Difference between revisions of "Team:Paris Bettencourt"

 
(231 intermediate revisions by 3 users not shown)
Line 1: Line 1:
 +
{{Paris_Bettencourt}}
  
 +
<html>
  
  
<!DOCTYPE html>
 
<html>
 
    <head>
 
            <meta name="viewport" content="width=device-width, initial-scale=1">
 
            <link rel="stylesheet" type="text/css" href="css/bootstrap.min.css"/>
 
            <link rel="stylesheet" type="text/css" href="css/animate.css"/>
 
            <link rel="stylesheet" type="text/css" href="css/index2.css"/>
 
            <link href='http://fonts.googleapis.com/css?family=Lato:100,300,400,700,900' rel='stylesheet' type='text/css'>
 
            <link rel="stylesheet" type="text/css" href="http://netdna.bootstrapcdn.com/font-awesome/4.0.3/css/font-awesome.min.css">
 
    </head>
 
    <body>
 
        <div class=container-fluid>
 
            <nav class="row top-menu">
 
                    <div class="col-md-4 home-link"><a href="index.html"><i class="fa fa-home fa-3" aria-hidden="true"></i></a></div>
 
                    <div class="col-md-8">
 
                            <ul class=" text-left wtf-menu pull-right ">
 
                                    <li class="parent main-item"><a href="#">Project</a>
 
                                        <ul class="submenu">
 
                                            <li><a href="https://2017.igem.org/Team:Paris_Bettencourt/Overview">Overview</a></li>
 
                                            <li><a id="exception" href="https://2017.igem.org/Team:Paris_Bettencourt/Transmembrane_Proteins">Transmembrane Proteins</a></li>
 
                                                            <li><a href="https://2017.igem.org/Team:Paris_Bettencourt/Proteins_Caging">Proteins Caging</a></li>
 
                                                            <li><a href="https://2017.igem.org/Team:Paris_Bettencourt/Logic_Circuit">Logic Circuit</a></li>
 
                                                            <li class="parent"><a href="https://2017.igem.org/Team:Paris_Bettencourt/Biomaterials">Biomaterials</a>
 
                                                <ul class="submenu">
 
                                                    <li><a href="https://2017.igem.org/Team:Paris_Bettencourt/Biomaterials#PHA">PHA</a></li>
 
                                                    <li><a href="https://2017.igem.org/Team:Paris_Bettencourt/Biomaterials#Calcium">Calcium Carbonate</a></li>
 
                                                    <li><a href="https://2017.igem.org/Team:Paris_Bettencourt/Biomaterials#Polysilicate">Polysilicate</a></li>
 
                                                </ul>
 
                                            </li>
 
                                            <li><a href="https://2017.igem.org/Team:Paris_Bettencourt/RNA">RNA</a></li>
 
                                            <li><a href="https://2017.igem.org/Team:Paris_Bettencourt/Hardware">Hardware</a></li>
 
                                            <li><a href="https://2017.igem.org/Team:Paris_Bettencourt/Measurement">Measurement</a></li>
 
                                        </ul>
 
                                    </li>
 
                                    <li class="parent main-item"><a href="https://2017.igem.org/Team:Paris_Bettencourt/Model">Modeling</a>
 
                                        <ul class="submenu">
 
                                            <li><a href="https://2017.igem.org/Team:Paris_Bettencourt/Model#RNA">RNA</a></li>
 
                                            <li><a href="https://2017.igem.org/Team:Paris_Bettencourt/Model#Proteins">Proteins</a></li>
 
                                            <li><a href="https://2017.igem.org/Team:Paris_Bettencourt/Model#Promoters">Promoters</a></li>
 
                                        </ul>
 
                                    </li>
 
                                    <li class="parent main-item"><a href="#">Achievements</a>
 
                                        <ul class="submenu">
 
                                            <li><a href="https://2017.igem.org/Team:Paris_Bettencourt/Medal_Criteria">Medal Criteria</a></li>
 
                                            <li><a href="https://2017.igem.org/Team:Paris_Bettencourt/Results">Results</a></li>
 
                                            <li><a href="https://2017.igem.org/Team:Paris_Bettencourt/Contribution">Contributions</a></li>
 
                                        </ul>
 
                                    </li>
 
                                    <li class="parent main-item"><a href="#">Human Practices</a>
 
                                        <ul class="submenu">
 
                                            <li><a href="https://2017.igem.org/Team:Paris_Bettencourt/HP/Silver">Silver HP</a></li>
 
                                            <li><a href="https://2017.igem.org/Team:Paris_Bettencourt/HP/Gold_Integrated">Gold &amp; HP</a></li>
 
                                            <li><a href="https://2017.igem.org/Team:Paris_Bettencourt/Engagement">Public Engagement</a></li>
 
                                            <li><a href="https://2017.igem.org/Team:Paris_Bettencourt/Safety">Safety</a></li>
 
                                        </ul>
 
                                    </li>
 
                                    <li class="parent main-item"><a href="#">Notebook</a>
 
                                        <ul class="submenu">
 
                                            <li><a href="https://2017.igem.org/Team:Paris_Bettencourt/Lab_Notebook">Lab Book</a></li>
 
                                        </ul>
 
                                    </li>
 
                                    <li class="parent main-item"><a href="#">Parts</a>
 
                                        <ul class="submenu">
 
                                            <li><a href="https://2017.igem.org/Team:Paris_Bettencourt/Improve">Improved Part</a></li>
 
                                            <li><a href="https://2017.igem.org/Team:Paris_Bettencourt/Basic_Part">Basics Parts</a></li>
 
                                            <li><a href="https://2017.igem.org/Team:Paris_Bettencourt/Composite_Part">Composite Parts</a></li>
 
                                            <li><a href="https://2017.igem.org/Team:Paris_Bettencourt/Part_Collection">Parts Collection</a></li>
 
                           
 
                                        </ul>
 
                                    </li>
 
                                    <li class="parent main-item"><a href="#">Team</a>
 
                                        <ul class="submenu">
 
                                            <li><a href="https://2017.igem.org/Team:Paris_Bettencourt/Team">Team Members</a></li>
 
                                            <li><a href="https://2017.igem.org/Team:Paris_Bettencourt/Collaborations">Collaborations</a></li>
 
                                            <li><a href="https://2017.igem.org/Team:Paris_Bettencourt/Attributions">Attributions</a></li>
 
                                            <li><a href="https://2017.igem.org/Team:Paris_Bettencourt/Sponsors">Sponsors</a></li>
 
                                        </ul>
 
                                    </li>
 
                                </ul>
 
                    </div>
 
                 
 
            </nav>
 
  
             <section class="page-header row">
+
<meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=utf-8">
 +
<style type="text/css">
 +
<style>
 +
 
 +
#content {
 +
    width: 100%;
 +
    padding-top : 15px;
 +
    border: none;
 +
    color: black;
 +
    margin: 0;
 +
    padding:0;
 +
}
 +
 
 +
#top_title {
 +
    display: none;
 +
}
 +
 
 +
.neant {
 +
    height : 65px;
 +
    width : 100%;
 +
}
 +
section.page-header {
 +
   
 +
    margin-bottom: 35px;
 +
}
 +
 
 +
.page-header .logomedusa {
 +
    width: 370px;
 +
    margin-top : 60px;
 +
    position: absolute;
 +
    left: 50%;
 +
    margin-left: -185px !important;  /* 50% of your logo width */
 +
    display: block;
 +
    z-index:99;
 +
}
 +
#u1570{
 +
 
 +
    height:600px;
 +
}
 +
 
 +
#description {
 +
width : 25%;
 +
margin-left : 37.5%;
 +
text-align : center;
 +
  overflow : visible;
 +
}
 +
#projectdescription {
 +
margin-top : 100px;
 +
width : 100%;
 +
text-align : center;
 +
position : relative;
 +
min-height : 500px;
 +
  overflow : visible;
 +
}
 +
#projectdescription h4 {
 +
text-align : center;
 +
        text-indent : 0px;
 +
overflow : visible;
 +
}
 +
#project1 {
 +
position : absolute;
 +
width : 20%;
 +
float : left;
 +
        overflow : visible;
 +
}
 +
#project2 {
 +
position : absolute;
 +
max-width : 20%;
 +
margin-left : 26.66%;
 +
float : left;
 +
overflow : visible !important;
 +
}
 +
#project3 {
 +
position : absolute;
 +
width : 20%;
 +
margin-left : 53.333%;
 +
float : left;
 +
  overflow : visible;
 +
        z-index : 49;
 +
}
 +
#project4 {
 +
position : absolute;
 +
width : 20%;
 +
margin-left : 80%;
 +
float : left;
 +
}
 +
.logo {
 +
padding : auto;
 +
  overflow : visible;
 +
}
 +
.logosubp {
 +
display : none;
 +
margin : auto;
 +
  overflow : visible;
 +
}
 +
.logosubpinerte {
 +
display : block;
 +
margin : auto;
 +
  overflow : visible;
 +
}
 +
.logo:hover .logosubp {
 +
display : block;
 +
}
 +
.logo:hover .logosubpinerte {
 +
display : none;
 +
}
 +
.text4 video {
 +
      margin : 0 auto;
 +
      display : block;
 +
}
 +
#maintitle {
 +
font-family : "Avenir", Lato, sans-serif;
 +
}
 +
 
 +
#blockverticalcenter {
 +
    display : table;
 +
    text-align : center;
 +
    vertical-align : middle;
 +
    padding : 0 auto;
 +
}
 +
#blockverticalcenter p {
 +
    display : table-cell;
 +
}
 +
 
 +
 
 +
#block1 {
 +
      display : flex !important;
 +
      vertical-align : middle !important;
 +
}
 +
</style>
 +
 
 +
<body>
 +
            <div class=neant></div>
 +
             <section class=page-header>
 
                     <div class="col-md-12"  id="u1570" ><!-- image -->
 
                     <div class="col-md-12"  id="u1570" ><!-- image -->
                         <img  class="logo"  src="images/logo-medusa.png" />
+
                         <img  class="logomedusa"  src="/wiki/images/thumb/0/00/Logo-medusa.png/599px-Logo-medusa.png" />
 
                     </div>
 
                     </div>
  
 
             </section>
 
             </section>
            <section class="page-content row">
+
<div class=textbody>
                <div class="row">
+
<h1 id=maintitle>BRINGING CONTROL TO THE</br>THIRD DIMENSION</h1>
                        <div class="col-md-12">
+
<div class=text4 id=block1>
                                <h1>
+
<div class=text4left><video width="560" height="315" controls><source src="https://static.igem.org/mediawiki/2017/7/7e/PB_MedusaTrailer.mp4" type="video/mp4"></source></video></div>
                                        <p>BRINING CONTROL TO THE </p>
+
<div class=text4right id=blockverticalcenter>By creating logic circuits with photo sensitive proteins, we <b>control and study cells in 3D.</b></div>
                                        <p>THIRD DIMENSION</p>
+
</div>
                                     
+
                                </h1>
+
                               
+
                        </div>
+
                </div>
+
                <div class="row">
+
                        <div class="col-md-12">
+
                               
+
                                  <div class="disclamer">
+
                                          <p>
+
                                                  <strong>Proof of concept - 3D printer: </strong>
+
                                                 
+
                                                  by creating a printer, it is a clear and easily quantified way to validate our 3D controls.
+
                                                  It also allowed us to engineer biomaterials that would be compatible and useful in
+
                                                  biotech. We also optimised production by creating local concnetrations of enzymes in
+
                                                 
+
                                                  the RNA organelles.
+
                                                </p>
+
                                    </div>
+
                            </div>
+
                </div>
+
                <div class="row">
+
                  <div class="col-md-6 text-right">
+
                        <iframe width="560" height="315" src="https://www.youtube.com/embed/HyrWd_gfQNQ" frameborder="0" allowfullscreen></iframe>
+
                  </div>
+
                  <div class="col-md-6 text-block" >
+
                        <p>
+
                                By creating logic circuits with
+
                                photo sensitive proteins, we
+
                                <strong>control and study cells in 3D.</strong>
+
                        </p>
+
                </div>
+
                </div>
+
                <div class="row cat-menu">
+
                    <div class="col-md-4 cat-menu-item">
+
                            <a  href="project-1.html"  >
+
                                <img  src="images/animacion-picto-bm.gif?crc=246350070" alt="" />
+
                            </a>
+
                            <h2><p>Biomaterials</p></h2>
+
                            <p>Three different biomaterials with differing/distinct properties were developed on: Calcium Carbonate, Polysilicate and Ph3B. Each material has unique properties and differing applications, allowing for a broad spectrum of fields that the 3D printer belongs to.</p>
+
                    </div>
+
                    <div class="col-md-4 cat-menu-item">
+
                            <a href="project-2.html" >
+
                                <img  src="images/animacion-picto-opto.gif?crc=242435740" alt="" width="150" height="150"/>
+
                            </a>
+
                            <h2><p>Light control</p></h2>
+
                            <p>Optogenetics allows fully reversible control of gene expression in both time and space. Both photosensory transmembrane proteins as well as photoswitchable protein caging were developed to expand the existing library of optogenetic tools.</p>
+
                    </div>
+
                    <div class="col-md-4 cat-menu-item">
+
                            <a  href="project-3.html" >
+
                                <img  src="images/animacion-picto-rna.gif?crc=297139977" alt="" width="150" height="150"/>
+
                            </a>
+
                            <h2><p>&nbsp;RNA Agglomerations</p></h2>
+
                            <p>RNA is a light cost nucleotide material in the cell, which has potential to act as a scaffold and transporter. We aim to recreate RNA agglomerations as formed in mammalian cells with triple repeat disorders, which show liquid phase separation, forming a organelle-like vesicle, where local concentrations of enzymes can be created.</p>
+
                    </div>
+
                </div>
+
                 
+
 
+
            </section>
+
            <section class="page-footer row">
+
                <div class="col-md-2">
+
                        <a href="https://2017.igem.org/Team:Paris_Bettencourt">
+
                            <img src="images/pb-logo.png" height="90px" class=" b-error">
+
                          </a>
+
                </div>
+
                <div class="col-md-2">
+
                        <a href="https://2017.igem.org/Main_Page">
+
                            <img src="https://static.igem.org/mediawiki/2017/b/bc/PB_footeriGEMofficial.png" height="90px" class=" b-error">
+
                          </a>
+
                </div>
+
                <div class="col-md-3">
+
                        <a href="http://www.fondationbs.org/">
+
                            <img src="images/fb-logo.png" height="90px" class=" b-error">
+
                          </a>
+
                </div>
+
                <div class="col-md-1"></div>
+
                <div class="col-md-3">
+
                        <p>Centre for Research and Interdisciplinarity (CRI)<br>
+
                        Faculty of Medicine Cochin Port-Royal, South wing, 2nd floor<br>
+
                        Paris Descartes University<br>
+
                        24, rue du Faubourg Saint Jacques<br>
+
                        75014 Paris, France<br> </p>
+
                        <img src="https://static.igem.org/mediawiki/2017/7/74/PB_footeremail.png" height="10px" class=" b-error"> <a href="mailto:bettencourt.igem2017@gmail.com">bettencourt.igem2017@gmail.com</a>  
+
                </div>
+
                <div class="col-md-1"></div>
+
            </section>
+
 
+
  
 +
<div class=text1><b>Proof of concept - 3D printer: </b>
 +
by creating a printer, it is a clear and easily quantified way to validate our 3D controls.
 +
It also allowed us to engineer biomaterials that would be compatible and useful in
 +
biotech. We also optimised production by creating local concnetrations of enzymes in
 +
the RNA organelles.
 +
</div>
 +
<div id="projectdescription">
 +
<div id="project1"><div class="logo">
 +
<a href="https://2017.igem.org/Team:Paris_Bettencourt/Biomaterials"><img class="logosubpinerte" src="https://static.igem.org/mediawiki/2017/2/2c/RocheinertePB.png"><img class="logosubp" src="https://static.igem.org/mediawiki/2017/6/61/RochePB.gif"></div><h2>Biomaterials</div></a>
 +
<div id="project2"><div class="logo">
 +
<a href="https://2017.igem.org/Team:Paris_Bettencourt/Transmembrane_Proteins"><img class="logosubpinerte" src="https://static.igem.org/mediawiki/2017/5/51/LaserinertePB.png"><img class="logosubp" src="https://static.igem.org/mediawiki/2017/a/ad/LaserPB.gif"></div><h2>Membrane Photoreceptor</h2></a></div>
 +
<div id="project3"><div class="logo">
 +
<a href="https://2017.igem.org/Team:Paris_Bettencourt/RNA"><img class="logosubpinerte" src="https://static.igem.org/mediawiki/2017/1/17/GifRNAinertePB.png"><img class="logosubp" src="https://static.igem.org/mediawiki/2017/5/53/GifRNAPB.gif"></div><h2>RNA Organelle</h2></div></a>
 +
<div id="project4"><div class="logo">
 +
<a href="https://2017.igem.org/Team:Paris_Bettencourt/Proteins_Caging"><img class="logosubpinerte" src="https://static.igem.org/mediawiki/2017/c/c5/GifdrompainertePB.png"><img class="logosubp" src="https://static.igem.org/mediawiki/2017/e/e7/GifdrompaPB.gif"></div><h2>Proteins Photocaging</h2></div></a>
 +
</div>
 
         </div>
 
         </div>
 
     </body>
 
     </body>
    <script src="./scripts/bacteries.js"></script>
+
 
 +
 
 +
<script src="http://ajax.googleapis.com/ajax/libs/jquery/1.8.3/jquery.min.js"></script>
 +
 
 +
<script>
 +
 
 +
 
 +
(function(){
 +
    var BACTERIE_COUNT = 100;
 +
    var colors = ['#062D75', '#E8292F'];
 +
    var bacteries = [];
 +
    var container = window.document.getElementById("u1570");
 +
    var interval1;
 +
    var interval2
 +
 
 +
   
 +
    function fillContainer () {
 +
        var k = 1;
 +
        for(var i=0; i<BACTERIE_COUNT; i++) {
 +
            k = 1-k;
 +
            var bacterie = new Bacterie(colors[k]);
 +
            bacterie.setPosition(container);
 +
            bacteries.push(bacterie);
 +
            container.appendChild(bacterie.element);
 +
        }
 +
        runColorChanging();
 +
    }
 +
 
 +
 
 +
 
 +
 
 +
    function clearBacteries() {
 +
        if(bacteries.length ==0) return;
 +
        for(var i=0; i<BACTERIE_COUNT; i++) {
 +
                container.removeChild(bacteries[i].element);
 +
        }
 +
        bacteries = [];
 +
    }
 +
 
 +
    function runFillingInterval(){
 +
        interval1 = setInterval(function(){
 +
            clearInterval(interval2);
 +
            clearBacteries();
 +
            fillContainer();
 +
        }, 4000);
 +
    }
 +
 
 +
    function runColorChanging(){
 +
        interval2 = setInterval(function(){
 +
            for(var i=0; i<BACTERIE_COUNT; i++) {
 +
                //console.log(bacteries[i]);
 +
                bacteries[i].changeColor(colors[Math.round(Math.random())]);
 +
            }
 +
 
 +
        }, 2000);
 +
    }
 +
       
 +
 
 +
 
 +
    function Bacterie(color) {
 +
 
 +
           
 +
            this.height = 26;
 +
            this.width = 60;
 +
 
 +
            this.color;
 +
            this.x;
 +
            this.y;
 +
            this.rotation;
 +
            this.element;
 +
 
 +
           
 +
 
 +
         
 +
            this.changeColor = function(color){
 +
                Object.assign(this.element.style, {
 +
                    backgroundColor : color//colors[Math.round(Math.random())]
 +
                });
 +
            }
 +
 
 +
            this.getRotation = function() {
 +
                return Math.floor((Math.random() * 360) + 1);
 +
            }
 +
            this.getPosition = function(max, padding){
 +
                return Math.floor((Math.random() * max) + padding);
 +
            }
 +
            this.setPosition = function(container){
 +
                Object.assign(this.element.style, {
 +
                    top: this.getPosition(container.clientHeight-this.width, 70) +'px',
 +
                    left: this.getPosition(container.clientWidth-this.width, 1) +'px',
 +
                });
 +
            }
 +
 
 +
            this.createElement = function(){
 +
 
 +
                this.element = document.createElement('div');
 +
                Object.assign(this.element.style, {
 +
                    height: this.height +"px",
 +
                    width: this.width+"px",
 +
                    backgroundColor: color,
 +
                    borderRadius: '20px',
 +
                    transform: 'rotate('+ this.getRotation() + 'deg)',
 +
                    position:'absolute',
 +
                    //top: this.getPosition(380) +'px',
 +
                    //left: this.getPosition(1596) +'px',
 +
                    zIndex:2
 +
                });
 +
               
 +
             
 +
            }
 +
 
 +
            this.createElement();
 +
            return this;
 +
 
 +
    }
 +
 
 +
 
 +
    fillContainer(); 
 +
    runFillingInterval();
 +
 
 +
})();
 +
</script>
 +
   
 
</html>
 
</html>
 +
{{Paris_Bettencourt/footer}}

Latest revision as of 17:20, 12 December 2017

BRINGING CONTROL TO THE
THIRD DIMENSION

By creating logic circuits with photo sensitive proteins, we control and study cells in 3D.
Proof of concept - 3D printer: by creating a printer, it is a clear and easily quantified way to validate our 3D controls. It also allowed us to engineer biomaterials that would be compatible and useful in biotech. We also optimised production by creating local concnetrations of enzymes in the RNA organelles.
Centre for Research and Interdisciplinarity (CRI)
Faculty of Medicine Cochin Port-Royal, South wing, 2nd floor
Paris Descartes University
24, rue du Faubourg Saint Jacques
75014 Paris, France
bettencourt.igem2017@gmail.com