Difference between revisions of "Team:TU Darmstadt/Demonstrate"

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<header class="major">
 
<header class="major">
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<h2>InterLab Measurement Studies</h2>
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<h2>Proof of Concept</h2>
 
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<p>iGEM is coping with the problem of different groups measuring fluorescence differently, in different units and evaluating the results non-identically. Therefore, the InterLab Study aims to develop a standardized protocol for repeatable fluorescence measurements of GFP.
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The study should be carried out and examined in different laboratories all over the world.  
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Here we want to give you a short tour about what we achieved in the project. We show our results and give a view on the resulting product, a <b>enzyme sensing hydrogel</b>.
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Our team followed the standardized procedure guiding us through transformation, inoculation and measurement process. <br>For more information: <a href="https://2017.igem.org/Competition/InterLab_Study">Fourth International InterLab Measurement Study</a> <br>
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Following below you can find our results.
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<section id="two"><div class="container">
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<section id="Synhtase"><div class="container">
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<h3>Calibration</h3>
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<h3>Chitin Synthase NodC</h3>
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<h5>OD<sub>600</sub> reference point</h5><br>
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<p><img src="https://static.igem.org/mediawiki/2017/1/13/T--TU_Darmstadt--Synthase_Pikto_fertig-neu.png" style="float:left;width:30%">Lorem ipsum dolor sit amet, consetetur sadipscing elitr, sed diam nonumy eirmod tempor invidunt ut labore et dolore magna aliquyam erat, sed diam voluptua. At vero eos et accusam et justo duo dolores et ea rebum. Stet clita kasd gubergren, no sea takimata sanctus est Lorem ipsum dolor sit amet. Lorem ipsum dolor sit amet, consetetur sadipscing elitr, sed diam nonumy eirmod tempor invidunt ut labore et dolore magna aliquyam erat, sed diam voluptua. At vero eos et accusam et justo duo dolores et ea rebum. Stet clita kasd gubergren, no sea takimata sanctus est Lorem ipsum dolor sit amet.
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<p>Several measurements of LUDOX-S40 and H<sub style="font-size: 0.9em;">²</sub>O were spectrometric analyzed below.</p>
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<p><table style = "width:70%"; "HEIGHT:40%">
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                                                <thead>
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                                                  <tr>
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                                                    <td></td>
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                                                    <td>LUDOX-S40</td>
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                                                    <td>H<sub style="font-size: 0.9em;">²</sub>O</td>
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                                                  </tr>
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                                              </thead>
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                                                <tr>
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                                            <td>Replicate 1</td>
+
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                                                    <td>0,041700002</td>
+
−
                                                    <td>0,035300002</td>
+
−
                                                </tr>
+
−
                                                <tr>
+
−
                                                    <td>Replicate 2</td>
+
−
                                                    <td>0,042399999</td>
+
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                                                    <td>0,035</td>
+
−
                                                </tr>
+
−
                                                <tr>
+
−
                                                    <td>Replicate 3</td>
+
−
                                                    <td>0,043000001</td>
+
−
                                                    <td>0,035700001</td>
+
−
                                                </tr>
+
−
                                                <tr>
+
−
                                                    <td>Replicate 4</td>
+
−
                                                    <td>0,043000001</td>
+
−
                                                    <td>0,034699999</td>
+
−
                                                </tr>
+
−
                                                <tr>
+
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                                                    <td>Arithmetic Mean</td>
+
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                                                    <td>0,042525001</td>
+
−
                                                    <td>0,035175</td>
+
−
                                                </tr>
+
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                                                <tr>
+
−
                                                    <td>Corrected Absorbance 600</td>
+
−
                                                    <td>0,007350001</td>
+
−
                                                </tr>
+
−
                                                <tr>
+
−
                                                    <td>Reference OD<sub>600</sub> </td>
+
−
                                                    <td>0,0425</td>
+
−
                                                </tr>
+
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                                                <tr>
+
−
                                                    <td>Correction Factor</td>
+
−
                                                    <td>5,78231249</td>
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                                                </tr>
+
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                                            </table>
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<figcaption> Table 1. Hier fehlt was!!!. </figcaption></center>
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<figure><center>
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<img src="https://static.igem.org/mediawiki/2017/1/1b/T--TU_Darmstadt--Interlab1.gif", alt="hier fehlt was", width=50%,>
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<figcaption> Figure 1. Hier fehlt was!!!. </figcaption></center>
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</figure>
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</p>
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<p>
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<h5>Fluorescein standard curve:</h5>
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<p>The fluorescence of a dilution series, fluorescein in four replicates were measured in standard modes in our Tecan plate reader (infinite 200Pro).</p>
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<p>
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<figure><center>
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<img src="https://static.igem.org/mediawiki/2017/9/9f/T--TU_Darmstadt--Interlab2.gif", alt="hier fehlt was", width=100%,>
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<figcaption> Table 2. Hier fehlt was!!!. </figcaption></center>
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</figure></p><br>
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<p>Generated standard curve of fluorescence for different fluorescein concentrations can be found below.</p><br>
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<figure><center>
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<img src="https://static.igem.org/mediawiki/2017/6/63/T--TU_Darmstadt--Interlab3.gif", alt="hier fehlt was", width=50%,>
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<figcaption> Figure 2. Hier fehlt was!!!. </figcaption></center>
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</figure>
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</p>
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<img src="https://static.igem.org/mediawiki/2017/0/09/T--TU_Darmstadt--Interlab4.gif", alt="hier fehlt was", width=50%,>
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<figcaption> Figure 3. Hier fehlt was!!!. </figcaption></center>
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</figure>
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<h3>Cell Measurement</h3>
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<h5>Fluorescence Measurement</h5>
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<p>Text!!!</p>
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<p>
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<figure><center>
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<img src="https://static.igem.org/mediawiki/2017/b/bd/T--TU_Darmstadt--Interlab5.gif", alt="hier fehlt was", width=70%,>
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<figcaption> Figure 4. Hier fehlt was!!!. </figcaption></center>
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</figure>
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</p>
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<h5>Absorbance 600 Measurement</h5>
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<p>Text!!!</p>
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<p>
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<figure><center>
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<img src="https://static.igem.org/mediawiki/2017/c/ca/T--TU_Darmstadt--Interlab6.gif", alt="hier fehlt was", width=70%,>
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<figcaption> Figure 5. Hier fehlt was!!!. </figcaption></center>
+
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</figure>
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</p>
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<h5>Fluorescein / OD<sub>600</sub></h5>
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<p>Text!!!</p>
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<p>
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<figure><center>
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<img src="https://static.igem.org/mediawiki/2017/2/2a/7.7.png", alt="hier fehlt was", width=70%,>
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<figcaption> Figure 6. Hier fehlt was!!!. </figcaption></center>
+
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</p>
 
</p>
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<br><br>
 
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<p>Abschlusssatz!!!</p>
 
 
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Revision as of 20:51, 29 October 2017

MainPage

Proof of Concept

Here we want to give you a short tour about what we achieved in the project. We show our results and give a view on the resulting product, a enzyme sensing hydrogel.

Chitin Synthase NodC

Lorem ipsum dolor sit amet, consetetur sadipscing elitr, sed diam nonumy eirmod tempor invidunt ut labore et dolore magna aliquyam erat, sed diam voluptua. At vero eos et accusam et justo duo dolores et ea rebum. Stet clita kasd gubergren, no sea takimata sanctus est Lorem ipsum dolor sit amet. Lorem ipsum dolor sit amet, consetetur sadipscing elitr, sed diam nonumy eirmod tempor invidunt ut labore et dolore magna aliquyam erat, sed diam voluptua. At vero eos et accusam et justo duo dolores et ea rebum. Stet clita kasd gubergren, no sea takimata sanctus est Lorem ipsum dolor sit amet.