Difference between revisions of "Team:AFCM-Egypt"

 
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    </style>
 
</head>
 
</head>
 
<body>
 
<body>
−
<header id="js-header">
+
 
−
                <div class="header-limiter">
+
    <div class="twitter-feed purple" style="padding-bottom:250px">
−
            <nav style="width: 100%;position: absolute;">
+
        <div class="container section-wrapper" style="padding-top:0px !important;width:90%">
−
                <ul id="menu">
+
             <div class="col-md-12 text-center">
−
                    <li class="active"><a href="#" id="homtst">HOME</a> </li>
+
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−
                    <li>
+
                    <source src="https://static.igem.org/mediawiki/2017/8/88/Final_vid.mp4" type="video/mp4">
−
                        <a>TEAM <span class="caret"></span></a>
+
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−
                        <ul>
+
−
                            <li><a href="meettheteam.html">Meat The Team</a></li>
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                            <li><a href="collaborations.html">Collaborations</a></li>
+
−
                        </ul>
+
−
                    </li>
+
−
                    <li>
+
−
                        <a>PROJECT <span class="caret"></span></a>
+
−
                        <ul>
+
−
                            <li><a href="description.html">Descreption</a></li>
+
−
                            <li><a href="experiment.html">Experiment</a></li>
+
−
                            <li><a href="result.html">Result</a></li>
+
−
                            <li><a href="proofofconcept.html">Proof of concept</a></li>
+
−
                        </ul>
+
−
                    </li>
+
−
                    <li class="dropdown">
+
−
                        <a>PARTS <span class="caret"></span></a>
+
−
                        <ul>
+
−
                            <li><a href="design.html">Design</a></li>
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                            <li><a href="parts.html">Parts</a></li>
+
−
                            <li><a href="basicpart.html">Basic Part</a></li>
+
−
                            <li><a href="compositepart.html">Composite Part</a></li>
+
−
                        </ul>
+
−
                    </li>
+
−
                    <li><a href="modeling.html">MODELING</a></li>
+
−
                    <li><a href="safety.html">SAFETY</a></li>
+
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                    <li><a href="humanpractice.html">HUMAN PRACTICE</a></li>
+
−
                    <li><a href="attributions.html">ATTRIBUTIONS</a></li>
+
−
                    <li><a href="medalcriteria.html">MEDAL CRITERIA</a></li>
+
−
                </ul>
+
−
            </nav>
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<div class="thumb1"></div>
+
−
<div class="stage">
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−
             <div class="cubespinner">
+
−
                <div class="face1"><img id="loading" src="https://static.igem.org/mediawiki/2017/8/80/AFCM-Egypt-logopng.png" alt="logo"></div>
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−
                <div class="face2"><img id="loading" src="https://static.igem.org/mediawiki/2017/8/80/AFCM-Egypt-logopng.png" alt="logo"></div>
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−
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                <div class="face4"><img id="loading" src="https://static.igem.org/mediawiki/2017/8/80/AFCM-Egypt-logopng.png" alt="logo"></div>
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                <div class="face5"><img id="loading" src="https://static.igem.org/mediawiki/2017/8/80/AFCM-Egypt-logopng.png" alt="logo"></div>
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                 <div class="face6"><img id="loading" src="https://static.igem.org/mediawiki/2017/8/80/AFCM-Egypt-logopng.png" alt="logo"></div>
+
 
             </div>
 
             </div>
 
         </div>
 
         </div>
−
        </div>
+
    </div>
−
     </header>
+
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−
        <div id="globalWrapper">
+
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−
         <div class="container">
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             <div class="row" style="margin-bottom: 50px;">
−
             <div class="allcontain" style="position: relative;margin-bottom: 30px">
+
                 <div class="col-md-6 text-center" style="float: none;height: auto ; width: 90%; margin: auto; background-color: rgba(0, 0, 0, 0.4);">
−
                 <div class="afcmslider-holder">
+
                     <p><img style="float: right;" src="https://static.igem.org/mediawiki/2017/d/d4/CRISPR_PNG.png" alt="" width="679" height="988" /></p>
−
                    <div id="afcmslides">
+
<h3 dir="ltr" style="text-align: left;"><span style="font-size: 20pt; color: #ffffff;">Competing endogenous RNA network : Potential entrants to gene editing in Hepatocellular Carcinoma</span><br /><br /><br />               
−
                     <button class="afcmcontrols" id="afcmcontrols-left">&#10094;</i></button>
+
  <h3 class="text-center" style="text-align: center;"><br /><br /><span style="font-size: 14pt; color: #ffffff;">Abstract</span></h3>
−
                    <button class="afcmcontrols" id="afcmcontrols-right">&#10095;</i></button>
+
                     <p style="text-align: left;"><span style="font-size: 14pt; color: #ffffff;">&nbsp;</span></p>
−
                        <img id="i1" class="afcmslide afcmshowing" src="https://static.igem.org/mediawiki/2017/1/11/AFCM-Egypt-home2.jpeg" style="width:100%">
+
                  <span style="font-size: 14pt; color: #ffffff;">Hepatocellular Carcinoma (HCC) is the leading cause of cancer deaths worldwide &amp; ranked first among cancers in males and next to breast cancer among females in</span><span style="font-size: 14pt; color: #ffffff;"> Egypt based upon results of National Cancer Registry Program of Egypt. "Grabbing the problem from the roots" is the best way to decently describe the use of CRISPR, a special gene editing technique that we will be using to modulate a certain&nbsp; circRNA and adjust its gene expression, which is down-regulated in hepatocellular carcinoma. This in consequence modifies&nbsp; &nbsp;miRNA expression thus amending the mRNA gene expression; which is the visible problem in our trials.&nbsp; &nbsp;This will lead us to adopt a novel strategy for miRNA suppression by using circRNAs. This is&nbsp; &nbsp; accomplished by utilizing a&nbsp; &nbsp;synthetic circuit to give rise to a springboard in our battle against cancer.</span><br /><br /><br /><br /><br /><br /><br /><br /><br /><br /><br /><br /><br /><br /><br /></h3>
−
                        <img id="i2" class="afcmslide" src="https://static.igem.org/mediawiki/2017/5/58/AFCM-Egypt-home3.jpeg" style="width:100%">
+
−
                        <img id="i3" class="afcmslide" src="https://static.igem.org/mediawiki/2017/3/39/AFCM-Egypt-home4.jpeg" alt="Third Slide" style="width:100%">
+
−
                    </div>
+
−
                     <div id="sdots" class="text-center" style="width:85%;position:absolute">
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                        <span class="adots dots" id="1" onclick="goToSlide(0)"></span>
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                        <span class="dots" id="2" onclick="goToSlide(1)"></span>
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                        <span class="dots" id="3" onclick="goToSlide(2)"></span>
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−
                    </div>
+
 
                 </div>
 
                 </div>
 
             </div>
 
             </div>
−
           
+
        </div>
−
           
+
    </section>
−
            <div class="row" style="background-color: #dbcaf7;border-radius:6px;margin-bottom:20px">
+
    <div class="twitter-feed purple" style="margin-bottom:50vh;background-color: rgba(0, 0, 0, 0.4);">
−
                <div class="col-lg-6 col-md-6 col-sm-12" style="padding: 10px 30px 10px 30px;">
+
        <div class="container section-wrapper">
−
                    <h2>Heading</h2>
+
            <div class='col-md-3'></div>
−
                    <p style="text-align: justify;">
+
            <div class='col-md-6 text-center'>
−
                        Donec id elit non mi porta gravida at eget metus. Fusce dapibus, tellus ac cursus commodo, tortor mauris condimentum nibh, ut fermentum massa justo sit amet risus. Etiam porta sem malesuada magna mollis euismod. Donec sed odio dui.
+
                <h2 class='text-center' style='margin-bottom:30px'>
−
                        Donec id elit non mi porta gravida at eget metus. Fusce dapibus, tellus ac cursus commodo, tortor mauris condimentum nibh, ut fermentum massa justo sit amet risus. Etiam porta sem malesuada magna mollis euismod. Donec sed odio dui.
+
                    AFCM-Egypt</h2>
−
                        Donec id elit non mi porta gravida at eget metus. Fusce dapibus, tellus ac cursus commodo, tortor mauris condimentum nibh, ut fermentum massa justo sit amet risus. Etiam porta sem malesuada magna mollis euismod. Donec sed odio dui.
+
                     <h3 class='text-center'>
−
                        Donec id elit non mi porta gravida at eget metus. Fusce dapibus, tellus ac cursus commodo, tortor mauris condimentum nibh, ut fermentum massa justo sit amet risus. Etiam porta sem malesuada magna mollis euismod. Donec sed odio dui.
+
                         A Culture of Discipline and Innovation</h3>
−
                        Donec id elit non mi porta gravida at eget metus.
+
                         <a href="http://www.afcm.ac.eg/" class="btn btn-primary btn-outline with-arrow" target="_blank"> click here <i class="fa fa-arrow-right"></i></a></div>
−
                        <br />
+
            <div class='col-md-3'><img src="https://static.igem.org/mediawiki/2017/7/7b/AFCM_LOGO_PNG.png" alt="logo" style='width: 50%;float: right'></div>
−
                        Fusce dapibus, tellus ac cursus commodo, tortor mauris condimentum nibh, ut fermentum massa justo sit amet risus. Etiam porta sem malesuada magna mollis euismod. Donec sed odio dui.
+
        </div>
−
                    </p>
+
    </div>
−
                </div>
+
    <section class="section-wrapper add container" style="background-color:#808387;width:100%">
−
                <div class="col-lg-6 col-md-6 col-sm-12" style="padding: 10px 30px 10px 30px;">
+
        <div class="slider-wrapper theme-mi-slider">
−
                    <h2>Heading</h2>
+
            <h3 class='text-center'>OUR SPONSORS</h3>
−
                    <p style="text-align: justify;">
+
            <div class="afcmslider-holder">
−
                        Donec id elit non mi porta gravida at eget metus. Fusce dapibus, tellus ac cursus commodo, tortor mauris condimentum nibh, ut fermentum massa justo sit amet risus. Etiam porta sem malesuada magna mollis euismod. Donec sed odio dui.
+
                 <button class="afcmcontrols" id="afcmcontrols-left">&#10094;</button>
−
                        Donec id elit non mi porta gravida at eget metus. Fusce dapibus, tellus ac cursus commodo, tortor mauris condimentum nibh, ut fermentum massa justo sit amet risus. Etiam porta sem malesuada magna mollis euismod. Donec sed odio dui.
+
                 <button class="afcmcontrols" id="afcmcontrols-right">&#10095;</button>
−
                        Donec id elit non mi porta gravida at eget metus. Fusce dapibus, tellus ac cursus commodo, tortor mauris condimentum nibh, ut fermentum massa justo sit amet risus. Etiam porta sem malesuada magna mollis euismod. Donec sed odio dui.
+
                <ul id="afcmslides">
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                        Donec id elit non mi porta gravida at eget metus. Fusce dapibus, tellus ac cursus commodo, tortor mauris condimentum nibh, ut fermentum massa justo sit amet risus. Etiam porta sem malesuada magna mollis euismod. Donec sed odio dui.
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                     <li class="afcmslide afcmshowing">
−
                        Donec id elit non mi porta gravida at eget metus.
+
                         <img src="https://static.igem.org/mediawiki/2017/f/f1/1-AFCM-Egypt-sponsers-vitabiotics.png" style="width: 182px;padding-right: 20px;">
−
                        <br />
+
                        <img src="https://static.igem.org/mediawiki/2017/b/bd/3-AFCM-Egypt-sponsers-Pharco_Logo.png" style="width: 180px;padding-right: 18px;">
−
                        Fusce dapibus, tellus ac cursus commodo, tortor mauris condimentum nibh, ut fermentum massa justo sit amet risus. Etiam porta sem malesuada magna mollis euismod. Donec sed odio dui.
+
                     </li>
−
                    </p>
+
                     <li class="afcmslide">
−
                </div>
+
                         <img src="https://static.igem.org/mediawiki/2017/3/3b/4-AFCM-Egypt-sponsers-Nationel_Research.png" style="width: 150px;padding-right: 15px;">
−
            </div>
+
                        <img src="https://static.igem.org/mediawiki/2017/6/67/7-AFCM-Egypt-sponsers-Image-2.jpeg" style="width: 160px;padding-right: 15px;">
−
            <div class="allcontain" style="margin-bottom:30px">
+
                        <img src="https://static.igem.org/mediawiki/2017/e/eb/6-AFCM-Egypt-sponsers-SimEra.png" style="width: 150px;padding-right: 15px;">
−
                <div class="feturedimage">
+
                        <img src="https://static.igem.org/mediawiki/2017/3/37/5-AFCM-Egypt-sponsers-IDT.png" style="width: 150px;padding-right: 15px;">
−
                    <div class="row firstrow" style="margin-left:160px">
+
                        <img src="https://static.igem.org/mediawiki/2017/6/60/9-AFCM-Egypt-sponsers-Benchling.png" style="width: 150px;padding-right: 15px;">
−
                        <div class="col-lg-3 col-md-4 col-sm-6 col-xs-12" style="margin-right:50px">
+
                         <img src="https://static.igem.org/mediawiki/2017/b/b4/8-AFCM-Egypt-sponsers-Zewail_logo.png" style="width: 150px;padding-right: 15px;">
−
                            <div class="hovereffect">
+
                    </li>
−
                                <img class="img-responsive" src="https://static.igem.org/mediawiki/2017/8/80/AFCM-Egypt-logopng.png" alt="">
+
                 </ul>
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                                <div class="overlay">
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                                    <h2>Hover effect 2</h2>
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                                    <a class="info" href="#">link here</a>
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                                </div>
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                            </div>
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                        </div>
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                        <div class="col-lg-3 col-md-4 col-sm-6 col-xs-12" style="margin-right:50px">
+
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                            <div class="hovereffects">
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                                <img class="img-responsive" src="https://static.igem.org/mediawiki/2017/8/80/AFCM-Egypt-logopng.png" alt="">
+
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                                <div class="overlay">
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                                    <h2>Hover effect 5</h2>
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                                    <a class="info" href="#">link here</a>
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                                </div>
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                            </div>
+
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                        </div>
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                        <div class="col-lg-3 col-md-4 col-sm-6 col-xs-12" style="margin-right:50px">
+
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                            <div class="hovereffectx">
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                                <img class="img-responsive" src="https://static.igem.org/mediawiki/2017/8/80/AFCM-Egypt-logopng.png" alt="">
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                                <div class="overlay">
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                                    <h2>Effect 13</h2>
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                                    <p>
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                                        <a href="#">LINK HERE</a>
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                                    </p>
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                                </div>
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                            </div>
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                        </div>
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                     </div>
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                </div>
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            </div>
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            <div class="row" style="border: 1px solid #b091e0;background-color: #efe8fb;border-radius:6px;margin-bottom:20px">
+
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                <div class="col-lg-12 col-md-12 col-sm-12" style="box-shadow: 1px -2px 8px 3px #33354e;padding: 10px 30px 10px 30px;">
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                    <h2 style="text-decoration: underline;">Heading</h2>
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                    <p style="text-align: justify;">
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                         Donec id elit non mi porta gravida at eget metus. Fusce dapibus, tellus ac cursus commodo, tortor mauris condimentum nibh, ut fermentum massa justo sit amet risus. Etiam porta sem malesuada magna mollis euismod. Donec sed odio dui.
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                        Donec id elit non mi porta gravida at eget metus. Fusce dapibus, tellus ac cursus commodo, tortor mauris condimentum nibh, ut fermentum massa justo sit amet risus. Etiam porta sem malesuada magna mollis euismod. Donec sed odio dui.
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                        Donec id elit non mi porta gravida at eget metus. Fusce dapibus, tellus ac cursus commodo, tortor mauris condimentum nibh, ut fermentum massa justo sit amet risus. Etiam porta sem malesuada magna mollis euismod. Donec sed odio dui.
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                        Donec id elit non mi porta gravida at eget metus. Fusce dapibus, tellus ac cursus commodo, tortor mauris condimentum nibh, ut fermentum massa justo sit amet risus. Etiam porta sem malesuada magna mollis euismod. Donec sed odio dui.
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                        Donec id elit non mi porta gravida at eget metus.
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                        <br />
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                        Fusce dapibus, tellus ac cursus commodo, tortor mauris condimentum nibh, ut fermentum massa justo sit amet risus. Etiam porta sem malesuada magna mollis euismod. Donec sed odio dui.
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                        Donec id elit non mi porta gravida at eget metus. Fusce dapibus, tellus ac cursus commodo, tortor mauris condimentum nibh, ut fermentum massa justo sit amet risus. Etiam porta sem malesuada magna mollis euismod. Donec sed odio dui.
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                        Donec id elit non mi porta gravida at eget metus. Fusce dapibus, tellus ac cursus commodo, tortor mauris condimentum nibh, ut fermentum massa justo sit amet risus. Etiam porta sem malesuada magna mollis euismod. Donec sed odio dui.
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                        Donec id elit non mi porta gravida at eget metus. Fusce dapibus, tellus ac cursus commodo, tortor mauris condimentum nibh, ut fermentum massa justo sit amet risus. Etiam porta sem malesuada magna mollis euismod. Donec sed odio dui.
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                        Donec id elit non mi porta gravida at eget metus.
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                         <br />
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                        <hr />
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                        Donec id elit non mi porta gravida at eget metus. Fusce dapibus, tellus ac cursus commodo, tortor mauris condimentum nibh, ut fermentum massa justo sit amet risus.
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                        Etiam porta sem malesuada magna mollis euismod. Donec sed odio dui.
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                        Donec id elit non mi porta gravida at eget metus. Fusce dapibus, tellus ac cursus commodo, tortor mauris condimentum nibh, ut fermentum massa justo sit amet risus. Etiam porta sem malesuada magna mollis euismod. Donec sed odio dui.
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                    </p>
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+
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                                    <div class="back photo-desc">
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                                        <h3>test</h3>
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                                        <p>description</p>
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                                    <img class="left" src="https://static.igem.org/mediawiki/2017/8/80/AFCM-Egypt-logopng.png" alt="">
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                                    <img class="right" src="https://static.igem.org/mediawiki/2017/8/80/AFCM-Egypt-logopng.png" alt="">
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+
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                                    <div class="back photo-desc">
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                                        <h3>test</h3>
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                                        <p>description</p>
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                                    </div>
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                                    <img class="left" src="https://static.igem.org/mediawiki/2017/8/80/AFCM-Egypt-logopng.png" alt="">
+
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                                    <img class="right" src="https://static.igem.org/mediawiki/2017/8/80/AFCM-Egypt-logopng.png" alt="">
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                                </div>
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+
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                                    <div class="back photo-desc">
+
−
                                        <h3>test</h3>
+
−
                                        <p>description</p>
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                                    </div>
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                                    <img class="left" src="https://static.igem.org/mediawiki/2017/8/80/AFCM-Egypt-logopng.png" alt="">
+
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+
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                                    <div class="back photo-desc">
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−
                                        <h3>test</h3>
+
−
                                        <p>description</p>
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                                    </div>
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                                    <img class="left" src="https://static.igem.org/mediawiki/2017/8/80/AFCM-Egypt-logopng.png" alt="">
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                    </div>
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            </div>
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                            <video width="420" height="340" controls style="border:1px solid #000">
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                                <source src="https://static.igem.org/mediawiki/2017/8/80/AFCM-Egypt-logopng.png" type="video/ogg">
+
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                                <source src="https://static.igem.org/mediawiki/2017/8/80/AFCM-Egypt-logopng.png" type="video/mp4">
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                            </video>
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                        </div>
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                    </div>
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                <div class="col-lg-4 col-md-4" style="width:28%;background-color: #f5f2f2;margin: 20px;padding: 20px;box-shadow: 1px -2px 8px 3px #33354e;">
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                    <h2>Heading</h2>
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                    <p>Donec id elit non mi porta gravida at eget metus. Fusce dapibus, tellus ac cursus commodo, tortor mauris condimentum nibh, ut fermentum massa justo sit amet risus. Etiam porta sem malesuada magna mollis euismod. Donec sed odio dui. </p>
+
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                    <p>
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                            </svg><div id="text">
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                                <a href=""><span class="spot"></span>Button 1</a>
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                            </div>
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                        </div>
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                    </p>
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                </div>
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                <div class="col-lg-4 col-md-4" style="width:28%;background-color: #e1e9ff;margin: 20px;padding: 20px;box-shadow: 1px -2px 8px 3px #33354e;">
+
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                    <h2>Heading</h2>
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                    <p>Donec id elit non mi porta gravida at eget metus. Fusce dapibus, tellus ac cursus commodo, tortor mauris condimentum nibh, ut fermentum massa justo sit amet risus. Etiam porta sem malesuada magna mollis euismod. Donec sed odio dui. </p>
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                    <p>
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                            </svg><div id="text">
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−
                                <a href=""><span class="spot"></span>Button 1</a>
+
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                            </div>
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                        </div>
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                    </p>
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                 </div>
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                <div class="col-lg-4 col-md-4" style="width:28%;background-color: #ddd;margin: 20px;padding: 20px;box-shadow: 1px -2px 8px 3px #33354e;">
+
−
                    <h2>Heading</h2>
+
−
                    <p>Donec sed odio dui. Cras justo odio, dapibus ac facilisis in, egestas eget quam. Vestibulum id ligula porta felis euismod semper. Fusce dapibus, tellus ac cursus commodo, tortor mauris condimentum nibh, ut fermentum massa.</p>
+
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                    <p>
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                        <div class="svg-wrapper">
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−
                            </svg><div id="text">
+
−
                                <a href=""><span class="spot"></span>Button 1</a>
+
−
                            </div>
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                        </div>
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                    </p>
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                 </div>
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            </div>
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                    <hr style="margin-bottom:0px"/>
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                    <h3 style="color: #05526c;font-weight: bolder;margin:0px">OUR SPONSORS</h3>
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                    <hr style="margin-top:0px" />
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                    </div>
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                      <img src="https://static.igem.org/mediawiki/2017/b/b4/8-AFCM-Egypt-sponsers-Zewail_logo.png" alt="logo">
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                    </div>
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                    <div class="col-lg-3 col-md-3 col-sm-6 col-xs-12">
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                        <img src="https://static.igem.org/mediawiki/2017/e/eb/6-AFCM-Egypt-sponsers-SimEra.png" alt="logo">
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                     </div>
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                     <div class="col-lg-3 col-md-3 col-sm-6 col-xs-12">
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                         <img src="https://static.igem.org/mediawiki/2017/3/3b/4-AFCM-Egypt-sponsers-Nationel_Research.png" alt="logo">
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                    </div>
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                </div>
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            </div>
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            <br />
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+
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                            <img src="https://static.igem.org/mediawiki/2017/3/37/5-AFCM-Egypt-sponsers-IDT.png" style="height:150px">
+
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                        </div>
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                        <div class="col-lg-2 col-md-2 col-sm-6 col-xs-12" style="margin-right: 30px;">
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                            <img src="https://static.igem.org/mediawiki/2017/f/f1/1-AFCM-Egypt-sponsers-vitabiotics.png" style="height:150px">
+
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                        </div>
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                        <div class="col-lg-2 col-md-2 col-sm-6 col-xs-12" style="margin-right: 30px;">
+
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                            <img src="https://static.igem.org/mediawiki/2017/b/bb/2-AFCM-Egypt-sponsers-EFIA_LOGO.png" style="height:150px">
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                    <p><span>Ehsan Abd El Kodous Street</span> Cairo, Egypt</p>
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                    <span>About the us</span>
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var slides = document.querySelectorAll('#afcmslides .afcmslide');
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                    AFCM afcm test afcm TEST AFCM afcm test afcm TESTAFCM afcm test afcm TEST
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                    AFCM afcm test afcm TEST AFCM afcm test afcm TESTAFCM afcm test afcm TEST
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Line 384: Line 259:
 
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Line 394: Line 267:
 
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Line 403: Line 275:
 
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−
                scrollContainer.scrollTop += 1;
 
−
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−
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+
       
−
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+
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−
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+
−
                targetY += target.offsetTop;
+
−
            } while (target = target.offsetParent);
+
−
 
+
−
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+
−
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+
−
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+
−
                setTimeout(function () { scroll(c, a, b, i); }, 20);
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−
            }
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            // start scrolling
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−
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−
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Latest revision as of 20:11, 31 October 2017

A F C M

A F C M

Competing endogenous RNA network : Potential entrants to gene editing in Hepatocellular Carcinoma




Abstract

 

Hepatocellular Carcinoma (HCC) is the leading cause of cancer deaths worldwide & ranked first among cancers in males and next to breast cancer among females in Egypt based upon results of National Cancer Registry Program of Egypt. "Grabbing the problem from the roots" is the best way to decently describe the use of CRISPR, a special gene editing technique that we will be using to modulate a certain  circRNA and adjust its gene expression, which is down-regulated in hepatocellular carcinoma. This in consequence modifies   miRNA expression thus amending the mRNA gene expression; which is the visible problem in our trials.   This will lead us to adopt a novel strategy for miRNA suppression by using circRNAs. This is    accomplished by utilizing a   synthetic circuit to give rise to a springboard in our battle against cancer.














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