Difference between revisions of "Team:RDFZ-China/Notebook"

 
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</ul>
 
</ul>
−
</div>  
+
<p>7.23
 +
1、PCR for BioBricks, 5’ homologous arm, backbone
 +
2、electrophoresis：Validate PCR product
 +
3、枯草杆菌保种
  
−
<div class="column full_size">
+
7.24
 +
1、Get genome
 +
2、昨日PCR产物回收
 +
3、Genome PCR
 +
5、引物退火
 +
6、transcribe, replicate pVeg
  
−
<h1>Notebook</h1>
+
7.26
−
<p> Document the dates you worked on your project. This should be a detailed account of the work done each day for your project.</p>
+
1、electrophoresis（genome，退火产物）
  
−
</div>
+
8.3
−
<div class="clear"></div>
+
1、enzyme digestion: pHT01, using BamHI & XbaI
 +
2、electrophoresis: testing the product of enzyme digestion（PHT01，PHT01 enzyme digestion product，pVeg PCR, pVeg PCR enzyme digestion product）
 +
10、胶回收
  
 +
8.4
 +
1、PCR（pVeg，GFP, negative control，positive control）
 +
2、 electrophoresis: test the product of PCR
 +
5、enzyme digestion: YerP, gfp, sfp, pSB1C3
 +
6、Ligation
 +
7、PCR产物回收
 +
8、transcription
  
−
<div class="column half_size">
+
8.5
−
<h5>What should this page have?</h5>
+
1、enzyme digestion: pVeg, RBS, Backbone
−
<ul>
+
2、Colony PCR（sfp2 A 抗, YerP1 A抗, YerP2 A抗）
−
<li>Chronological notes of what your team is doing.</li>
+
−
<li> Brief descriptions of daily important events.</li>
+
−
<li>Pictures of your progress. </li>
+
−
<li>Mention who participated in what task.</li>
+
−
</ul>
+
  
−
</div>
+
8.9
 +
1、electrophoresis: 菌PCR
 +
2、get genome，ER，尝试双酶切验证质粒
  
−
<div class="column half_size">
+
8.10
−
<h5>Inspiration</h5>
+
1、B.sub 感受态制备
−
<p>You can see what others teams have done to organize their notes:</p>
+
2、8月9号转化涂板因未吹干失败，菌落被感染
  
−
<ul>
+
8.14
−
<li><a href="https://2014.igem.org/Team:ATOMS-Turkiye/Notebook">2014 ATOMS-Turkiye</a></li>
+
1、enzyme digestion: sfp，pSB1C3
−
<li><a href="https://2014.igem.org/Team:Tec-Monterrey/ITESM14_project.html#tab_notebook">2014 Tec Monterrey</a></li>
+
2、electrophoresis: test the product of胶纯化
−
<li><a href="https://2014.igem.org/Team:Kyoto/Notebook/Magnetosome_Formation#title">2014 Kyoto</a></li>
+
3、transcribe RFP Construct（control）
−
<li><a href="https://2014.igem.org/Team:Cornell/notebook">2014 Cornell</a></li>
+
4、ligate 19-TC 载体，product（YerP /sfp），Solution Ⅰ Control
−
</ul>
+
  
−
</div>
+
8.21
 +
1、PCR（sfp，YerP，pVeg，positive control，negative control）
 +
3、ligation pVeg-RBS A抗
  
 +
8.21
 +
1、Transformation（pVeg DH5α C抗，pVeg RBF DH5α A抗，D6B HP K抗，PUC19 对照A抗（稀），rfp枯草未知1，rfp枯草未知2，PUC19对照A抗（浓）, pVeg DH5α A抗，rfp DH5α K抗，pVeg RBS A抗，sfp, YerP）
 +
 +
8.22
 +
1、Taq Super-mix
 +
2、electrophoresis
 +
3、Digestion
 +
4、Ligation
 +
 +
8.23
 +
1、electrophoresis（D2000，1kb Plus Ladder，pSB1A3-GFP，pSB1C3-pTet-GFP，positive control，negative control）
 +
2、digestion for validation
 +
3、electrophoresis（ladder， pveg，pveg切，pveg-RBS，pveg-RBS 切，pH101-RFP，pH101-RFP切，T-sfp，T-sfp 旧，T-YerP，sfp-RBS）
 +
 +
9.2
 +
1、PCR plasmid（T-sfp提，T-YerP提，sfp-RBS提，pvg-RBS提，T-sfp连，T-YerP连，sfp-RBS连，pvg-RBS连，pveg-RBS）
 +
2、electrophoresis（ladder，pSB1A3-GFPpSB1C3-pTet-GFP丙sfp2 A 抗, 庚， YerP1 A抗, 辛, negative control，positive control）（ladder，TSFP1，TSFP2，TSFP3，TSFP4，TSFP5）
 +
（ladder，T-SFP，T-SFP切，sfp-RBS，sfp-RBS切，pVg-RBS，pVg-RBS切，T-YerP，T-YerP切，PHT01-GFP，PHT01-GFP切）（ladder，pSB1A3-GFP，己，T-YerP1，T-YerP2，T-YerP3，T-YerP4，T-YerP5，T-YerP6，T-YerP7）
 +
 +
第19页左半部分不知道说什么
 +
 +
第20页最上面有个5号可能是电泳
 +
 +
9.4
 +
1、transcribe T-sfp，T-YerP
 +
 +
9.5
 +
1、PCR（5‘Homologous arm，3’Homologous arm，backbone，BioBricks site）
 +
2、胶回收
 +
3、Transcribe（T-sfp，Y-YerP，pVeg，positive control）
 +
 +
9.8
 +
1、PCR
 +
2、PCR:T-sfp
 +
3、enzyme digestion（E、P），（PSB1C3-rfp plasmid）
 +
4、胶回收
 +
5、验证（ladder，5‘homologous arm，3‘homologous arm，bb，RFP construct）
 +
 +
9.9
 +
1、electrophoresis: test pSB1C3-rfp回收plasmid及7.26PCR得YerP
 +
2、Pfu扩增Biobrick sites及k位点
 +
3、上样（1-6 6管PSB1C3-rfp, 7-8 7.26 YerP，PSB1A3-gfp质粒）
 +
4、YerP平板取菌划线，菌落PCR
 +
7、get plasmid→PSB1C3-rfp construct，PCR
 +
9、electrophoresis: test product of PSB1C3-rfp 回收产物
 +
10、凝胶回收（sfp-biobrick, pVeg）
 +
 +
9.9
 +
1、胶回收
 +
2、electrophoresis1（D2000, RFP1,RFP2,RFP3,Bsub2,Bsub3,Bsub4,Busb5,Bsub6）
 +
3、electrophoresis（D2000, Biobrick，sfp，Pveg）
 +
 +
9.12
 +
1、enzyme digestion（PSB1C3-rfp）
 +
2、electrophoresis——胶回收
 +
（左：ladder，bs，5‘homologous arm，3‘homologous arm，BioBricks site，pSB1C3）
 +
（右：ladder，YerP1，YerP2，YerP3，YerP4，pSB1C3）
 +
3、test（ladder，pVeg-RBS，sfp-RBS，sfp-bb，A3，A4，A5，A6）
 +
 +
9.13
 +
1、胶回收
 +
2、PCR（pVeg-RBS，sfp-RBS，ext2）
 +
3、7管PHT01酶切检测
 +
4、第二轮RBS PCR体系
 +
6、electrophoresis：胶回收产物回收（ladder，YerP1，YerP2，YerP3，YerP4，BioBricks site，Backbone，5‘ homologous arm，3‘ homologous arm，BioBricks site）
 +
PCR产物
 +
1、 ladder-D2000
 +
2、 pVg-RBS-ext 1
 +
3、 pVg-RBS-ext 2
 +
4、 sfp-RBS-ext 1
 +
5、 sfp-RBS-ext 2
 +
6、 PSB1C3回收
 +
 +
9.14
 +
1、electrophoresis （ladder：1kb plus DNA）
 +
2、pVeg-RBS-ext2
 +
3、sfp-RBS-ext2
 +
4、pHT01 1
 +
5、pHT01 2
 +
 +
9.15
 +
1、pfu: erP+BioBricks site PCR
 +
2、加A
 +
3、YerP 加A
 +
4、electrophoresis（1kb ladder，YerP1 bio，YerP2 bio）
 +
5、electrophoresis（ladder 1kb plus，pVeg-RBS 加A 回收，sfp-RBS 加A 回收，YerP1 回收，YerP2 回收，PSB1C-sfp，RFP3）
 +
6、连接
 +
 +
9.17
 +
1、transcribe: Bsub
 +
2、transcribe: T-YerP
 +
3、OEPCR1
 +
 +
9.18
 +
1、枯草感受态检测——菌落数量
 +
2、回收pVeg+sfp OEPCR
 +
3、重叠PCR体系
 +
 +
9.20
 +
1、OEPCR3
 +
2、菌落PCR（psb1C3-AH）
 +
3、菌PCR electrophoresis（ladder，YerP，sfp，GFP，negative control，positive control，6）
 +
4、回收1000kb左右的pvg-sfp
 +
5、回收OEPCR3
 +
 +
9.21
 +
1、新backbone，BioBricks site用pfu和2017○34GP3
 +
 +
9.22
 +
1、YerP PCR
 +
2、胶回收
 +
 +
9.25
 +
1、PCR：backbone，BioBricks site
 +
 +
9.26
 +
1、OEPCR3 加A
 +
2、electrophoresis（none，ladder D2000，BioBricks site，backbone）
 +
 +
9.27
 +
1、electrophoresis: for testing the product of回收产物
 +
First: 2-5道：T-YerP○5 1-4； 6-9道：T-YerP○4 1-4）
 +
Second:（2-5道：AH，1-4；6-7道：BioBricks site，Backbone）
 +
2、transcribe pVeg-bfp
 +
 +
9.28
 +
1、菌PCR（ladder D2000，T-YerP 10，T-YerP 11，T-YerP 9，T-YerP 5，T-YerP 4，T-YerP pvg-sfp，T-YerP粉，划线5，划线4）
 +
 +
9.30
 +
1、菌液PCR
 +
2、Gibson片段-pveg-sfp PCR）
 +
3、electrophoresis（1，2，3，4，5，pveg sfp gibs，+，-）
 +
 +
10.9
 +
1、回收Gib-（pveg-sfp）
 +
2、enzyme digestion pVeg-sfp
 +
3、ligate pSB1C3-pvg-sfp
 +
 +
10.10
 +
1、electrophoresis（ladder，YerP1，YerP2，YerP3，YerP4，5‘ homologous arm，3‘ homologous arm，Gb，bb，BB）
 +
 +
10.11
 +
1、electrophoresis（D2000，1，2，3，4，5，6，7，8，9，10）
 +
2、electrophoresis（D2000，11，12，13，14，15，16，17，18）
 +
 +
10.16
 +
1、electrophoresis（ladder D2000，OEPCR3）
 +
2、transcribe（control，T-pveg sfp rbs，IDT’s ImrA）
 +
3、electrophoresis testing（1kb plus，OEPCR 回收产物，5‘，3‘，pSB1C3切, p SB1C3）
 +
 +
10.18
 +
1、PCR菌（○1pSB1A3-GFPpSB1C3-pTet-GFP丙丁戊阴○2psb-pvg-sfp连接产物，OEPCR，RFP3，P3FG）
 +
 +
10.19
 +
1、菌PCR（○1ladder 2000，sfp，GFP，negative control，positive control，6）（D2000，psb-pvg-sfp连接产物，OEPCR，RFP3，P3FG）
 +
 +
10.21
 +
1、PCR
 +
2、enzyme digestion（psb1C3，RFP3，lmrA质粒，pvg-sfp）
 +
3、electrophoresis（ladder 1kb plus，OEPCR3，ImrA1，ImrA2，D1，E1）
 +
4、electrophoresis（ladder 1kb plus，A1，B1，C1）
 +
 +
 +
10.22
 +
1、37度恒温箱里（lmrA切1，2（E，P得PCR产物），超薄试剂盒纯化，验证
 +
2、Ligate PSB1C3-lmrA
 +
3、 Transcribe PSB1C3-pveg-sfp转化得平板
 +
4、Gibson
 +
6、gov electrophoresis（1kb plus marker，lmrA切1，2回收，lmrA2*2，lmrA3*2，pvg sfp*2，PSB1C3线性，pSB1C3）
 +
 +
 +
3、菌PCR（D2000，浓pveg-sfp，OEPCR，阳）
 +
4、菌PCR（D2000，YerP，sfp）
 +
 +
10.23
 +
1、electrophoresis（D2000, ImrA2，lmrA2，lmrA3，lmrA4）
 +
 +
10.24
 +
1、electrophoresis（ladder 1kb plus，lmrA2，lmrA3，lmrA4，1-1 pvg-rbs，2-1 pvg-rbs，2-3 pvg-rbs，1-2 pvg-rbs，1-3 pvg-rbs，RFP
 +
</p>
 
</body>
 
</body>
  
 
</html>
 
</html>

Latest revision as of 03:59, 2 November 2017

HOME
TEAM
PROJECT
Description
Design
Experiments
Notebook
InterLab
Contribution
Model
Results
Demonstrate
Improve
Attributions
PARTS
Parts
Basic Parts
Composite Parts
Part Collection
SAFETY
HUMAN PRACTICES
Silver HP
Integrated and Gold
Public Engagement
AWARDS
Applied Design
Entrepreneurship
Hardware
Measurement
Model
Plant
Software
JUDGING FORM

RDFZ-China

This is the team symbol

7.23 1、PCR for BioBricks, 5’ homologous arm, backbone 2、electrophoresis：Validate PCR product 3、枯草杆菌保种 7.24 1、Get genome 2、昨日PCR产物回收 3、Genome PCR 5、引物退火 6、transcribe, replicate pVeg 7.26 1、electrophoresis（genome，退火产物） 8.3 1、enzyme digestion: pHT01, using BamHI & XbaI 2、electrophoresis: testing the product of enzyme digestion（PHT01，PHT01 enzyme digestion product，pVeg PCR, pVeg PCR enzyme digestion product） 10、胶回收 8.4 1、PCR（pVeg，GFP, negative control，positive control） 2、 electrophoresis: test the product of PCR 5、enzyme digestion: YerP, gfp, sfp, pSB1C3 6、Ligation 7、PCR产物回收 8、transcription 8.5 1、enzyme digestion: pVeg, RBS, Backbone 2、Colony PCR（sfp2 A 抗, YerP1 A抗, YerP2 A抗） 8.9 1、electrophoresis: 菌PCR 2、get genome，ER，尝试双酶切验证质粒 8.10 1、B.sub 感受态制备 2、8月9号转化涂板因未吹干失败，菌落被感染 8.14 1、enzyme digestion: sfp，pSB1C3 2、electrophoresis: test the product of胶纯化 3、transcribe RFP Construct（control） 4、ligate 19-TC 载体，product（YerP /sfp），Solution Ⅰ Control 8.21 1、PCR（sfp，YerP，pVeg，positive control，negative control） 3、ligation pVeg-RBS A抗 8.21 1、Transformation（pVeg DH5α C抗，pVeg RBF DH5α A抗，D6B HP K抗，PUC19 对照A抗（稀），rfp枯草未知1，rfp枯草未知2，PUC19对照A抗（浓）, pVeg DH5α A抗，rfp DH5α K抗，pVeg RBS A抗，sfp, YerP） 8.22 1、Taq Super-mix 2、electrophoresis 3、Digestion 4、Ligation 8.23 1、electrophoresis（D2000，1kb Plus Ladder，pSB1A3-GFP，pSB1C3-pTet-GFP，positive control，negative control） 2、digestion for validation 3、electrophoresis（ladder， pveg，pveg切，pveg-RBS，pveg-RBS 切，pH101-RFP，pH101-RFP切，T-sfp，T-sfp 旧，T-YerP，sfp-RBS） 9.2 1、PCR plasmid（T-sfp提，T-YerP提，sfp-RBS提，pvg-RBS提，T-sfp连，T-YerP连，sfp-RBS连，pvg-RBS连，pveg-RBS） 2、electrophoresis（ladder，pSB1A3-GFPpSB1C3-pTet-GFP丙sfp2 A 抗, 庚， YerP1 A抗, 辛, negative control，positive control）（ladder，TSFP1，TSFP2，TSFP3，TSFP4，TSFP5） （ladder，T-SFP，T-SFP切，sfp-RBS，sfp-RBS切，pVg-RBS，pVg-RBS切，T-YerP，T-YerP切，PHT01-GFP，PHT01-GFP切）（ladder，pSB1A3-GFP，己，T-YerP1，T-YerP2，T-YerP3，T-YerP4，T-YerP5，T-YerP6，T-YerP7） 第19页左半部分不知道说什么 第20页最上面有个5号可能是电泳 9.4 1、transcribe T-sfp，T-YerP 9.5 1、PCR（5‘Homologous arm，3’Homologous arm，backbone，BioBricks site） 2、胶回收 3、Transcribe（T-sfp，Y-YerP，pVeg，positive control） 9.8 1、PCR 2、PCR:T-sfp 3、enzyme digestion（E、P），（PSB1C3-rfp plasmid） 4、胶回收 5、验证（ladder，5‘homologous arm，3‘homologous arm，bb，RFP construct） 9.9 1、electrophoresis: test pSB1C3-rfp回收plasmid及7.26PCR得YerP 2、Pfu扩增Biobrick sites及k位点 3、上样（1-6 6管PSB1C3-rfp, 7-8 7.26 YerP，PSB1A3-gfp质粒） 4、YerP平板取菌划线，菌落PCR 7、get plasmid→PSB1C3-rfp construct，PCR 9、electrophoresis: test product of PSB1C3-rfp 回收产物 10、凝胶回收（sfp-biobrick, pVeg） 9.9 1、胶回收 2、electrophoresis1（D2000, RFP1,RFP2,RFP3,Bsub2,Bsub3,Bsub4,Busb5,Bsub6） 3、electrophoresis（D2000, Biobrick，sfp，Pveg） 9.12 1、enzyme digestion（PSB1C3-rfp） 2、electrophoresis——胶回收 （左：ladder，bs，5‘homologous arm，3‘homologous arm，BioBricks site，pSB1C3） （右：ladder，YerP1，YerP2，YerP3，YerP4，pSB1C3） 3、test（ladder，pVeg-RBS，sfp-RBS，sfp-bb，A3，A4，A5，A6） 9.13 1、胶回收 2、PCR（pVeg-RBS，sfp-RBS，ext2） 3、7管PHT01酶切检测 4、第二轮RBS PCR体系 6、electrophoresis：胶回收产物回收（ladder，YerP1，YerP2，YerP3，YerP4，BioBricks site，Backbone，5‘ homologous arm，3‘ homologous arm，BioBricks site） PCR产物 1、 ladder-D2000 2、 pVg-RBS-ext 1 3、 pVg-RBS-ext 2 4、 sfp-RBS-ext 1 5、 sfp-RBS-ext 2 6、 PSB1C3回收 9.14 1、electrophoresis （ladder：1kb plus DNA） 2、pVeg-RBS-ext2 3、sfp-RBS-ext2 4、pHT01 1 5、pHT01 2 9.15 1、pfu: erP+BioBricks site PCR 2、加A 3、YerP 加A 4、electrophoresis（1kb ladder，YerP1 bio，YerP2 bio） 5、electrophoresis（ladder 1kb plus，pVeg-RBS 加A 回收，sfp-RBS 加A 回收，YerP1 回收，YerP2 回收，PSB1C-sfp，RFP3） 6、连接 9.17 1、transcribe: Bsub 2、transcribe: T-YerP 3、OEPCR1 9.18 1、枯草感受态检测——菌落数量 2、回收pVeg+sfp OEPCR 3、重叠PCR体系 9.20 1、OEPCR3 2、菌落PCR（psb1C3-AH） 3、菌PCR electrophoresis（ladder，YerP，sfp，GFP，negative control，positive control，6） 4、回收1000kb左右的pvg-sfp 5、回收OEPCR3 9.21 1、新backbone，BioBricks site用pfu和2017○34GP3 9.22 1、YerP PCR 2、胶回收 9.25 1、PCR：backbone，BioBricks site 9.26 1、OEPCR3 加A 2、electrophoresis（none，ladder D2000，BioBricks site，backbone） 9.27 1、electrophoresis: for testing the product of回收产物 First: 2-5道：T-YerP○5 1-4； 6-9道：T-YerP○4 1-4） Second:（2-5道：AH，1-4；6-7道：BioBricks site，Backbone） 2、transcribe pVeg-bfp 9.28 1、菌PCR（ladder D2000，T-YerP 10，T-YerP 11，T-YerP 9，T-YerP 5，T-YerP 4，T-YerP pvg-sfp，T-YerP粉，划线5，划线4） 9.30 1、菌液PCR 2、Gibson片段-pveg-sfp PCR） 3、electrophoresis（1，2，3，4，5，pveg sfp gibs，+，-） 10.9 1、回收Gib-（pveg-sfp） 2、enzyme digestion pVeg-sfp 3、ligate pSB1C3-pvg-sfp 10.10 1、electrophoresis（ladder，YerP1，YerP2，YerP3，YerP4，5‘ homologous arm，3‘ homologous arm，Gb，bb，BB） 10.11 1、electrophoresis（D2000，1，2，3，4，5，6，7，8，9，10） 2、electrophoresis（D2000，11，12，13，14，15，16，17，18） 10.16 1、electrophoresis（ladder D2000，OEPCR3） 2、transcribe（control，T-pveg sfp rbs，IDT’s ImrA） 3、electrophoresis testing（1kb plus，OEPCR 回收产物，5‘，3‘，pSB1C3切, p SB1C3） 10.18 1、PCR菌（○1pSB1A3-GFPpSB1C3-pTet-GFP丙丁戊阴○2psb-pvg-sfp连接产物，OEPCR，RFP3，P3FG） 10.19 1、菌PCR（○1ladder 2000，sfp，GFP，negative control，positive control，6）（D2000，psb-pvg-sfp连接产物，OEPCR，RFP3，P3FG） 10.21 1、PCR 2、enzyme digestion（psb1C3，RFP3，lmrA质粒，pvg-sfp） 3、electrophoresis（ladder 1kb plus，OEPCR3，ImrA1，ImrA2，D1，E1） 4、electrophoresis（ladder 1kb plus，A1，B1，C1） 10.22 1、37度恒温箱里（lmrA切1，2（E，P得PCR产物），超薄试剂盒纯化，验证 2、Ligate PSB1C3-lmrA 3、 Transcribe PSB1C3-pveg-sfp转化得平板 4、Gibson 6、gov electrophoresis（1kb plus marker，lmrA切1，2回收，lmrA2*2，lmrA3*2，pvg sfp*2，PSB1C3线性，pSB1C3） 3、菌PCR（D2000，浓pveg-sfp，OEPCR，阳） 4、菌PCR（D2000，YerP，sfp） 10.23 1、electrophoresis（D2000, ImrA2，lmrA2，lmrA3，lmrA4） 10.24 1、electrophoresis（ladder 1kb plus，lmrA2，lmrA3，lmrA4，1-1 pvg-rbs，2-1 pvg-rbs，2-3 pvg-rbs，1-2 pvg-rbs，1-3 pvg-rbs，RFP