Difference between revisions of "Team:Stuttgart/Model"

Line 1: Line 1:
 
<html>
 
<html>
  
−
<script>
+
<!--- THIS IS WHERE THE HTML BEGINS --->
  
−
     // This is the jquery part of your template.
+
<head>
−
    // Try not modify any of this code too much since it makes your menu work.
+
     <link href="https://netdna.bootstrapcdn.com/bootstrap/3.0.0/css/bootstrap.min.css" rel="stylesheet"
 +
          id="bootstrap-css">
 +
    <style>
  
−
    $(document).ready(function() {
 
  
−
         $("#HQ_page").attr('id','');
+
         /***************************************************** DEFAULT WIKI SETTINGS  ****************************************************/
  
−
         // call the functions that control the menu
+
         /* Clear the default wiki settings */
−
        menu_functionality();
+
−
        hide_show_menu();
+
  
 +
        #home_logo, #sideMenu {
 +
            display: none;
 +
        }
  
 +
        #sideMenu, #top_title, .patrollink {
 +
            display: none;
 +
        }
  
−
         //this function controls the expand and collapse buttons of the menu and changes the +/- symbols
+
         #content {
−
         function menu_functionality() {
+
            width: 100%;
 +
            padding: 0px;
 +
            margin-top: -7px;
 +
            margin-left: 0px;
 +
         }
  
−
            //when clicking on a "menu_button", it will change the "+/-" accordingly and it will show/hide the corresponding submenu
+
        body {
−
             $(".menu_button").click(function(){
+
             background: white;
 +
        }
  
−
                // add or remove the class "open" , this class holds the "-"
+
        #bodyContent h1, #bodyContent h2, #bodyContent h3, #bodyContent h4, #bodyContent h5 {
−
                $(this).children().toggleClass("open");
+
            margin-bottom: 0;
−
                // show or hide the submenu
+
            color: #F8CE63;
−
                $(this).next('.submenu_wrapper').fadeToggle(400);
+
        }
−
            });
+
  
−
            // when the screen size is smaller than 800px, the display_menu_control button appears and will show/hide the whole menu
+
        table {;
−
            $("#display_menu_control").click(function(){
+
        }
−
                $('#menu_content').fadeToggle(400);
+
−
            });
+
  
−
            // call the current page highlight function
+
        /**************************************************************** MENU ***************************************************************/
−
             highlight_current_page();
+
        /* Wrapper for the menu */
 +
        .igem_2017_menu_wrapper {
 +
            width: 15%;
 +
            height: 100vh;
 +
            position: fixed;
 +
            right: 0;
 +
            padding: 0;
 +
            float: right;
 +
            border-left: 1px solid #F8CE63;
 +
            background-color: white;
 +
            text-align: left;
 +
            font-family: Tahoma, Geneva, sans-serif;
 +
            overflow-y: auto;
 +
             overflow-x: hidden;
 
         }
 
         }
  
 +
        /* this hides the scrollbar to keep view consistency */
 +
        .igem_2017_menu_wrappe::-webkit-scrollbar {
 +
            display: none;
 +
        }
  
−
         // call the highlight current page function to show it on the menu with a different background color
+
         /* styling for links in the menu, removes the line under text */
−
         function highlight_current_page() {
+
         .igem_2017_menu_wrapper a {
 +
            text-decoration: none;
 +
        }
  
−
            // select a page from the menu based on the id assigned to it and the current page name and add the class "current page" to make it change background color
+
        /* styling for the images in the menu */
−
             $("#"+  wgPageName.substring(wgPageName.lastIndexOf("/")+1, wgPageName.length ) + "_page").addClass("current_page");
+
        .igem_2017_menu_wrapper img {
 +
             width: 100%;
 +
        }
  
−
            // now that the current_page class has been added to a menu item, make the submenu fade in
+
        /* styling for the menu buttons */
−
            $(".current_page").parents(".submenu_wrapper").fadeIn(400);
+
        .igem_2017_menu_wrapper .menu_button {
−
             // change the +/- symbol of the corresponding menu button
+
            width: 100%;
−
             $(".current_page").parents(".submenu_wrapper").prev().children().toggleClass("open");
+
             padding: 10px 0px 10px 15px;
 +
            float: left;
 +
            border-bottom: 1px solid #F8CE63;
 +
             font-size: 16px;
 +
            font-weight: bold;
 +
            color: #F8CE63;
 +
            cursor: pointer;
 +
        }
  
 +
        .igem_2017_menu_wrapper .menu_bottom_padding {
 +
            width: 100%;
 +
            height: 30px;
 +
            float: left;
 
         }
 
         }
  
 +
        .menu_button.direct_to_page {
 +
            padding-left: 36px;
 +
        }
  
 +
        .igem_2017_menu_wrapper .menu_button .expand_collapse_icon {
 +
            width: 10%;
 +
            float: left;
 +
        }
  
−
         // allow button on the black menu bar to show/hide the side menu
+
         .igem_2017_menu_wrapper .menu_button .expand_collapse_icon::before {
−
         function hide_show_menu() {
+
            content: "+";
 +
         }
  
−
            // in case you preview mode is selected, the menu is hidden for better visibility
+
        /* styling for the menu buttons on hover */
−
            if (window.location.href.indexOf("submit") >= 0) {
+
        .igem_2017_menu_wrapper .menu_button:hover, .igem_2017_menu_wrapper .submenu_button:hover, .submenu_button.current_page:hover {
−
                $(".igem_2017_menu_wrapper").hide();
+
            background-color: #F8CE63;
−
             }
+
             text-decoration: none;
 +
            color: #190707;
 +
        }
  
−
            // if the black menu bar has been loaded
+
        /* styling for the menu button when it is the current page */
−
            if (document.getElementById('bars_item')) {
+
        .current_page {
 +
            background-color: white !important;
 +
            color: #F8CE63 !important;
 +
        }
  
−
                // when the "bars_item" has been clicked
+
        /* styling for the submenu buttons */
−
                $("#bars_item").click(function() {
+
        .igem_2017_menu_wrapper .submenu_button {
−
                    $("#sideMenu").hide();
+
            width: 100%;
 +
            padding: 10px 0px 10px 34px;
 +
            float: left;
 +
            background-color: white;
 +
            border-bottom: 1px solid #F8CE63;
 +
            font-size: 15px;
 +
            color: #F8CE63;
 +
            cursor: pointer;
 +
        }
  
−
                    // show/hide the menu wrapper
+
        /* wrapper for the submenu items, they are hidden by default*/
−
                    $(".igem_2017_menu_wrapper").fadeToggle("100");
+
        .igem_2017_menu_wrapper .submenu_wrapper {
−
                });
+
            display: none;
−
            }
+
        }
  
−
            // because the black menu bars loads at a different time than the rest of the page, this function is set on a time out so it can run again in case it has not been loaded yet
+
        /* when the page size is bigger than 800px, this show/hide control is hidden by default */
−
            else {
+
        .igem_2017_menu_wrapper #display_menu_control {
−
                setTimeout(hide_show_menu, 15);
+
            display: none;
−
             }
+
             text-align: center;
 
         }
 
         }
  
 +
        /***************************************************** CONTENT OF THE PAGE ****************************************************/
  
−
    });
+
        /* Wrapper for the content */
 +
        .igem_2017_content_wrapper {
 +
            width: 83%;
 +
            margin: 0;
 +
            display: block;
 +
            float: left;
 +
            background-color: white;
 +
            font-family: Tahoma, Geneva, sans-serif;
 +
        }
  
 +
        /********************************* HTML STYLING  *********************************/
  
−
</script>
+
        /* styling for the titles h1 h2 */
 +
        .igem_2017_content_wrapper h1, .igem_2017_content_wrapper h2 {
 +
            color: #F8CE63;
 +
            padding: 15px 0 25px 0;
 +
            border-bottom: 0;
 +
        }
  
−
<style>
+
        /* styling for the titles  h3 h4 h5 h6*/
 +
        .igem_2017_content_wrapper h3, .igem_2017_content_wrapper h4, .igem_2017_content_wrapper h5, .igem_2017_content_wrapper h6 {
 +
            padding: 5px 15px;
 +
            border-bottom: 0;
 +
        }
  
 +
        /* font and text */
 +
        .container p,
 +
        #HQ_page p {
 +
            line-height: 24px;
 +
            font-size: 16px;
 +
            color: #333;
 +
        }
  
 +
        .igem_2017_content_wrapper img {
 +
            padding: 15px 0;
 +
        }
  
−
    /***************************************************** DEFAULT WIKI SETTINGS  ****************************************************/
+
        /* Links */
 +
        .igem_2017_content_wrapper a {
 +
            font-weight: bold;
 +
            text-decoration: underline;
 +
            text-decoration-color: #190707;
 +
            color: #3399ff;
 +
            -webkit-transition: all 0.4s ease;
 +
            -moz-transition: all 0.4s ease;
 +
            -ms-transition: all 0.4s ease;
 +
            -o-transition: all 0.4s ease;
 +
            transition: all 0.4s ease;
 +
        }
  
−
    /* Clear the default wiki settings */
+
        /* hover for the links */
 +
        .igem_2017_content_wrapper a:hover {
 +
            text-decoration: none;
 +
            color: #000000;
 +
        }
  
−
    #home_logo, #sideMenu { display:none; }
+
        /* non numbered lists */
−
    #sideMenu, #top_title, .patrollink  {display:none;}
+
        .igem_2017_content_wrapper ul {
−
    #content { width:100%; padding:0px; margin-top:-7px; margin-left:0px;}
+
            padding: 0px 20px;
−
    body {background:#190707 }
+
            font-size: 15px;
−
    #bodyContent h1, #bodyContent h2, #bodyContent h3, #bodyContent h4, #bodyContent h5 { margin-bottom: 0px; }
+
            font-family: Tahoma, Geneva, sans-serif;
−
  table {background:#ffffff url(https://static.igem.org/mediawiki/2017/4/46/LightupthepipeTEAMSTUtt.png); }
+
        }
  
 +
        /* numbered lists */
 +
        .igem_2017_content_wrapper ol {
 +
            padding: 0px;
 +
            font-size: 15px;
 +
            font-family: Tahoma, Geneva, sans-serif;
 +
        }
  
 +
        /* Table */
 +
        .igem_2017_content_wrapper table {
 +
            width: 97%;
 +
            margin: 15px 10px;
 +
            border: 2px solid #190707;
 +
            border-collapse: collapse;
 +
        }
  
−
    /**************************************************************** MENU ***************************************************************/
+
        /* table cells */
−
    /* Wrapper for the menu */
+
        .igem_2017_content_wrapper td {
−
    .igem_2017_menu_wrapper {
+
            padding: 10px;
−
        width: 15%;
+
            vertical-align: text-top;
−
        height:100vh;
+
            border: 1px solid #190707;
−
        position:fixed;
+
            border-collapse: collapse;
−
        right:0;
+
         }
−
        padding:0;
+
−
        float:right;
+
−
        border-left: 1px solid #F8CE63;
+
−
        background-color:#190707;
+
−
        text-align:left;
+
−
         font-family:Tahoma, Geneva, sans-serif;
+
−
        overflow-y: auto;
+
−
        overflow-x: hidden;
+
−
    }
+
  
−
    /* this hides the scrollbar to keep view consistency */
+
        /* table headers */
−
    .igem_2017_menu_wrappe::-webkit-scrollbar {
+
        .igem_2017_content_wrapper th {
−
        display: none;
+
            padding: 10px;
−
    }
+
            vertical-align: text-top;
 +
            border: 1px solid #190707;
 +
            border-collapse: collapse;
  
 +
        }
  
−
    /* styling for links in the menu, removes the line under text */
+
        /**********************************LAYOUT CLASSES **********************************/
−
    .igem_2017_menu_wrapper a {
+
−
        text-decoration: none;
+
−
    }
+
  
 +
        /* general class for column divs */
 +
        .igem_2017_content_wrapper .column {
 +
            padding: 10px 0px;
 +
            float: left;
 +
        }
  
−
    /* styling for the images in the menu */
+
        /* class for a full width column */
−
    .igem_2017_menu_wrapper img {
+
        .column .full_size {
−
        width: 100%;
+
            width: 100%;
−
    }
+
        }
  
−
    /* styling for the menu buttons */
+
        /* styling for images in a full width column*/
−
    .igem_2017_menu_wrapper .menu_button {
+
        .column.full_size img {
−
        width: 100%;
+
            width: 97%;
−
        padding: 10px 0px 10px 15px;
+
            padding: 10px 15px;
−
         float:left;
+
         }
−
        border-bottom: 1px solid #F8CE63;
+
−
        font-size: 20px;
+
−
        font-weight: bold;
+
−
        color: #F8CE63;
+
−
        cursor: pointer;
+
−
    }
+
  
 +
        /* class for a half width column */
 +
        .column.half_size {
 +
            width: 50%;
 +
        }
  
−
    .igem_2017_menu_wrapper .menu_bottom_padding {
+
        /* styling for images in a half width column*/
−
        width: 100%;
+
        .column.half_size img {
−
        height: 30px;
+
            width: 94.5%;
−
         float:left;
+
            padding: 10px 15px;
−
    }
+
         }
  
−
    .menu_button.direct_to_page {
+
         /********************************* SUPPORT CLASSES ********************************/
−
         padding-left: 36px;
+
−
    }
+
  
 +
        /* class that clears content below*/
 +
        .igem_2017_content_wrapper .clear {
 +
            clear: both;
 +
        }
  
−
    .igem_2017_menu_wrapper .menu_button .expand_collapse_icon {
+
        /* adds extra spacing when clearing content */
−
        width:10%;
+
        .igem_2017_content_wrapper .clear.extra_space {
−
         float:left;
+
            height: 30px;
−
    }
+
         }
  
−
    .igem_2017_menu_wrapper .menu_button .expand_collapse_icon::before {
+
        /* highlight class, makes content slightly smaller */
−
        content: "+";
+
        .igem_2017_content_wrapper .highlight {
−
    }
+
            margin: 0px 15px;
 +
            padding: 15px 0px;
 +
        }
  
−
    .open::before {
+
        /* highlight class, adds a gray background */
−
        content: "-" !important;
+
        .igem_2017_content_wrapper .highlight.gray {
−
    }
+
            background-color: #190707;
 +
        }
  
 +
        /* highlight with decoration blue line on top */
 +
        .igem_2017_content_wrapper .highlight.blue_top {
 +
            border-top: 4px solid #190707;
 +
        }
  
 +
        /* highlight with a full blue border decoration */
 +
        .igem_2017_content_wrapper .highlight.blue_border {
 +
            border: 4px solid #190707;
 +
        }
  
−
    /* styling for the menu buttons on hover */
+
        /* button class */
−
    .igem_2017_menu_wrapper .menu_button:hover, .igem_2017_menu_wrapper .submenu_button:hover ,  .submenu_button.current_page:hover {
+
        .igem_2017_content_wrapper .button {
−
        background-color: #F8CE63;
+
            max-width: 35%;
−
        text-decoration: none;
+
            margin: 30px auto;
−
        color:#190707;
+
            padding: 12px 10px;
−
    }
+
            background-color: #190707;
 +
            text-align: center;
 +
            color: #F8CE63;
 +
            -webkit-transition: all 0.4s ease;
 +
            -moz-transition: all 0.4s ease;
 +
            -ms-transition: all 0.4s ease;
 +
            -o-transition: all 0.4s ease;
 +
            transition: all 0.4s ease;
 +
        }
  
−
    /* styling for the menu button when it is the current page */
+
        /* styling for button on hover */
−
    .current_page {
+
        .igem_2017_content_wrapper .button:hover {
−
        background-color:#190707 !important;
+
            background-color: #190707;
−
        color:#F8CE63 !important;
+
            color: #F8CE63;
−
    }
+
        }
  
 +
        /***************************************************** RESPONSIVE STYLING ****************************************************/
  
−
    /* styling for the submenu buttons */
+
        *, *:before, *:after {
−
    .igem_2017_menu_wrapper .submenu_button {
+
            -webkit-box-sizing: border-box;
−
        width: 100%;
+
            -moz-box-sizing: border-box;
−
        padding: 10px 0px 10px 34px;
+
            box-sizing: border-box;
−
        float:left;
+
         }
−
        background-color:#190707;
+
−
        border-bottom: 1px solid #F8CE63;
+
−
        font-size: 15px;
+
−
         color: #F8CE63;
+
−
        cursor: pointer;
+
−
    }
+
  
−
    /* wrapper for the submenu items, they are hidden by default*/
+
        body {
−
    .igem_2017_menu_wrapper .submenu_wrapper {
+
            overflow-x: hidden;
−
        display:none;
+
            margin-top: 80px;
−
    }
+
            letter-spacing: 0.02em;
 +
        }
  
−
    /* when the page size is bigger than 800px, this show/hide control is hidden by default */
+
        /* IF THE SCREEN IS LESS THAN 1200PX */
−
    .igem_2017_menu_wrapper #display_menu_control {
+
         @media only screen and (max-width: 1024px) {
−
         display:none;
+
−
        text-align:center;
+
−
    }
+
  
 +
            #content {
 +
                width: 100%;
 +
            }
  
−
    /***************************************************** CONTENT OF THE PAGE ****************************************************/
+
            .igem_2017_content_wrapper {
 +
                width: 100%;
 +
            }
  
−
    /* Wrapper for the content */
+
            .igem_2017_menu_wrapper {
−
    .igem_2017_content_wrapper {
+
                width: 100%;
−
        width: 81%;
+
                height: 15%;
−
        margin: 2%;
+
                position: relative;
−
        display:block;
+
                left: 0;
−
        float:left;
+
            }
−
        background-color: #190707;
+
−
        font-family:Tahoma, Geneva, sans-serif;
+
−
    }
+
  
 +
            .highlight {
 +
                padding: 10px 0px;
 +
            }
  
−
    /********************************* HTML STYLING  *********************************/
+
            .igem_2017_menu_wrapper #display_menu_control {
 +
                display: none;
 +
            }
  
−
    /* styling for the titles h1 h2 */
+
            #menu_content {
−
    .igem_2017_content_wrapper h1, .igem_2017_content_wrapper h2 {
+
                display: block;
−
        color:#F8CE63;
+
            }
−
        padding:15px 0 25px 0;
+
−
        border-bottom: 0;
+
−
    }
+
  
−
    /* styling for the titles  h3 h4 h5 h6*/
+
            .menu_button.direct_to_page {
−
    .igem_2017_content_wrapper h3, .igem_2017_content_wrapper h4, .igem_2017_content_wrapper h5, .igem_2017_content_wrapper h6 {
+
                padding-left: 17px;
−
        padding:5px 15px;
+
            }
−
         border-bottom:0;
+
         }
−
    }
+
  
−
    /* font and text */
+
        /* IF THE SCREEN IS LESS THAN 800PX */
−
    .igem_2017_content_wrapper p {
+
         @media only screen and (max-width: 800px) {
−
         padding: 15px 0;
+
−
        font-size: 16px;
+
−
    }
+
−
    .igem_2017_content_wrapper img {
+
−
        padding: 15px 0;
+
−
    }
+
  
−
    /* Links */
+
            .igem_2017_content_wrapper {
−
    .igem_2017_content_wrapper a {
+
                width: 100%;
−
        font-weight: bold;
+
                margin-left: 0;
−
        text-decoration: underline;
+
            }
−
        text-decoration-color: #190707;
+
−
        color:  #3399ff;
+
−
        -webkit-transition: all 0.4s ease;
+
−
        -moz-transition: all 0.4s ease;
+
−
        -ms-transition: all 0.4s ease;
+
−
        -o-transition: all 0.4s ease;
+
−
        transition: all 0.4s ease;
+
−
    }
+
  
−
    /* hover for the links */
+
            .column.half_size {
−
    .igem_2017_content_wrapper a:hover {
+
                width: 100%;
−
        text-decoration:none;
+
            }
−
        color:#000000;
+
−
    }
+
  
−
    /* non numbered lists */
+
            .column.full_size img, .column.half_size img {
−
    .igem_2017_content_wrapper ul {
+
                width: 100%;
−
        padding:0px 20px;
+
                padding: 10px 0;
−
        font-size: 15px;
+
            }
−
        font-family:Tahoma, Geneva, sans-serif;
+
−
    }
+
  
−
    /* numbered lists */
+
            .highlight {
−
    .igem_2017_content_wrapper ol {
+
                padding: 15px 5px;
−
        padding:0px;
+
            }
−
        font-size: 15px;
+
−
        font-family:Tahoma, Geneva, sans-serif;
+
−
    }
+
  
−
    /* Table */
+
            .igem_2017_menu_wrapper #display_menu_control {
−
    .igem_2017_content_wrapper table {
+
                display: block;
−
        width: 97%;
+
            }
−
        margin:15px 10px;
+
−
        border: 2px solid #190707;
+
−
        border-collapse: collapse;
+
−
        background: url("https://static.igem.org/mediawiki/2017/4/46/LightupthepipeTEAMSTUtt.png");  
+
−
    }
+
  
−
    /* table cells */
+
            #menu_content {
−
    .igem_2017_content_wrapper  td {
+
                display: none;
−
        padding: 10px;
+
            }
−
        vertical-align: text-top;
+
−
        border: 1px solid #190707;
+
−
        border-collapse: collapse;
+
−
    }
+
  
−
    /* table headers */
+
            .igem_2017_menu_wrapper .menu_button .expand_collapse_icon {
−
    .igem_2017_content_wrapper th {
+
                width: 5%;
−
        padding: 10px;
+
            }
−
        vertical-align: text-top;
+
−
        border: 1px solid #190707;
+
−
        border-collapse: collapse;
+
−
       
+
−
    }
+
  
 +
            .menu_bottom_padding {
 +
                display: none;
 +
            }
  
−
    /**********************************LAYOUT CLASSES **********************************/
+
            .menu_button.direct_to_page {
 +
                padding-left: 36px;
 +
            }
 +
        }
  
−
    /* general class for column divs */
+
        /* special class that the system uses to make sure the team wants a page to be evaluated */
−
    .igem_2017_content_wrapper .column  {
+
        .judges-will-not-evaluate {
−
        padding: 10px 0px;
+
            width: 96.6%;
−
        float:left;
+
            margin: 5px 15px;
−
    }
+
            display: block;
 +
            border: 4px solid #3399ff;
 +
            font-weight: bold;
 +
        }
  
−
    /* class for a full width column */
+
        /* CUSTOM BS NAVBAR STYLES */
−
    .column .full_size {
+
        .navbar {
−
        width:100%;
+
            border: 0;
−
    }
+
        }
  
−
    /* styling for images in a full width column*/
+
        .navbar-default {
−
    .column.full_size img {
+
            margin-top: 15px;
−
        width:97%;
+
            background-color: #333;
−
        padding: 10px 15px;
+
        }
−
    }
+
  
−
    /* class for a half width column */
+
        .navbar-brand {
−
    .column.half_size {
+
            padding: 0;
−
        width: 50%;
+
            padding-left: 25px;
−
    }
+
            padding-right: 25px;
−
    /* styling for images in a half width column*/
+
        }
−
    .column.half_size img {
+
−
        width: 94.5%;
+
−
        padding: 10px 15px;
+
−
    }
+
  
 +
        .navbar-brand img {
 +
            height: 49px;
 +
        }
  
 +
        .navbar-default .navbar-nav > li > a {
 +
            color: white;
 +
        }
  
 +
        .navbar-default .navbar-nav > li > a:focus,
 +
        .navbar-default .navbar-nav > li > a:hover,
 +
        .navbar-default .navbar-nav > .dropdown > a .caret:hover {
 +
            color: #F8CE63;
 +
        }
  
−
    /********************************* SUPPORT CLASSES ********************************/
+
        .navbar-default .navbar-nav > .open > a,
 +
        .navbar-default .navbar-nav > .open > a:hover,
 +
        .navbar-default .navbar-nav > .open > a:focus {
 +
            color: #F8CE63;
 +
            background-color: #444;
 +
        }
  
−
    /* class that clears content below*/
+
        .navbar-default .navbar-nav > .dropdown > a .caret {
−
    .igem_2017_content_wrapper .clear {
+
            border-top-color: #eee;
−
        clear:both;
+
            border-bottom-color: #eee;
−
    }
+
        }
  
 +
        .dropdown-menu {
 +
            border: 0;
 +
        }
 +
        .dropdown-menu > li > a {
 +
            color: white;
 +
        }
  
−
    /* adds extra spacing when clearing content */
+
        .dropdown-menu > li > a:hover,
−
    .igem_2017_content_wrapper  .clear.extra_space {
+
        .dropdown-menu > li > a:focus {
−
        height: 30px;
+
            color: #111;
−
    }
+
            text-decoration: none;
 +
            background-color: #F8CE63;
 +
        }
  
 +
        .navbar-default .navbar-nav > .dropdown > a:hover .caret,
 +
        .navbar-default .navbar-nav > .dropdown > a:focus .caret {
 +
            border-top-color: white;
 +
            border-bottom-color: white;
 +
        }
  
−
    /* highlight class, makes content slightly smaller */
+
        @media (max-width: 767px) {
−
    .igem_2017_content_wrapper .highlight {
+
            .navbar-default .navbar-nav .open .dropdown-menu>li>a {
−
        margin: 0px 15px;
+
                color: #ddd;
−
        padding: 15px 0px;
+
            }
−
    }
+
            .navbar-default .navbar-nav .open .dropdown-menu>li>a:focus,
 +
            .navbar-default .navbar-nav .open .dropdown-menu>li>a:hover {
 +
                color: #F8CE63;
 +
            }
 +
        }
  
 +
        .navbar-nav>li>.dropdown-menu {
 +
            background-color: #444;
 +
        }
  
−
    /* highlight class, adds a gray background */
+
        .section {
−
    .igem_2017_content_wrapper .highlight.gray {
+
            margin: 25px 0;
−
        background-color: #190707;
+
        }
−
    }
+
  
−
     /* highlight with decoration blue line on top */
+
     </style>
−
     .igem_2017_content_wrapper .highlight.blue_top {
+
     <script src="https://code.jquery.com/jquery-1.10.2.min.js"></script>
−
        border-top: 4px solid #190707;
+
     <script src="https://netdna.bootstrapcdn.com/bootstrap/3.0.0/js/bootstrap.min.js"></script>
−
     }
+
  
−
     /* highlight with a full blue border decoration */
+
     <script>
−
    .igem_2017_content_wrapper .highlight.blue_border {
+
        $(document).ready(function(){
−
        border: 4px solid  #190707;
+
            $("#mw-content-text").removeClass("mw-content-ltr");
−
    }
+
        });
 +
    </script>
  
−
 
−
    /* button class */
 
−
    .igem_2017_content_wrapper .button{
 
−
        max-width: 35%;
 
−
        margin: 30px auto;
 
−
        padding: 12px 10px;
 
−
        background-color: #190707;
 
−
        text-align: center;
 
−
        color: #F8CE63;
 
−
        -webkit-transition: all 0.4s ease;
 
−
        -moz-transition: all 0.4s ease;
 
−
        -ms-transition: all 0.4s ease;
 
−
        -o-transition: all 0.4s ease; transition: all 0.4s ease;
 
−
    }
 
−
 
−
    /* styling for button on hover */
 
−
    .igem_2017_content_wrapper .button:hover{
 
−
        background-color: #190707;
 
−
        color: #F8CE63;
 
−
    }
 
−
 
−
 
−
 
−
 
−
    /***************************************************** RESPONSIVE STYLING ****************************************************/
 
−
 
−
    /* IF THE SCREEN IS LESS THAN 1200PX */
 
−
    @media only screen and (max-width: 1200px) {
 
−
 
−
        #content {width:100%; }
 
−
        .igem_2017_menu_wrapper {width:15%; right:0;}
 
−
        .highlight {padding:10px 0px;}
 
−
        .igem_2017_menu_wrapper #display_menu_control { display:none; }
 
−
        #menu_content { display:block;}
 
−
        .menu_button.direct_to_page {padding-left: 17px;}
 
−
 
−
    }
 
−
 
−
    /* IF THE SCREEN IS LESS THAN 800PX */
 
−
    @media only screen and (max-width: 800px) {
 
−
 
−
        .igem_2017_menu_wrapper { width:100%; height: 15%; position:relative; left:0%;}
 
−
        .igem_2017_content_wrapper {width:100%; margin-left:0px;}
 
−
        .column.half_size  {width:100%; }
 
−
        .column.full_size img, .column.half_size img {  width: 100%; padding: 10px 0px;}
 
−
        .highlight {padding:15px 5px;}
 
−
        .igem_2017_menu_wrapper #display_menu_control { display:block; }
 
−
        #menu_content { display:none;}
 
−
        .igem_2017_menu_wrapper .menu_button .expand_collapse_icon { width: 5%; }
 
−
        .menu_bottom_padding {display:none;}
 
−
        .menu_button.direct_to_page { padding-left: 36px; }
 
−
    }
 
−
 
−
 
−
 
−
 
−
 
−
    }
 
−
 
−
</style>
 
−
 
−
 
−
<!--- THIS IS WHERE THE HTML BEGINS --->
 
−
 
−
<head>
 
  
 
     <!-- This tells the browser that your page is responsive -->
 
     <!-- This tells the browser that your page is responsive -->
Line 448: Line 515:
  
 
</head>
 
</head>
−
 
+
<body>
  
 
<!--MENU-->
 
<!--MENU-->
−
<div class="igem_2017_menu_wrapper" >
+
<nav class="navbar navbar-default navbar-fixed-top">
−
 
+
     <div class="container-fluid">
−
 
+
         <!-- Brand and toggle get grouped for better mobile display -->
−
 
+
        <div class="navbar-header">
−
     <a href="https://2017.igem.org/Team:Stuttgart">
+
            <button type="button" class="navbar-toggle collapsed" data-toggle="collapse"
−
         <img src="https://static.igem.org/mediawiki/2017/4/45/Bildschirmfoto_2017-10-17_um_14.23.20.png">
+
                    data-target="#bs-example-navbar-collapse-1" aria-expanded="false">
−
    </a>
+
                <span class="sr-only">Toggle navigation</span>
−
 
+
                <span class="icon-bar"></span>
−
 
+
                <span class="icon-bar"></span>
−
    <!-- this div is hidden by default and will only be displayed if the screen size is too small -->
+
                <span class="icon-bar"></span>
−
    <div class="menu_button" id="display_menu_control">
+
            </button>
−
        MENU
+
            <a class="navbar-brand" href="https://2017.igem.org/Team:Stuttgart">
−
    </div>
+
                 <img alt="Team:Stuttgart"
−
 
+
                    src="https://static.igem.org/mediawiki/2017/1/18/UNISTUTTGARTLOGO.png">
−
    <div id="menu_content">
+
−
 
+
−
 
+
−
 
+
−
 
+
−
        <a href="https://2017.igem.org/Team:Stuttgart">
+
−
            <div class="menu_button direct_to_page">
+
−
                HOME
+
−
            </div>
+
−
        </a>
+
−
 
+
−
 
+
−
 
+
−
        <div class="menu_button">
+
−
            <div class="expand_collapse_icon"> </div> TEAM
+
−
        </div>
+
−
 
+
−
        <div class="submenu_wrapper" id="team_submenu">
+
−
 
+
−
            <a href="https://2017.igem.org/Team:Stuttgart/Team">
+
−
                 <div class="submenu_button" id="Team_page">
+
−
                    Team
+
−
                </div>
+
 
             </a>
 
             </a>
−
 
−
            <a href="https://2017.igem.org/Team:Stuttgart/Collaborations">
 
−
                <div class="submenu_button"  id="Collaborations_page">
 
−
                    Collaborations
 
−
                </div>
 
−
            </a>
 
−
 
−
 
 
         </div>
 
         </div>
  
 +
        <!-- Collect the nav links, forms, and other content for toggling -->
 +
        <div class="collapse navbar-collapse" id="bs-example-navbar-collapse-1">
 +
            <ul class="nav navbar-nav">
 +
                <li>
 +
                    <a href="https://2017.igem.org/Team:Stuttgart">Home</a>
 +
                </li>
 +
                <li class="dropdown">
 +
                    <a href="#" class="dropdown-toggle" data-toggle="dropdown" role="button" aria-haspopup="true"
 +
                      aria-expanded="false">Team <span class="caret"></span></a>
 +
                    <ul class="dropdown-menu">
 +
                        <li><a href="https://2017.igem.org/Team:Stuttgart/Team">Team</a></li>
 +
                        <li><a href="https://2017.igem.org/Team:Stuttgart/Attributions">Attributions</a></li>
 +
                        <li><a href="https://2017.igem.org/Team:Stuttgart/Sponsoring">Sponoring</a></li>
 +
                        <!--<li role="separator" class="divider"></li>-->
 +
                    </ul>
 +
                </li>
 +
                <li class="dropdown">
 +
                    <a href="#" class="dropdown-toggle" data-toggle="dropdown" role="button" aria-haspopup="true"
 +
                      aria-expanded="false">Project <span class="caret"></span></a>
 +
                    <ul class="dropdown-menu">
 +
                        <!--<li class="navbar-text navbar-left">Dry Lab</li>-->
 +
                        <li><a href="https://2017.igem.org/Team:Stuttgart/Description">Description</a></li>
 +
                        <li><a href="https://2017.igem.org/Team:Stuttgart/Background-Information">Background
 +
                            Information</a></li>
 +
                        <li><a href="https://2017.igem.org/Team:Stuttgart/Protocols">Protocols & Experiments</a></li>
 +
                        <li><a href="https://2017.igem.org/Team:Stuttgart/Notebook">Notebook</a></li>
 +
                        <li><a href="https://2017.igem.org/Team:Stuttgart/InterLab">Interlab Study</a></li>
 +
                        <li><a href="https://2017.igem.org/Team:Stuttgart/Model">Modelling</a></li>
 +
                        <li><a href="https://2017.igem.org/Team:Stuttgart/Results">Results</a></li>
 +
                        <li><a href="https://2017.igem.org/Team:Stuttgart/Parts">Parts</a></li>
 +
                        <!--<li role="separator" class="divider"></li>-->
 +
                    </ul>
 +
                </li>
 +
                <li>
 +
                    <a href="https://2017.igem.org/Team:Stuttgart/Safety">Safety</a>
 +
                </li>
 +
                <li class="dropdown">
 +
                    <a href="#" class="dropdown-toggle" data-toggle="dropdown" role="button" aria-haspopup="true"
 +
                      aria-expanded="false">Human Practices <span class="caret"></span></a>
 +
                    <ul class="dropdown-menu">
 +
                        <li><a href="https://2017.igem.org/Team:Stuttgart/Engagement">Public Engagement</a></li>
 +
                        <li><a href="https://2017.igem.org/Team:Stuttgart/HP/Gold_Integrated">Integrated and Gold</a>
 +
                        </li>
 +
                        <li><a href="https://2017.igem.org/Team:Stuttgart/HP/Silver">Silver HP</a></li>
 +
                        <li><a href="https://2017.igem.org/Team:Stuttgart/Collaborations">Collaborations</a></li>
 +
                    </ul>
 +
                </li>
 +
                <li class="dropdown">
 +
                    <a href="#" class="dropdown-toggle" data-toggle="dropdown" role="button" aria-haspopup="true"
 +
                      aria-expanded="false">Awards <span class="caret"></span></a>
 +
                    <ul class="dropdown-menu">
 +
                        <li><a href="https://2017.igem.org/Team:Stuttgart/Applied_Design">Applied Design</a></li>
 +
                        <li><a href="https://2017.igem.org/Team:Stuttgart/Measurement">Measurement</a></li>
 +
                    </ul>
 +
                </li>
 +
                <li>
 +
                    <a href="https://igem.org/2017_Judging_Form?team=Stuttgart">Judging Form</a>
 +
                </li>
 +
            </ul>
 +
        </div><!-- /.navbar-collapse -->
 +
    </div><!-- /.container-fluid -->
 +
</nav>
  
−
 
+
<!-- start of content -->
−
 
+
<h1 align=middle>Modelling</h1>
−
 
+
<div class="container">
−
        <div class="menu_button">
+
      <div class="row section">
−
            <div class="expand_collapse_icon">  </div> PROJECT
+
        <div class="col-xs-12 col-sm-12 col-md-12">
 +
            <p>Our modelling process considers three successional blocks:
 +
              The first one describes the synthesis and excretion of the desired enzymes, this is followed by the hair and lipid degradation block
 +
              and the last one depicts the synthesis of the rose scent.
 +
              The modelling and simulation team aims to describe the whole system with an equational system which characterizes the intracellular and extracellular concentration time courses of all enzymes, the degradation time courses as well as the produced rose scent.
 +
              In order to find the best enzyme composition for the maximal hair and lipid breakdown in a specific time period the 2nd modelling block is used to perform an optimization by the method of least square.
 +
              Finally, we want to examine the system’s sensitivity to fluctuations in temperature and pH value.</p>
 
         </div>
 
         </div>
−
 
−
        <!-- project submenu -->
 
−
        <div class="submenu_wrapper">
 
−
 
−
            <a href="https://2017.igem.org/Team:Stuttgart/Description">
 
−
                <div class="submenu_button"  id="Description_page">
 
−
                    Description
 
−
                </div>
 
−
            </a>
 
−
 
−
 
−
            <a href="https://2017.igem.org/Team:Stuttgart/Experiments">
 
−
                <div class="submenu_button"  id="Experiments_page">
 
−
                    Experiments
 
−
                </div>
 
−
            </a>
 
−
 
−
 
−
            <a href="https://2017.igem.org/Team:Stuttgart/Notebook">
 
−
                <div class="submenu_button"  id="Notebook_page">
 
−
                    Notebook
 
−
                </div>
 
−
            </a>
 
−
 
−
<a href="https://2017.igem.org/Team:Stuttgart/Protocols">
 
−
                <div class="submenu_button"  id="Protocols_page">
 
−
                    Protocols
 
−
                </div>
 
−
            </a>
 
−
 
−
            <a href="https://2017.igem.org/Team:Stuttgart/InterLab">
 
−
                <div class="submenu_button"  id="InterLab_page">
 
−
                    InterLab
 
−
                </div>
 
−
            </a>
 
−
 
−
            <a href="https://2017.igem.org/Team:Stuttgart/Contribution">
 
−
                <div class="submenu_button"  id="Contribution_page">
 
−
                    Contribution
 
−
                </div>
 
−
            </a>
 
−
 
−
            <a href="https://2017.igem.org/Team:Stuttgart/Model">
 
−
                <div class="submenu_button"  id="Model_page">
 
−
                    Model
 
−
                </div>
 
−
            </a>
 
−
 
−
            <a href="https://2017.igem.org/Team:Stuttgart/Results">
 
−
                <div class="submenu_button"  id="Results_page">
 
−
                    Results
 
−
                </div>
 
−
            </a>
 
−
 
−
 
−
 
−
            <a href="https://2017.igem.org/Team:Stuttgart/Improve">
 
−
                <div class="submenu_button"  id="Improve_page">
 
−
                    Improve
 
−
                </div>
 
−
            </a>
 
−
 
−
            <a href="https://2017.igem.org/Team:Stuttgart/Attributions">
 
−
                <div class="submenu_button"  id="Attributions_page">
 
−
                    Attributions
 
−
                </div>
 
−
            </a>
 
−
 
−
        </div>
 
−
 
−
 
−
 
−
 
−
 
−
 
−
        <div class="menu_button">
 
−
            <div class="expand_collapse_icon">  </div> PARTS
 
−
        </div>
 
−
 
−
        <!-- parts submenu -->
 
−
        <div class="submenu_wrapper">
 
−
 
−
            <a href="https://2017.igem.org/Team:Stuttgart/Parts">
 
−
                <div class="submenu_button"  id="Parts_page">
 
−
                    Parts
 
−
                </div>
 
−
            </a>
 
−
 
−
            <a href="https://2017.igem.org/Team:Stuttgart/Basic_Part">
 
−
                <div class="submenu_button"  id="Basic_Part_page">
 
−
                    Basic Parts
 
−
                </div>
 
−
            </a>
 
−
 
−
            <a href="https://2017.igem.org/Team:Stuttgart/Composite_Part">
 
−
                <div class="submenu_button"  id="Composite_Part_page">
 
−
                    Composite Parts
 
−
                </div>
 
−
            </a>
 
−
 
−
            <a href="https://2017.igem.org/Team:Stuttgart/Part_Collection">
 
−
                <div class="submenu_button"  id="Part_Collection_page">
 
−
                    Part Collection
 
−
                </div>
 
−
            </a>
 
−
        </div>
 
−
 
−
 
−
 
−
 
−
 
−
 
−
        <a href="https://2017.igem.org/Team:Stuttgart/Safety">
 
−
            <div class="menu_button direct_to_page">
 
−
                SAFETY
 
−
            </div>
 
−
        </a>
 
−
 
−
 
−
 
−
 
−
 
−
 
−
 
−
        <div class="menu_button" >
 
−
            <div class="expand_collapse_icon">  </div> HUMAN PRACTICES
 
−
        </div>
 
−
 
−
        <!-- human practices submenu -->
 
−
        <div class="submenu_wrapper">
 
−
 
−
            <a href="https://2017.igem.org/Team:Stuttgart/HP/Silver">
 
−
                <div class="submenu_button"  id="Silver_page">
 
−
                    Silver HP
 
−
                </div>
 
−
            </a>
 
−
 
−
            <a href="https://2017.igem.org/Team:Stuttgart/HP/Gold_Integrated">
 
−
                <div class="submenu_button" id="Gold_Integrated_page">
 
−
                    Integrated and Gold
 
−
                </div>
 
−
            </a>
 
−
 
−
 
−
            <a href="https://2017.igem.org/Team:Stuttgart/Engagement">
 
−
                <div class="submenu_button"  id="Engagement_page">
 
−
                    Public Engagement
 
−
                </div>
 
−
            </a>
 
−
 
−
        </div>
 
−
 
−
 
−
        <div class="menu_button">
 
−
            <div class="expand_collapse_icon">  </div> AWARDS
 
−
        </div>
 
−
 
−
        <!-- awards submenu -->
 
−
        <div class="submenu_wrapper">
 
−
 
−
            <a href="https://2017.igem.org/Team:Stuttgart/Applied_Design">
 
−
                <div class="submenu_button"  id="Applied_Design_page">
 
−
                    Applied Design
 
−
                </div>
 
−
            </a>
 
−
 
−
            <a href="https://2017.igem.org/Team:Stuttgart/Entrepreneurship">
 
−
                <div class="submenu_button"  id="Entrepreneurship_page">
 
−
                    Entrepreneurship
 
−
                </div>
 
−
            </a>
 
−
 
−
            <a href="https://2017.igem.org/Team:Stuttgart/Hardware">
 
−
                <div class="submenu_button"  id="Hardware_page">
 
−
                    Hardware
 
−
                </div>
 
−
            </a>
 
−
 
−
            <a href="https://2017.igem.org/Team:Stuttgart/Measurement">
 
−
                <div class="submenu_button"  id="Measurement_page">
 
−
                    Measurement
 
−
                </div>
 
−
            </a>
 
−
 
−
            <a href="https://2017.igem.org/Team:Stuttgart/Model">
 
−
                <div class="submenu_button"  id="Model_page">
 
−
                    Model
 
−
                </div>
 
−
            </a>
 
−
 
−
         
 
−
        </div>
 
−
 
−
        <a href="https://igem.org/2017_Judging_Form?team=Stuttgart">
 
−
            <div class="menu_button direct_to_page">
 
−
                JUDGING FORM
 
−
            </div>
 
−
        </a>
 
−
 
−
 
−
 
−
        <div class="menu_bottom_padding" >
 
−
        </div>
 
−
 
 
     </div>
 
     </div>
−
 
+
    <div class="row section">
−
 
+
     <div class="col-xs-12 col-sm-12 col-md-12">
−
 
+
        <!--<img src="https://static.igem.org/mediawiki/2017/6/68/TeamStuttgart_Schema2.jpeg">-->
−
 
+
        <img src="https://static.igem.org/mediawiki/2017/6/68/TeamStuttgart_Schema2.jpeg" class="img-responsive"/>
−
</div>
+
     </div>
−
 
+
  </div>
−
 
+
−
<!-- start of content -->
+
−
<div class="igem_2017_content_wrapper">
+
−
 
+
−
     <h1 align=middle>Model</h1>
+
−
<table>
+
−
<td bgcolor=#F8CE63>
+
−
    <p>Our modelling process considers three successional blocks: The first one describes the synthesis and  excretion of the desired enzymes, this is followed by the hair and lipid degradation block and the last one depicts the synthesis of the rose scent. The modelling and simulation team aims to describe the whole system with an equational system which characterizes the intracellular and extracellular concentration time courses of all enzymes, the degradation time courses as well as the produced rose scent. In order to find the best enzyme composition for the maximal hair and lipid breakdown in a specific time period the 2nd modelling block is used to perform an optimization by the method of least square. Finally, we want to examine the system’s sensitivity to fluctuations in temperature and pH value.
+
−
    <br>
+
−
<br> <img src="https://static.igem.org/mediawiki/2017/6/68/TeamStuttgart_Schema2.jpeg"/ hspace=40 align="middle" width=1100  height=670>  
+
−
     </p>
+
−
</td>
+
−
</table>
+
 
</div>
 
</div>
 +
</body>
 +
</html>

Revision as of 17:15, 29 October 2017

Modelling

Our modelling process considers three successional blocks: The first one describes the synthesis and excretion of the desired enzymes, this is followed by the hair and lipid degradation block and the last one depicts the synthesis of the rose scent. The modelling and simulation team aims to describe the whole system with an equational system which characterizes the intracellular and extracellular concentration time courses of all enzymes, the degradation time courses as well as the produced rose scent. In order to find the best enzyme composition for the maximal hair and lipid breakdown in a specific time period the 2nd modelling block is used to perform an optimization by the method of least square. Finally, we want to examine the system’s sensitivity to fluctuations in temperature and pH value.