测系统，我们决定使用色素蛋白作为我们的报告蛋白。 色素蛋白是一种含有色素结构的蛋白质，可以在光照下显示相应的颜色。我们选择它作为报蛋白有以下两个主要原因：产生的颜色易于观测和色素蛋白的种类多。与需要特定波长激发光的荧光蛋白相比，用肉眼就能观察的色素蛋白自然成为更方便的报告蛋白。另外，色素蛋白还有与色素相同的特性，我们能够混合两种不同的色素蛋白来形成形成第三种颜色，而且它也遵循与颜料相同的混色理论。</p>
                          <div class="figure-intro">
                              <img src="https://static.igem.org/mediawiki/2017/9/91/T--SJTU-BioX-Shanghai--17z02.png" class="img-fluid">
                          </div>
                          <div class="my-title h5-my-responsive" id="section4">Small CAT</div>
-                         <p>Chromoproteins have been wildly used these years, but we haven't found any effective and convenient way to measure their concentration. So, we develop a new method to achieve the concentration measurement by taking pictures and analyzing the colorimetric values in mobile device. This detection system is called small Chromoprotein Analyze Toolbox, short for smallCAT, which can also identify any mixed color by generating a color chart or colorimetric card. A customized plastic box is used for controlling environmental impacts and the analyze program can be installed as an APP in mobile device or run in MATLAB in desktops.</p>
+                         <p>其实，这些年来色素蛋白已经得到了广泛的应用，但我们没有找到任何一个能同时满足有效和便捷的检测色素蛋白的方法。因此，我们开发了一种通过手机来拍照和分析颜色参数来实现浓度检测的新方法。这个检测系统被称为small Chromoprotein Analyze Toolbox，简称smallCAT。这个系统还可以通过生成颜色矩阵或比色卡来识别多种色素蛋白表达得到的混合色。 使用者会用一个专用的盒子来控制环境光照等对拍照过程的影响。分析程序能在手机端以APP的形式运行或者在MATLAB平台运行。</p>
                          <div class="figure-intro">
                              <img src="https://static.igem.org/mediawiki/2017/7/72/T--SJTU-BioX-Shanghai--17z01.png" class="img-fluid">