Difference between revisions of "Team:NTNU Trondheim/Contribution"

Line 1: Line 1:
{{NTNU_Trondheim}}
+
<html lang="en">
<html>
+
<!--
 +
    Colours used:
 +
        white: #F5F5F5 (whitesmoke)
 +
        black: #101417
 +
        grey: #808080
 +
-->
 +
<head>
 +
    <meta charset="UTF-8">
 +
    <!--stylesheets etc -->
 +
    <link rel="stylesheet" type="text/css"
 +
          href="https://2017.igem.org/Template:NTNU_Trondheim/CSS/global?action=raw&ctype=text/css" />
 +
    <link rel="stylesheet" type="text/css"
 +
          href="https://2017.igem.org/Template:NTNU_Trondheim/CSS/footer?action=raw&ctype=text/css" />
 +
    <link rel="stylesheet" type="text/css"
 +
          href="https://2017.igem.org/Template:NTNU_Trondheim/CSS/menu?action=raw&ctype=text/css" />
 +
    <link rel="stylesheet" type="text/css"
 +
          href="https://2017.igem.org/Template:NTNU_Trondheim/CSS/content?action=raw&ctype=text/css" />
 +
    <link rel="stylesheet" type="text/css"
 +
          href="https://2017.igem.org/Template:NTNU_Trondheim/CSS/page_picture?action=raw&ctype=text/css" />
 +
    <link rel="stylesheet" type="text/css"
 +
          href="https://2017.igem.org/Template:NTNU_Trondheim/CSS/fix_code?action=raw&ctype=text/css" />
  
 +
    <script src="http://code.jquery.com/jquery-latest.min.js" type="text/javascript"></script>
  
<div class="column full_size">
+
    <script type="text/javascript" src="https://2017.igem.org/Template:NTNU_Trondheim/JS/picture_field_resize?action=raw&ctype=text/javascript"></script>
<h1>Contribution</h1>
+
</head>
<h3>Bronze Medal Criterion #4</h3>
+
<body>
<p><b>Standard Tracks:</b> Participate in the Interlab Measurement Study (to be documented on your InterLab page) and/or improve the characterization of an existing BioBrick Part or Device and enter this information on that part's Main Page in the Registry. The part that you are characterizing must NOT be from a 2017 part number range. Teams who are working on improving the characterization of an existing part should document their experimental design here, along with an explanation for why they chose that part to improve. Data can also be shown here, but it MUST also be documented on the part's Main Page in the Registry.
+
<div id="page_content_container">
<br><br>
+
    <div id="menu">
<b>Special Tracks:</b> Document at least one new substantial contribution to the iGEM community that showcases a project related to BioBricks. This contribution should be central to your project and equivalent in difficulty to making and submitting a BioBrick part.
+
        <div id='cssmenu'>
 
+
            <!-- Is ordered left to right! -->
</p>
+
            <ul>
</div>
+
                <li class='active'>
 +
                    <a href='https://2017.igem.org/Team:NTNU_Trondheim'>
 +
                        <div>
 +
  <span>
 +
    Home
 +
  </span>
 +
                        </div>
 +
                    </a>
 +
                </li>
 +
                <li>
 +
                    <a href='https://2017.igem.org/Team:NTNU_Trondheim/Safety'>
 +
                        <div>
 +
  <span>
 +
Safety
 +
  </span>
 +
                        </div>
 +
                    </a>
 +
                </li>
 +
                <li>
 +
                    <a href='https://2017.igem.org/Team:NTNU_Trondheim/Parts'>
 +
                        <div>
 +
  <span>
 +
Parts
 +
  </span>
 +
                        </div>
 +
                    </a>
 +
                </li>
 +
                <li class="has-sub">
 +
                    <div>
 +
                        <span>
 +
                            Project
 +
                        </span>
 +
                    </div>
 +
                    <ul>
 +
                        <li>
 +
                            <a href='https://2017.igem.org/Team:NTNU_Trondheim/Description'>
 +
                                <span>
 +
                                    Description
 +
                                </span>
 +
                            </a>
 +
                        </li>
 +
                        <li>
 +
                            <a href='https://2017.igem.org/Team:NTNU_Trondheim/Experiments'>
 +
                                <span>
 +
                                    Protocols
 +
                                </span>
 +
                            </a>
 +
                        </li>
 +
                        <li>
 +
                            <a href='https://2017.igem.org/Team:NTNU_Trondheim/Notebook'>
 +
                                <span>
 +
                                    Lab Journal
 +
                                </span>
 +
                            </a>
 +
                        </li>
 +
                        <li>
 +
                            <a href='https://2017.igem.org/Team:NTNU_Trondheim/Model'>
 +
                                <span>
 +
                                    Model
 +
                                </span>
 +
                            </a>
 +
                        </li>
 +
                        <li>
 +
                            <a href='https://2017.igem.org/Team:NTNU_Trondheim/Results'>
 +
                                <span>
 +
                                    Results
 +
                                </span>
 +
                            </a>
 +
                        </li>
 +
                        <li>
 +
                            <a href='https://2017.igem.org/Team:NTNU_Trondheim/Demonstrate'>
 +
                                <span>
 +
                                    Demonstrate
 +
                                </span>
 +
                            </a>
 +
                        </li>
 +
                    </ul>
 +
                </li>
 +
                <li class='has-sub'>
 +
                    <div>
 +
                        <span>
 +
                            Human practices
 +
                        </span>
 +
                    </div>
 +
                    <ul>
 +
                        <li>
 +
                            <a href='https://2017.igem.org/Team:NTNU_Trondheim/HP/Silver'>
 +
                                <span>
 +
                                    Human practice
 +
                                </span>
 +
                            </a>
 +
                        </li>
 +
                        <li>
 +
                            <a href='https://2017.igem.org/Team:NTNU_Trondheim/Engagement'>
 +
                                <span>
 +
                                    Public engagement
 +
                                </span>
 +
                            </a>
 +
                        </li>
 +
                    </ul>
 +
                </li>
 +
                <li class='has-sub'>
 +
                    <div>
 +
                        <span>
 +
                            People
 +
                        </span>
 +
                    </div>
 +
                    <ul>
 +
                        <li>
 +
                            <a href='https://2017.igem.org/Team:NTNU_Trondheim/Team'>
 +
                                <span>
 +
                                    Team
 +
                                </span>
 +
                            </a>
 +
                        </li>
 +
                        <li>
 +
                            <a href='https://2017.igem.org/Team:NTNU_Trondheim/Collaborations'>
 +
                                <span>
 +
                                    Collaborations
 +
                                </span>
 +
                            </a>
 +
                        </li>
 +
                        <li>
 +
                            <a href='#'>
 +
                                <span>
 +
                                    Attributions
 +
                                </span>
 +
                            </a>
 +
                        </li>
 +
                        <li>
 +
                            <a href='https://2017.igem.org/Team:NTNU_Trondheim/Contribution'>
 +
                                <span>
 +
                                    Contribution
 +
                                </span>
 +
                            </a>
 +
                        </li>
 +
                        <li>
 +
                            <a href='https://2017.igem.org/Team:NTNU_Trondheim/People/Sponsors'>
 +
                                <span>
 +
                                    Sponsors
 +
                                </span>
 +
                            </a>
 +
                        </li>
 +
                    </ul>
 +
                </li>
 +
                <li class='has-sub'>
 +
                    <div>
 +
                        <span>
 +
                            Awards
 +
                        </span>
 +
                    </div>
 +
                    <ul>
 +
                        <li>
 +
                            <a href='https://2017.igem.org/Team:NTNU_Trondheim/Achievements'>
 +
                                <span>
 +
                                    Achievements
 +
                                </span>
 +
                            </a>
 +
                        </li>
 +
                        <li>
 +
                            <a href='https://2017.igem.org/Team:NTNU_Trondheim/Applied_Design'>
 +
                                <span>
 +
                                    Applied Design
 +
                                </span>
 +
                            </a>
 +
                        </li>
 +
                        <li>
 +
                            <a href='https://2017.igem.org/Team:NTNU_Trondheim/Hardware'>
 +
                                <span>
 +
                                    Hardware
 +
                                </span>
 +
                            </a>
 +
                        </li>
 +
                    </ul>
 +
                </li>
 +
            </ul>
 +
        </div>
 +
    </div>
  
 +
    <div id="picture_field">
 +
        <div id="triangle_topright">
 +
            <img src="https://static.igem.org/mediawiki/2017/e/e6/T--NTNU_Trondheim--top_right_triangle.svg">
 +
        </div>
 +
        <div id="icon">
 +
            <img src="https://static.igem.org/mediawiki/2017/8/89/T--NTNU_Trondheim--logo_wo_background.svg">
 +
        </div>
 +
        <div id="triangle_topleft">
 +
            <img src="https://static.igem.org/mediawiki/2017/7/74/T--NTNU_Trondheim--top_left_triangle.svg">
 +
        </div>
 +
        <div id="slideshow_container">
 +
            <!-- example of slideshow of 1, ie. only a picture. If you wish to make slideshow again, remember to comment
 +
            back the slideshow.js script in the head section-->
 +
            <!-- dimensions 2:1 must be honored for ALL pictures added to slideshow -->
 +
            <img src="https://static.igem.org/mediawiki/2017/0/07/T--NTNU_Trondheim--Collaborations.jpg">
 +
        </div>
 +
    </div>
  
 +
    <div class="content">
 +
        <div class="break_header">
 +
            <img src="https://static.igem.org/mediawiki/2017/4/49/T--NTNU_Trondheim--splitter_header.svg">
 +
        </div>
  
 +
        <div class="paragraph_no_img">
 +
            <h1>Contribution</h1>
 +
            <p>
 +
                Our team has contributed to the iGEM Registry by improving the characterization of the
 +
                biobrick <a href="http://partsregistry.org/Part:BBa_K325909">BBa_K325909</a> designed by team Cambridge
 +
                in 2010. The biobrick is an operon consisting of Lux C, D, A, B, E under the arabinose-induced promoter
 +
                <a href="http://partsregistry.org/Part:BBa_I0500">pBAD</a>. The biobrick has shown to cause light output
 +
                in transformed <i>Escherichia coli</i> Top10 cells. Our team chose to improve the characterization of this
 +
                biobrick as we originally wanted to use the lux operon as a reporter for our arabinose-inducible system.
 +
                In this way we could test how the expression from the pBAD promoter was dependent on arabinose concentration.
 +
                By looking at how luciferase luminescence from the lux operon developed with time after induction by arabinose,
 +
                we established that a temperature of 29 °C was optimal. Details about our experiments and results are found
 +
                on <a href="http://partsregistry.org/Part:BBa_K325909">the main page of the biobrick</a> in the iGEM Registry.
 +
            </p>
 +
        </div>
  
  
 +
        <div class="footer">
 +
            <img src="https://static.igem.org/mediawiki/2017/7/7c/T--NTNU_Trondheim--splitter_footer.svg">
 +
            <div class="footer_content">
 +
                <div class="sponsors">
 +
                    <a href="https://www.ntnu.edu/nv" target="_blank">
 +
                        <img src="https://static.igem.org/mediawiki/2017/e/e1/T--NTNU_Trondheim--Faculty_logo_black.png">
 +
                    </a>
 +
<a href="http://www.ntnu.edu/ibt" target="_blank">
 +
                        <img src="https://static.igem.org/mediawiki/2017/8/83/T--NTNU_Trondheim--Instituttlogo_english_white.png">
 +
                    </a>
 +
                    <a href="http://aquagen.no/en/" target="_blank">
 +
                        <img src="https://static.igem.org/mediawiki/2017/2/27/T--NTNU_Trondheim--AquaGen_forslag1_transparent.png">
 +
                    </a>
 +
                    <a href="http://www.biokjemisk.no/" target="_blank">
 +
                        <img src="https://static.igem.org/mediawiki/2017/f/f4/T--NTNU_Trondheim--NBS_forslag1_transparent.png">
 +
                    </a>
 +
                    <a href="http://www.imr.no/en" target="_blank">
 +
                        <img src="https://static.igem.org/mediawiki/2017/e/e4/T--NTNU_Trondheim--Havforskningsinstituttet_white.png">
 +
                    </a>
 +
<a href="http://www.vectronbiosolutions.com/" target="_blank">
 +
                        <img src="https://static.igem.org/mediawiki/2017/8/86/T--NTNU_Trondheim--Vectron_forslag1_transparent.png">
 +
                    </a>
 +
<a href="http://digitallifenorway.org/gb/" target="_blank">
 +
                        <img src="https://static.igem.org/mediawiki/2017/d/da/T--NTNU_Trondheim--SDL_LOGO_ENG_confirmed_version2.png">
 +
                    </a>
 +
                    <a href="https://www.skretting.com/en-us/" target="_blank">
 +
                        <img src="https://static.igem.org/mediawiki/2017/4/4d/T--NTNU_Trondheim--Skretting_logo_black.png">
 +
                    </a>
 +
</div>
 +
                <div class="sosial_media">
 +
                    <a href="mailto:igem-team@ntnu.no" >
 +
                        <img src="https://static.igem.org/mediawiki/2017/5/5a/T--NTNU_Trondheim--mail.png">
 +
                    </a>
 +
                    <a href="http://www.facebook.com/igemntnu2017/" target="_blank">
 +
                        <img src="https://static.igem.org/mediawiki/2017/8/8b/T--NTNU_Trondheim--facebook.png">
 +
                    </a>
 +
                    <a href="http://twitter.com/ntnuigem?lang=en/" target="_blank">
 +
                        <img src="https://static.igem.org/mediawiki/2017/8/8b/T--NTNU_Trondheim--twitter.png">
 +
                    </a>
 +
                    <a href="http://www.instagram.com/ntnu_igem/" target="_blank">
 +
                        <img src="https://static.igem.org/mediawiki/2017/6/64/T--NTNU_Trondheim--instagram.png">
 +
                    </a>
 +
                    <p>
 +
                        Email: igem-team@ntnu.no
 +
                    </p>
 +
                </div>
 +
            </div>
 +
        </div>
 +
    </div>
  
 +
</div>
 +
</body>
 
</html>
 
</html>

Revision as of 19:39, 1 November 2017

Contribution

Our team has contributed to the iGEM Registry by improving the characterization of the biobrick BBa_K325909 designed by team Cambridge in 2010. The biobrick is an operon consisting of Lux C, D, A, B, E under the arabinose-induced promoter pBAD. The biobrick has shown to cause light output in transformed Escherichia coli Top10 cells. Our team chose to improve the characterization of this biobrick as we originally wanted to use the lux operon as a reporter for our arabinose-inducible system. In this way we could test how the expression from the pBAD promoter was dependent on arabinose concentration. By looking at how luciferase luminescence from the lux operon developed with time after induction by arabinose, we established that a temperature of 29 °C was optimal. Details about our experiments and results are found on the main page of the biobrick in the iGEM Registry.